LOC574837 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (9)

Interactants (0)

ECB-GENEPAGE-23145833

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for LOC574837 - All

Models - Gene (3)

Models - mRNA (1)

mRNAs (5)

ESTs (0)

Models - Gene (3)

Source	Version	Model	Species
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purpuratus
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NCBI_REFSEQ/JGI	3.1	LOC574837 >LOC574837 CAAAGTCCAATGTTTGGTTTACAAGCTCTTTCATGTAATGTCTAGGACTATATTGATATTTCGTATTTGTATGGAATATGGTTATCTGTGCATAGAGCTACCATACGTATGTCTCCTGTATAATAAATGCATGTCATTTGTACACCTATGCTAGGCCTTTTGATTGGACTACAAACTAATTGTTGTTGCGCTAATAATAAATAGGTTACTGAAGTTGGAAAGTTTTTGTTGTTCCTGGTCCTGGACGTACATTCCCAACAAGCAGTACTCCGTGGAGATCACGTCCGTGATATTGGAAATCACAAATGGCATCGTCGGGCAAGCTACCAGACATGTCTGGGTACTGGAAGCTGAAGAAAAACGACGAAAACTTTGAGAAGTATCTTCAAGCCAATGGAATAAACTTCGTCCTTAGGAAGGTTATAAAATCGGCCACCATGTACCAAGATATTGAACAGGATGGAAATCAGTTCAAGATCAAGATCATGTGAGTAACACACATCATATCTAAATTCAATCTTCACCAAAATTTCCCCAAAATGGTCTTCAGAGTTTTAAATCCCTTACAAGGGTTTACAAATAAACTGGAAACAGACAACATTTAAATTTGCTGACAGAGGTTTCATGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACTTCGTGAACGGAGGGATACCATGCGTGTTACCAAAATGTCCGGTACAAAAACGACTTTACACACCGGACTTAGAGGGTGTTTTCAAAAGGAGGGAACATGCATATCCGTACACTAAATAACACTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGGGGGTTCAGGTTTAATTCTGACAAAATACAGAAGTCTAACCAAACTCTAAACATGATAGATTTGTATAAACATAATACAATTAGTGGCGCCTCTGACTAATCTCAAATCTAATTCGGACAAACTTGTTTAATTTAGGTGAAAATGTCAAAACTTGTGAAAGGGCCCAAATGTTGTAAAACATCATAATTGAAAAATTCATATGAGTATGGAGGAAAAATATTAATTATTAGCAGAAATAAAGTAATTTTTCTTTTCAAATTTAAATTTCGCACCTGACAGTGTTTTATTTACCCCGTTTGTTGTGTACAAAATTAGGGCTTCAATTTAAACTCATAGAACAAAAAAACACATGCGGTCTCTTGATCACAAATTTTGCACGTACTTTCATAAACCCATCTTGATTGATTGATTGATTGATTTTTATTCGACAAGCTTCCAACATACAACAATATTCAATAATAACAGATCAAAAATAAGTCAGCTTGAACAGGATAACCCACGAAAGCTCGAGAGCTTATTTCCAGTGGGGTCCCTTACAGACATGTATAACATTAATAAGTTAAAATAGTAATATTTACAAACAGATAAGAAAATTTAAAGAACTACTTATTAAAGATAATAATAATAGTAACAACATTAAACTGATGATAGAAATGATATTAAGTACAAGAAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAAAAAGAGGAGAAGGAAGAAGAGGAAAATAATGATCAATTTGTAGAATTTCTATAACGTACGAAAACATAAGTATTTACAACATGAAAAAGTATGAACCGACAGAAGAATAACAATTTTAATCATATAACATGTCATTCACTTCTGTTCTCTGACTGTCAAGTATTAGGTATTCCTTTAATTTCCTCTTAAAATGATCATAGTTTCCTATTTCTTACTGCTACACATAAACTTTGAGATAAGTTTTAGAGCACTTGCAAATCCCTGATAAGGGCATTAAACCAAGTAGATTTACAAAGATCGTCAAAACATTAACTTAAGCTCTGTGTAATATCTTCCACTTCCAAAGTCAAATTATGTTGAATTTTCTTGTAAACGCATGACAAAATCAATACTTGCAAACTTATTGATGTTAAGGGAGATGGGCACCTCCCACTTATCCAATTCCATTCAGTACTATTCCTTTGGACCTACTCGCTCATTTTCGACACGTGTATATATTATTTCTCCTTCTTTTGTTGTTTCATTTCTGTCGTGGGTTTATAATTTTTGTGGGTTAAGATTATGCGTAACCACTAAATCTCCTATATTTTTTCTTTGAAGTTACTCTCTTTGAATGTATAAGTGATACTTAGTCGGAAGTAAAGACGTACTTGAGAAAAGGAGACGACGTTTTAAAAGACTAGTACTAGCAGACTATATCGAATTATAACCTGGATAGTCACTATTTTTGTGGTGTACAAAGACCAATCGTGCTATTGTTTTAATCCAACCTCAACTTGACTGTGATTCCGGTAGAAACCATATTTCGTATCATATGCATGTTCAAGTTTACACATATGCCTACATCAAGAGCAAGAGTACAATGTATTTGTTTTGGCAAAGTGAAAGAAGGCTGCAAAGCAATCAGTTAGCTAGAAGCTTAGGCAGTATAATGAATGTCAGTTTAAGTTAATTTGTTCAATGATATACTGTAACGGAAAAGTTGTATGAATTTATATTCATTTACATGGAAAGGTAATTTTTAAATAAAATGATAAGGAAACTAATGAATTCACTCAATGCAATTTAACGATTGTATAACAACAAAGCAAACTACCCGATGATGGCAATCACTTCCACTTGACGATATGCTAGCAAAGTCTGCAACCCTACTATGAACTATGTATTGATATCACTATGTTCACTTTGATGTGTTTTCCATATGTATTGTAATTTGTAGGTTTATTTGCACTTTTTTGTTTTGTTTTATGTAATTGTTTATCAGTCTATTTTGTGTGTTTAAGCGCTTAGAGACTTTGGTGGTAAGCGCTTTTTAAGTAACTTTTTTATTATTATTATTATTATCAATACACAATTGTGGCAGCGTATTCTCGCTGGTGACTTGGCCAAGAGCGGTGATCTCATGAGGGATGGGGGGGGGGGGGGGACACGTCCCCTCTACTGAAATTTTCTCTCCGGTCATTGCATGGAATGGTTGCCCCTGCTAATGAACAAAATCATGCATGAAATACTGTACATAATAGTGTAGATGATGACTTGTCTCTTGCAGTTTGCCGGTTGGCCAACAAGAAATGGAATTCACAGTCGGTGAAGCGTTTGAGACGTACAATAGCTTCCGCAAGGTTACCCTGCACAGAATAGCAACGTAAGATTGGCTTTATATCATCATTTATGGCTTACACCCAGTAAATAAGATCGAATGATCGATCTGTATTGAAAAACAAGTCAGAACAAACCTTGGAACCGGAAGAATTTTATTTTTAAACATTTATCTTTTCTTGCGATGTTCAATGGACATTTCTTCCCCAAACATGTGATGTATTTTAAGATTACATGTTTGGGATGAAATCTGCCTTGCATACAGTTTATATATATAATGGTACAATTTAGCTGATCCTCGGAAAGGCGCTTGGATCATCATGAAAACAACATTTGATGTTTGAAACAAATTGAATACGTCAATAAAGTTTGTTTTTATGTCTCAAAATCTTTGTATTTGCTTACAAAATAATGAATCAGCATGTATCTATAGGCATATATATCTTTAGCTTTTGACTTATCTCTGATCCTTGTTTATCCATCTAATTATCCATCCGTACACAAATCAAATTCAAAGTTTTATGTATCCAATAGGAAACCTTTTATGTTAGACAATGCCACGACTGAAATATTGATACGCAATACTCAATTATTTCGGTTAAAATTCTCTATCAGGTATTAACTTCAGCGATTATTTTTGTTTGTTCTTTCTTCTCTTTTTAACAGTTGGGACGGACAGGCAATGGTATTGAAGTCAGCTAACTCTGGTGATAATGAACCGGAAGAGAAACGTGAGCTCGTAGATGGTGCGTTGTGTATCACAATGACTAAAGGTGACGTCTCAACCAAGAGAATTTTTGAGAAGGCAGAGAAAAAATAAGATACCGTTAAAAGCTGGTTGCTTGTTTGTGAGGTTGCAAGTTTTGAATTAAAGGAGAACTTTGACAAAAGATTATTTTTCTTG	S. purpuratus

Models - mRNA (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_030998423.1 >XM_030998423.1 GAAGACCGGCTACCTTTATATGAGAACACACATGTCCTGTAGTCTAATAGTAGTAGCTAATGAGAGAGGGAGTGTAATATACTGCGAGTCATCGTCTGCTCTGAACGAGAATATTGTATGATTGGTCAGTGTGGAACTCCAGTAGTTTTACCATCCTACAAAAACTGTGACCGTGGTGTTTTTAAGCTCGTGTGATAACTGGATCCCGTCATCACACACATTGAATTATAATTAATATATCAGTCCATCGAGCTCAACCTCCAACAGCCATGGCCAAGGTCAACTTCGAAGGTAAATGGAAGCACACTAAAGACGAGAAGTTTGACGATCTCCTTAAGGCTCTAGGTGTCAACATACTCAAGAGAAAAGCCATCACCTCCCTGTCACCCCAGCAGGAGATCACCCAAAATGGAGACCACTTCGTCGTCACTAATAAGACATCGATCAAGACAGAGACACTGGAGTTTACTGTAGGCCAAGAGTTCAAGTTCAAGAATCCTATCTCGGGGAAAGATGAGATGCTGATGACTGAGTGGGACGGTGATAAGATAGTTATCACGAACAAGGCAGACCCGAATGGAGTTGTAGCAACGAGAGAACTGATAGATGCCAATCATATGACGATAACACAAAGGAAAGGTGACGTCACAGCCGTCAGACATTTCAACAAAGTATATTGGAAATCACAAATGGCATCGTCGGGCGTGCTACCAGACATGTCTGGGTACTGGAAGCTGAAGAAAAACGACGAAAACTTTGAGAAGTATCTTCAAGCCAATGGAATAAACTTCGTCCTTAGGAAGGTTATAAAATCGGCCACCATGTACCAAGATATTGAACAGGATGGAAATCAGTTCAAGATCAAGATCATTTTGCCGGTTGGCCAACAAGAAATGGAATTCACAGTCGGTGAAGCTTTTGAGACGTACAATAGCTTCCGCAAGGTTACCCTGCACAGAATAGCAACTTGGGACGGACAGGCAATGGTATTGAAGTCAGCTAACTCTGGTGATAATGAACCGGAAGAGAAACGTGAGCTCGTAGATGGTGCGTTGTGTATCACAATGACTAAAGGTGACGTCTCAACCAAGAGAATTTTTGAGAAGGCAGAGAAAAAATAAGATACCGTTAAAAGCTGGTTGCTTGTTTGTGAGGTTGCAAGTTTTGAATTAAAGGAGAACTTTGACAAAAGATTATTTTTCTTGAGATATCATACATTCTTTACAAATTGAGTTACCACTTGGTTTCGGGCCAATGCATGTCATATTGATTGCATTATACATGTATGAAACGAGGTATATCAAAATAATTATGGTTAAAGGCGAATTTCCCTTGTTTTTCTGTGTAAAAATTATACGATCTCTCACACCCTACTTACCCTTCCGAATCCTATCGTTCT	S. purpuratus

mRNAs (5)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_041611735 >XM_041611735\|>XM_041611735.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus cellular retinoic acid-binding protein 1-like (LOC121418033), mRNA TCTTGACCTAATCCGGTGAGAGATCTGTTAGTACCTGGAGATAGTGAGTTTGTTATTGTGGAATCGTTAT GGCATCTTCTGACGAGCTACCAAATTTCTCTGGTTATTGGAAGCTGACCAAAAATGATGAAAATTTTGAG AAGTATCTTCAAGCCAATGGAGTGAACTTCATGTTAAGGAAGGTCATCAAATCTGCCACTGTGTATCAAG ACATCGAACAGGATGGTGATCAATTCAAGATCAAGATCATATTGCCGGTTGCTACTCAAGAATTGTCATT CACAGTAGGTGAAGCTTTCGAGACCTACAATAGCTTCCGGAAAGTGACCTTAAAAAGAATAGCAAACTGG GATGGGCAAGCATTAATCATCAAGTCATCTGACCCTGCATCAGATGAACCGGAAGAAAAACGTGAGCTCG AAGATGGATTCCTGTACCTTACTCTGACTAAAGGGGACGTTACAACTAAGAGAACTTTTGAAAAGGCAGT TAAAAAATAACTTTGACCTGTATAAGGTATTACAAATGGCTGCAATATAAATAAAGTTACGAGACTTAAT GAAATAAAAGACCTGTACATTTTTTCAGAAATAACATTGTCTTGAATAAGACATAAAAGTCTGATTAATT AATAAATGCTCATAAAAACAGTACCATCAAGATTTGAATGAGAATCAAGGCATTTGGAATATTAATCATC TAATCAATCTATCCTCTCCCTTATAAAGGTAATGCTTTGATCAGAATAACATGGTGAAAATGTTAGCAGT CTTATTGAAAATCAAGTTAATTAGGAGCTAAGCTCGAGTGAGCAACTTACGCCAACTTCAAAAAAGAATT CCAACTTTTACGTTTAATGTTCTATCAACTATATATTTTAGAATTTCTTGCGCGATGACATGATAAAATG AATGAATTTATGGAGCTTACATCATTCTCTGTCAATGTTCATATGGCGAAATGTGTGAGAAAACAAGCGA TGAGGATCAACAACAGAAAAAGGTGCGAGAGAAAACGAATTCGTAAAAATAAGTTCAAGAAAATACATGA CACTTAATTTGGGCCAGGGGCGGCGGAACGTATTTCCGTGGGGGGAGGGGGACAAAGCCAAAGAGAATAT CATCTGTGTGAAGAAGTGTGTTTTGTAGTGATTATGTTGAGCAAAGTTTTTCTGATTGATAAGACATATT ACACGAGTAAGAAATGTGTGCTATTCAAACCTGAAAACTGGACATTCCATACCTTAAACAATTATTGATG CGAAGCGCGAGCCAAAAATTTTGAGATTTTCTAACCTAAAATGTAT	L. variegatus
	JT109189 >JT109189\|>JT109189.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.2927.0 mRNA sequence CACAACTTCACAGTTTACCCCTATAAATAAGGTAATTACCATAATAAAAGATCGCTTACGTGAGGAGCGG GTTATTTCAATTGAAGAGCAAACACAAGAAGGGTGTATTTGGCATCATGTTGACAAAGGTCTAGGCTATA AGAAGACCGGCTACCTTTATATGAGAACACACATGTCCTGTAGTCTAATAGTAGTAGCTGATGAGAGAGG GAGTGTAATATACTGCGAGTCATCGTCTGCTCTGAACGAGAATATTGTATGATTGGTCAGTGTGGAACTC CAGTAGTTTTACCATCCTACAAAAACTGTGACCGTGGTGTTTTTAAGCTCGTGTGATAACTGGATCCCGT CATCACACACATTGAATTATAATTAACGTATCAGTCCATCGAGCTCAACCTCCAACAGCCATGGCCAAGG TCAACTTCGAAGGTAAATGGAAGCACACTAAAGACGAGAAGTTTGACGATCTCCTTAAGGCTCTAGGTGT CAACATACTCAAGAGAAAAGCCATCACCTCCCTGTCACCCCAGCAGGAGATCACCCAAAATGGAGACCAC TTCGTCGTCACTAATAAGACATCGATCAAGACAGAGACACTGGAGTTTACTGTAGGCCAAGAGTTCAAGT TCAAGAATCCTCTCTCGGGGAAAGATGAGATGCTGATGACTGAGTGGGACGGTGATAAGATAGTTATCAC GAACAAGGCAGACCCGAATGGAGTTGTAGCAACGAGAGAATTGATAAATGCCAATCATATGACGATAACA CAAAGAAAAGGTGACGTCACAGCCGTCAGACATTTCAACAAAGTATGATGTGGATAGTTAACACTCGTCT GTTAAATTTGTCAACCCCCTTTTACCGTGTTTTATGTATTTAATTATGAAAATAGTACCGTGATATTTAA ATGGAATATGGAATCATTATTATTTTATTTAAAAAAATAGTTTATGGACCTAATTCCTTTAACTAATTTT TCTAGCTGCAAATGGATGATTACATATTTGTACTAAAGTAACCCATTCTTTCGATAAGCAATAATAGAGA AAGAAACATTAACGAATGTACATGCCGTTACAATAGCACATCCATGTGAATTTACGGTCAATATTGCAAA AAGACCTGTTCCCAATAACAAGTTAAAATTGTTTATATTAGCTACTAAAATTGGTTTTTGATTGACTGCA GGAAACTTCTCCGAAACGTGTGATAGCTTGTATGTATAACCAATAAGTTTATAAAACATTGCCTGGATGA GGAATAATTGTTTTCGGGCCTGATCATTAATCTACATTTGCCACTCAGTACCCCAGAGAGAAATGGGGAC CCGGTAGGATGACGAAAGCATTTGTGTTTAGTTGACGGTGGCCATATGGTAAGAATACTCCCCAGGGAGT GGAAACGGTGCACATTTAGCGTGAATGAATCCGACGACTGGGGTAATAATAATCTGTAAAGCTCTTAGAG ACGGTACTCCGTATTAAGCGCTATGTAAATCCAGATTATTACTTTTATTATCGTGCCGTATGAATATTAC TTTTCAAGAGTGATTTAAATTGTGACCATTGTGACATTTGACATTCCATATGAAAATCATTCCAATCTAA TGTATTGACAAATTTACAAGCAGCATCTATATCATAATCAATGTACATTATTTGAACTATTGACTTGATT TACAATATCTTAAAGTAGAAGATACGTAGGCGTGGGTGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGGGAGAGAGAGAG GGGGAGAGGAAGAAGGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG AAAGAGAGAGCGCACAATGGAGATGCGACATTTGACGTTTGTATGTTTAATTAACCAAATCATTTTTTGA TGCAATAAACATGTTCTACAGTTACGACAGAATTTGAT	S. purpuratus
	GHFM01025982 >GHFM01025982\| -	S. purpuratus
	XM_030998423 >XM_030998423\|>XM_030998423.1 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus uncharacterized LOC574837 (LOC574837), mRNA GAAGACCGGCTACCTTTATATGAGAACACACATGTCCTGTAGTCTAATAGTAGTAGCTAATGAGAGAGGG AGTGTAATATACTGCGAGTCATCGTCTGCTCTGAACGAGAATATTGTATGATTGGTCAGTGTGGAACTCC AGTAGTTTTACCATCCTACAAAAACTGTGACCGTGGTGTTTTTAAGCTCGTGTGATAACTGGATCCCGTC ATCACACACATTGAATTATAATTAATATATCAGTCCATCGAGCTCAACCTCCAACAGCCATGGCCAAGGT CAACTTCGAAGGTAAATGGAAGCACACTAAAGACGAGAAGTTTGACGATCTCCTTAAGGCTCTAGGTGTC AACATACTCAAGAGAAAAGCCATCACCTCCCTGTCACCCCAGCAGGAGATCACCCAAAATGGAGACCACT TCGTCGTCACTAATAAGACATCGATCAAGACAGAGACACTGGAGTTTACTGTAGGCCAAGAGTTCAAGTT CAAGAATCCTATCTCGGGGAAAGATGAGATGCTGATGACTGAGTGGGACGGTGATAAGATAGTTATCACG AACAAGGCAGACCCGAATGGAGTTGTAGCAACGAGAGAACTGATAGATGCCAATCATATGACGATAACAC AAAGGAAAGGTGACGTCACAGCCGTCAGACATTTCAACAAAGTATATTGGAAATCACAAATGGCATCGTC GGGCGTGCTACCAGACATGTCTGGGTACTGGAAGCTGAAGAAAAACGACGAAAACTTTGAGAAGTATCTT CAAGCCAATGGAATAAACTTCGTCCTTAGGAAGGTTATAAAATCGGCCACCATGTACCAAGATATTGAAC AGGATGGAAATCAGTTCAAGATCAAGATCATTTTGCCGGTTGGCCAACAAGAAATGGAATTCACAGTCGG TGAAGCTTTTGAGACGTACAATAGCTTCCGCAAGGTTACCCTGCACAGAATAGCAACTTGGGACGGACAG GCAATGGTATTGAAGTCAGCTAACTCTGGTGATAATGAACCGGAAGAGAAACGTGAGCTCGTAGATGGTG CGTTGTGTATCACAATGACTAAAGGTGACGTCTCAACCAAGAGAATTTTTGAGAAGGCAGAGAAAAAATA AGATACCGTTAAAAGCTGGTTGCTTGTTTGTGAGGTTGCAAGTTTTGAATTAAAGGAGAACTTTGACAAA AGATTATTTTTCTTGAGATATCATACATTCTTTACAAATTGAGTTACCACTTGGTTTCGGGCCAATGCAT GTCATATTGATTGCATTATACATGTATGAAACGAGGTATATCAAAATAATTATGGTTAAAGGCGAATTTC CCTTGTTTTTCTGTGTAAAAATTATACGATCTCTCACACCCTACTTACCCTTCCGAATCCTATCGTTCT	S. purpuratus
	JT099557 >JT099557\|>JT099557.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.2845.0 mRNA sequence CAAAGTCCAATGTTTGGTTTACAAGCTCTTTCATGTAATGTCTAGGACTATATTGATATTTCGTATTTGT ATGGAATATGGTTATCTGTGCATAGAGCTACCATACGTATGTCTCCTGTATAATAAATGCATGTCATTTG TACACCTATGCTAGGCCTTTTGATTGGACTACAAACTAATTGTTGTTGCGCTAATAATAAATAGGTTACT GAAGTTGGAAAGTTTTTGTTGTTCCTGGTCCTGGACGTACATTCCCAACAAGCAGTACTCCGTGGAGATC ACGTCCGTGATATTGGAAATCACAAATGGCATCGTCGGGCAAGCTACCAGACATGTCTGGGTACTGGAAG CTGAAGAAAAACGACGAAAACTTTGAGAAGTATCTTCAAGCCAATGGAATAAACTTCGTCCTTAGGAAGG TTATAAAATCGGCCACCATGTACCAAGATATTGAACAGGATGGAAATCAGTTCAAGATCAAGATCATTTT GCCGGTTGGCCAACAAGAAATGGAATTCACAGTCGGTGAAGCGTTTGAGACGTACAATAGCTTCCGCAAG GTTACCCTGCACAGAATAGCAACTTGGGACGGACAGGCAATGGTATTGAAGTCAGCTAACTCTGGTGATA ATGAACCGGAAGAGAAACGTGAGCTCGTAGATGGTGCGTTGTGTATCACAATGACTAAAGGTGACGTCTC AACCAAGAGAATTTTTGAGAAGGCAGAGAAAAAATAAGATACCGTTAAAAGCTGGTTGCTTGTTTGTGAG GTTGCAAGTTTTGAATTAAAGGAGAACTTTGACAAAAGATTATTTTTCTTG	S. purpuratus

ESTs (0)