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Echinobase

Summary Attributions Wiki
ECB-CRE-26397511
CRE Name: CRE104
Synonyms: Endo16_All, endo16 module GFEDCBA
Nearby Gene: endo16
Derived from: S. purpuratus

Sequence:



Nearby Gene S. purpuratus
Identities 1910/1910
genome
CRE
 
5' ACCCTCCGCTCTTGATGAGGGGGGTAAAGTTACACCCCTTTGTCTTTGATAGCACAATCCAAAACTCAAACAGTTTAACCTGGGATGCGATAACTTTGAAATGATGTAATCTCTTGGTAGCTTGATCACTTAATCCTCCGCGATGATAATGGCGTGATCATTTTGGTCAATATTTTTGAGACGTTGCGATTTACGACGTTCTTAGAAGTAAGGGCGATTTAAGAGGAATTACGCTTTTGTTACATGGTTTGATGAAGTTTAATGCATTTGTCAGATGTTTGTGTTTACGGGCATTAAATCTTTCGTGGAAACAAAGAACGTTCAGTTCCAGGTATATTCGGGGTTTTATCTCATCGGAATCGACTGAAAAACATCCGAAATTAATTTGAAAAACCAACAAAGTTAAAGTCTTTATTCATGATAACGTTTCTGAATTAGAAGTGCCCTCTTCATTTGTTATTTGATATACAAAAACAACCCCGAATTGGAAATCCAAACCCTTCTCCATAAGCCACGTTTTGAGTGTGAGTGTACATTAGTGTACCAGGAGCCAGTATACCAATACCTGTTACCTACTCCAAAATATGTTCCTGTAACTAAAACATCAATTTTCTTCTGTTATCACACACAGTTTAGAGAAAACCAAAGACTTAAAACATATCTTATTCATGCTTTAACCCGATCCGCCGTCTGCACTACACTTAGCAACCAAAGCTGGCTGTTTATGTCGGTAAAACAAGGCTAGACATGTTCCTTTGAAGAAATTTGATAGATAACAGTGTGCAAAGTGCGTCCACATTATCGTGTATAAGCATTGTATTCAACAAGACTCCGTATCGAGATACTATCTGTTCCTAATACTATTCATACTTATTATTTCGTCATAATAAGACTTTTTTTGGAGGGAGGATCAACGACTCGAAAGGAAGGAAGAGGAGGGGCGGTCGTCTACTTTACGCGCAATGACATTTTATCAAAAGTTACGGTTTGGTCATTGATAAAATCATCCCAGCAGTGCCCAATATCATGACAGTAATTCAGAAGGTTTAGGTTACATTCATATGATAACTTTAAAGCCCCTTTGAAGCGTTGGGAGCCCCATACATTTGACGACAACATTTTCCTTAAATAAAATTGTATCATAATGTATTAGGAGGATGTGATTAGAGACACATTTCTGCAAGGAATGTGTTCGAAGTCGAATATTTGTGAAGGAATACGACATTTAGGTTTTCTGCGTACAACAGAAAACCCAAATTATGTATTCTTTTTATCAATATTTGAGAGGGGGAAAGAGAAAAGTGGGAAAGAGAAAATGGGGAAGGAGATATATACTTAGAGAGTGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGACACACACACACACACACACGCACACACACGCACACACACGCACGCACACACACATACACACACCCACACACACATAGAGACAGATATACAGAGAGATATAGAGCAGGAGAGAGAGAGAGAGATCGAGTCTGGGTGAAGGAAAAATAAAGAGGGAGTGCGAACTGGGTCAGTGTAAGAAAAAAGAGTGAGATACAGAAACAGAAACAGAGGAAGGTGTAAATGGAAACGAGGGAGAGAGAGAGAGGATAAAGAAAATGATATATGTACAAAGGGGAAAAGGAGAAGACGAAGAAGAAGAAGACGAAGAAGAAGAAATAGGGAGTGAGAGGGGAGCAGATGGGGGGGGGGGGGCAAGGTGGATATTAGAACAAGAGCTTGTGCAAATCTTGATGCAATATCTTTATCCCCATGTTAAAATCACCATCCCCCGGTACCGCAAAATATGAAGCAAAAATGTCATCATATATTATAAATTAATGTCACGATATCCGATATACAAAACTGCGTAACAAGGGAAATTAGGTCACCGACCCA 3'
   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' TGGGAGGCGAGAACTACTCCCCCCATTTCAATGTGGGGAAACAGAAACTATCGTGTTAGGTTTTGAGTTTGTCAAATTGGACCCTACGCTATTGAAACTTTACTACATTAGAGAACCATCGAACTAGTGAATTAGGAGGCGCTACTATTACCGCACTAGTAAAACCAGTTATAAAAACTCTGCAACGCTAAATGCTGCAAGAATCTTCATTCCCGCTAAATTCTCCTTAATGCGAAAACAATGTACCAAACTACTTCAAATTACGTAAACAGTCTACAAACACAAATGCCCGTAATTTAGAAAGCACCTTTGTTTCTTGCAAGTCAAGGTCCATATAAGCCCCAAAATAGAGTAGCCTTAGCTGACTTTTTGTAGGCTTTAATTAAACTTTTTGGTTGTTTCAATTTCAGAAATAAGTACTATTGCAAAGACTTAATCTTCACGGGAGAAGTAAACAATAAACTATATGTTTTTGTTGGGGCTTAACCTTTAGGTTTGGGAAGAGGTATTCGGTGCAAAACTCACACTCACATGTAATCACATGGTCCTCGGTCATATGGTTATGGACAATGGATGAGGTTTTATACAAGGACATTGATTTTGTAGTTAAAAGAAGACAATAGTGTGTGTCAAATCTCTTTTGGTTTCTGAATTTTGTATAGAATAAGTACGAAATTGGGCTAGGCGGCAGACGTGATGTGAATCGTTGGTTTCGACCGACAAATACAGCCATTTTGTTCCGATCTGTACAAGGAAACTTCTTTAAACTATCTATTGTCACACGTTTCACGCAGGTGTAATAGCACATATTCGTAACATAAGTTGTTCTGAGGCATAGCTCTATGATAGACAAGGATTATGATAAGTATGAATAATAAAGCAGTATTATTCTGAAAAAAACCTCCCTCCTAGTTGCTGAGCTTTCCTTCCTTCTCCTCCCCGCCAGCAGATGAAATGCGCGTTACTGTAAAATAGTTTTCAATGCCAAACCAGTAACTATTTTAGTAGGGTCGTCACGGGTTATAGTACTGTCATTAAGTCTTCCAAATCCAATGTAAGTATACTATTGAAATTTCGGGGAAACTTCGCAACCCTCGGGGTATGTAAACTGCTGTTGTAAAAGGAATTTATTTTAACATAGTATTACATAATCCTCCTACACTAATCTCTGTGTAAAGACGTTCCTTACACAAGCTTCAGCTTATAAACACTTCCTTATGCTGTAAATCCAAAAGACGCATGTTGTCTTTTGGGTTTAATACATAAGAAAAATAGTTATAAACTCTCCCCCTTTCTCTTTTCACCCTTTCTCTTTTACCCCTTCCTCTATATATGAATCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGTGCGTGTGTGTGTATGTGTGTGGGTGTGTGTGTATCTCTGTCTATATGTCTCTCTATATCTCGTCCTCTCTCTCTCTCTCTAGCTCAGACCCACTTCCTTTTTATTTCTCCCTCACGCTTGACCCAGTCACATTCTTTTTTCTCACTCTATGTCTTTGTCTTTGTCTCCTTCCACATTTACCTTTGCTCCCTCTCTCTCTCTCCTATTTCTTTTACTATATACATGTTTCCCCTTTTCCTCTTCTGCTTCTTCTTCTTCTGCTTCTTCTTCTTTATCCCTCACTCTCCCCTCGTCTACCCCCCCCCCCCCGTTCCACCTATAATCTTGTTCTCGAACACGTTTAGAACTACGTTATAGAAATAGGGGTACAATTTTAGTGGTAGGGGGCCATGGCGTTTTATACTTCGTTTTTACAGTAGTATATAATATTTAATTACAGTGCTATAGGCTATATGTTTTGACGCATTGTTCCCTTTAATCCAGTGGCTGGGT 5'
      
Genomic Alignments Position Identity Strand Target Nearby Gene
S. purpuratus 5.0 NW_022145602.1:2192330..2194239 1910/1910 Antisense target endo16
Publications
???morpholino.displaySummary.papersFirst??? Barcoded DNA-tag reporters for multiplex cis-regulatory analysis., PLoS One 2012     
???morpholino.displaySummary.papersRecent???
???morpholino.displaySummary.papersAll???


Sequence tested in:
Species ECAO Tissue ECAO Stage Attribution
S. purpuratus
vegetal plate early blastula stage
ECB-ART-35818
S. purpuratus
vegetal plate late blastula stage
ECB-ART-35818
S. purpuratus
archenteron early gastrula stage
ECB-ART-35818
S. purpuratus
archenteron mid-gastrula stage
ECB-ART-35818
S. purpuratus
midgut late gastrula stage
ECB-ART-35818
S. purpuratus
hindgut late gastrula stage
ECB-ART-35818
S. purpuratus
midgut early pluteus larva stage
ECB-ART-35818