Click here to close Hello! We notice that you are using Internet Explorer, which is not supported by Echinobase and may cause the site to display incorrectly. We suggest using a current version of Chrome, FireFox, or Safari.
Echinobase

Summary Attributions Wiki
ECB-CRE-26397491
CRE Name: CRE103
Synonyms: pCRM_10630, Sp-Pdx1 pCRM5
Nearby Gene: pdx1l
Derived from: S. purpuratus

Sequence:



Nearby Gene S. purpuratus
Identities 1127/1134
genome
CRE
 
5' AATAGCAAATGGTTACATTGATTGAGTTGTAAAATTGACAACAAGGCGATGAAAAGGCAAGTTTGTTCAATTTACGCATAGGCCTAACTTTTGTGTTCGGCTATCTACACCAATGGACTGAATAAACCTCGCACGAGCGCTCAATGGAGATTAACTTAGAAGGGAGGACTATTAACGTTTAACCATTCCTGACTTATTAAGATCTTGTATCGCCCGCAGCTAGCTATAGCGAGCCAGAGAGATTCGTCGAGGAGTTGTGATATCAATGAGCTTGCGCCGTCTGTCCAAACTTCGAAATATTAACCCATATAGGAAGGAGGCGTTGTGCGCAGACGGCACAGTCAGAATCACGTGTTGTCTTTTGGTTTGTTGATTTTATATTTTTTTTATTGCGAGGGTTCAAGGGTGAGCAGAATCCTCCGGAAAACTTTACTTCATCATTACCAGATAGTTAATCGAGGCGTAAGCCGTGTAATTGATGACATTAGATGCGTTAATTGCAATCCAACGACCAGCTTGATACAATTTACCCGTGACGGAGAGGTGGAAGCTTAGGGCTCGTTTTGGGGGAACATACCGCATCTAGGTGCACGGCATCAGCTATAGAGATGGAAGGGAACAATCCCGCGTACTATCACTACATCCCTAAGGGACAATTCCCGATACCTATCACCACAGGTGAAGTTAGCAGCTTTCCCTCTAGCTATAGCCCCCAGCCACCCTCTTGTCTGTATGAGAGCAAACCAACGATCCACAACGAGGACGCCGCAGGGTATGGTCAAGCTACCGGTCTACAGGTACCTGATGGGCGGGGAGATGACGGGCTAGCTCTCCAACAACAATACGTCCAACTCCACGGCGCCACAATGCCAATGCATTCTCCAACGAACCCTCAGGACTTATCTAGGCCGCTGGCTCTGGCCCAGCAAGCTTGTAGCCAGTCACAACAGTGCGACGGACTCCCTATACATTCTCTCGGGTCCCAGCAGCCGAATTATCCTCGAATGCACGGTCTTTCGATGGCGGCCCACCACCCCGCAATGAACGGTGGCCAGGGGCAGTGCCACGGGCAGCTAGGCCACCAGCCACTTTACACCATGGCGTCTGAATATCCAATGTCCTCAGCTAAGATGT 3'
   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' TTATCGTTTACCAATGTAACTAACTCAACATTTTAACTGTTTTTCTGCTACTTTTCCGTTCAAACAAGTTAAATGCGTATCCGGATTGAAAACACAAGCCGATAGATGTGGTTACCTGACTTATTTGGAGCGTGCTCACGAGTTACCTCTAATTGAATCTTCCCTCCTGATAATTGCAAATTGGTAAGGACTGAATAATTCTAGAACATAGCGGGCGTCGATCGATATCGCTCGGTCTCTCTAAGCAGCTCCTCAACACTATAGTTACTCGAACGCGGCAGACAGGTTTGAAGCTTTATAATTGGGTATATCCTTCCTCCGCAACACGCGTCTGCCGTGTCAGTCTTAGTGCACAACAGAAAACCAAACAACTAAAATATAAAAAAAATAACGCTCCCAAGTTCCCACTCGTCTTAGGAGGCCTTTTGAAATGAAGTAGTAATGGTCTATCAATTAGCTCCGCATTCGGCACATTAACTACTGTAATCTACACAATTAACGTTAGGTTGCTGGTCGAACTATGTTAAATGGGCACTGCCTCTCCACCTTCGAATCCCGAGCAAAACCCCCTTGTATGGCGTAGATCCACGTGCCGTAGTCGATATCTCTACCTTCCCTTGTTAGGGCGCATGATAGTGATGTAGGGATTCCCTGTTAAGGGCTATGGATAGTGGTGCCCACTTCAATCGTCGAAAGGGAGATCGATATCGGGGGTCGGTGGGAGAACAGACATACTCTCGTTTGGTTGCTAGGTGTTGCTCCTGCGGCGTCCCATACCAGTTCGATGGCCAGATGTCCATGGACTACCCGCCCCTCTACTGCCCGATCGAGAGGTTGTTGTTATGCAGGTTGAGGTGCCGCGGTGTTACGGTTACGTAAGAGGTTGCTTGGGAGTCCTGAATAGATCCGGCGACCGAGACCGGGTCGTTCGAACATCGGTCAGTGTTGTCACGCTGCCTGAGGGATATTTAAGAGAGCCCAGGGTCGTCGGCTTAATAAGAGCTTACGTGCCAGAAAGCTACCGCCGGGTGGTGGGGCGTTACTTGCCACCGGTCCCCGTCACGGTGCCCGTCGATCCGGTGGTCGGTGAAATGTGGTACCGCAGACTTATAGGTTACAGGAGTCGATTCTACA 5'
      
Genomic Alignments Position Identity Strand Target Nearby Gene
S. purpuratus 5.0 NW_022145596.1:14338027..14339160 1134/1134 Antisense target pdx1l
Publications
???morpholino.displaySummary.papersFirst???
???morpholino.displaySummary.papersRecent???
???morpholino.displaySummary.papersAll???


Sequence tested in:
Species ECAO Tissue ECAO Stage Attribution
S. purpuratus
lateral ectoderm late gastrula stage
ECB-ART-53133
S. purpuratus
hindgut late gastrula stage
ECB-ART-53133
S. purpuratus
midgut late gastrula stage
ECB-ART-53133
S. purpuratus
pyloric sphincter open mouth stage
ECB-ART-53133