rabggta Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (9)

Interactants (13)

ECB-GENEPAGE-23186750

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for rabggta - All

Models - Gene (3)

Models - mRNA (1)

mRNAs (5)

ESTs (0)

Models - Gene (3)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	LOC100887959 >LOC100887959 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miniata
NCBI_REFSEQ/JGI	3.1	LOC100887959 >LOC100887959 CTGAGGACTAGTTTGCAGTATTGCAATATAAAGATGATATTTATAATGGATTGTGTTAAGCCATATTAAATTTTAGAATTGTGTACTCGATGAATCAGTCAAAGCCTTAACTCTTGTTAAGATCTACACAGTAAGCAGTGATGCATTGAGGCAGGAAGGTGAAAGAACACTTCAAGTCAAACTGAGGGAAGATGTCTGTAGATCATGTCATCTAGATGAAGGtacgattttaaaaaataataataaacatagaaagagaggggggaaatTATACTTCTACAATTTTTTCATTGTATGGGAAGTGTTAAAATGTGGTAAAGCTATAAATACAGTGTAATGTTCTTGCAGTTACatgtgtgtgattttttttttttttttttttttgggggggggagggtcttTCTAAAGGCTGTTCAaccctttaaataaaatgaaattaaaaaaacaaaaataatctcaACTCTCAACAGATGGTTcatgtgtgattttttttttttttttttgggggggggagggtcttTCTAAAGGCTGTTCAaccctttaaataaaatgaaattaaaaaaacaaaaataatctcaACTCTCAACAGATGGTTCATGTGTGagtctttcatttcctttagtccagaaatgaagaaagatcTGCTGTGAATGTACTTCCTGTACACATtcaatatataatgataattaaaatgttttactgaatgaaattcatatttcattgaaatcCGAAGAGTATCCAAAGAGTTCAAAATATTACCTTTTTGCCCAGGAATAAATTACAGAGACACTAAATCTGGCTTATTTCCTTCATTCAGGTGCAACAGAATGTTGGAGCAAGGACAAGCAAGATGCAAGCTCACTCTTCACGGCTGAACTCAGTGATGAGAAAACAGAATTCCTCACAACGGAACTGGAGTCCTGTCAGCAACTTCGAGAACTGGAACCAGATAATAAATGTGAGCTTTAGCATCTGAGGAAACTTTGCACAATAGTAAATATGGCTGATAAGTACTATTTAGAATATGATTTGGTCCTCAGAATATATTTCCATGGGCTATTTTTATAGTTTGAACAGAAGGAATTGTATGTCAAGAAGGAAAATGTTGgggcttttgttttttttagggATTATGGTTCCTACTTTAGAAGAGAATGTATTTTGAGTATGTTTGTGATTGCCTTCATCTCAAAGTTTCAAACAACACCTGTGGTGTAATATTACTGTATTTGCAGGGGCCTTTTAGCTGTAGTCTTTATAATAACATGCCTTGTCCTCTTACAAATTAGGTTGAGGTAGTTGACTGCTCCTCGTTTCACTTTCACTACTTTCTTGGCAAGGTGGCAGTGATCTTTCTCATTAAGGTCCTACATGTCCATCCTTTGAGGCATACAAAATTGCTGAAATTGTTTTAACatgttttccctcttttatgttattgtttttacaCTGTGTACCATCTTTTCTATGCTGTTATGTTACTCTTCTTGAACTCTCTTGGCTTATTGCATTtctcaggcctgataattacccgaatTAAATCGGTTTccagatttttaaatttttatcccgattttttttttttcctgattttttttcttctttctcccctattttttttttcttcctgattttaccctgatttttccctgattttttaactcaaaaggggggaatgttgtttgatgccattttttttcctgaatcctattttttgttttgttattacttTCACCCCTGATTTCTTTGCAGGGTGTCTGTTGACGGTGATCCTTCTCATGAGGGCTCTCGACCCTCTGAAGCTCGAGGCCGAGATGCTCGGATGTTTCACGACCATCCTGTCTCAAGACACCTACAGGGCAAACTACTTCAAGGATCTCAGAAGCAAGTTCATCATGGAGAACGCCATCATGAGATACCTGCAGGAGAGTTCAAAGGTCGCAGAGTCACAGGTCAAGCAGGCGACATTTGATGCATCTGGAAAGGTCGgtgttaatgaataaatatgctCACTATGGAATAGTAAGAAGTTTCTCCACAATGCATCTAAAGTTAGAAATTCCTTCATTTAATTCCAATATGCTCATGATACaggtatttttttcctttagaTTTCTCTCTTGATATCGGTAcagaaaatgggtacctgataggaagatattacatgcttttgatatttcatatttcactgACCAGTTAAAGCAagattttagttttaaaaattgGAATCGTAGATGATTGCTAGTTTGGCATACATTTATACGATCCAAAGGACAAAAACAAAGGCAActctttcaacttttttttcaacaataatCAGTCTGTGTTAAAATTTCCCcccaaaaatcaaatatttcccccccaaaaatcaaatatttcaaggtaaattgatatttaattttaacaCATTCATTCTTATTTGAATTCATGAGCTGATAAGTGTAACCTGTATGTCTGTCTCGTAGatttaaatttgcaataataaaGTGTATGTGCATGGTGTATGTGTCATTTTTCAAGACAGTAAGTGAATTGAACCAATCTTttacatgatttgttttcacAGGAGTTGACGACCTTACATCATCTCCACCATCTATCATCTGTACACTGTATGGACCTCTCCAACAATGACCTTCTTGCGCTCAACGATATAGATCTACTGTTCTGTGTGTCGGACCTAAAGGCTGATAGCAACAAGCTCCAGGACATCTCACACTTGAGTGGGTTACCTTGCTTAGAAACGTTGTCACTTGAAAACAACAGTATCCTTTGATGAGTTTCGTGATTAGCGTGATGTGATGATTATAGTGAGgaaaaggagggggaggaagagggggaggaggaaattgaggatggtgatgatgatgaacggAATATTACTGATAATGGtaacagtgatgatgatgataaaaatgctgctgatgatgaccttgacctaccttgacctaccttgacctaagccttccacaccatctgggagatgtgtgatggcttctggcttctgatgatgatagtgataacactgatgaggagaaggaggaagaggtgaaGGAGGATGCTGATAGCAACATGCACGAAGACATCTCATATCTACATGGTAAGGCCTGCTTATCCTTTTGGGCTTCAGCCTTGCAACGCAGTGGTGGTTAGggttgtgatgatgatagtggtgaggacgatgatggtggtgatgatgaagggggggggggggggttggtgacggtggtgatggtggtggtgatgatgatgatataggaataatactgataatggtaacagtgataatgatgatgataatgatgctgatgataataatgctgatgatgatgatgaggataatgataaGGAGGATGAGGTGAAGGAGGATGCTGATAGCTACATGCATGAAGACATCTCATATCTACATGGTAAAGCCTGCTTATCCTTTTGGGCTTCATGCAGGTTTGCAACGATAGTGGTGAGGatgctgatggtgatgatgataattatgatgacgacaacgacgatgatgatgacgatgatgatgatgaagttaGACCTACATGGACTGCCCTGCCTACAAAATCTTGTCATTGAAAAACAAGTTTCTGTTTGGGGGTTTAGTAATATGATAATAGTGAGGGGGAtagttgatgatgataacaagaTAATAATGGTGATTACTGTTGTGGTgggaatgatgataatgatggtggcgTTGGTGGTGGCTGTGTTTAAGTGATTTTGCTGATGATGGAGATGGGGATGGAGGTAACAATGATGAAGAGATGAGAATTAGAACGAAGATggtgatcatgatcatgatgttcATGAAGATGGTAGGGGTGTTTTATCACCATTCAAGCAATATTCTGATATTATtaatagaaaagaaatcaaattttaatttaaaggtccttttacctttctttttttcttttaactgcAATCATTCACTCGACAAAGATGCAATACCCATCCAAATAATTCCTTAACTCCCTTTCCTCAGACATCTCTTCACTCTCACAGCTGGAGCCGCTGGCAGCTTGTCCAAATCTTCGACAATTGGATCTGTCTGGTAATCCAGTCTGTGACCTTGACCTTtttgggtcaaaggtcagagaACTCCTTCCACAACTGACAAGTCTTAACAAGGAGTTACTATGATGGCTGTTTTTACTTAGGTCTGTAATATTTCTGAAGTGCAAATAATAGGTTCTTG	S. purpuratus

Models - mRNA (1)

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mRNAs (5)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	GHFM01006579 >GHFM01006579\| -	S. purpuratus
	JT122945 >JT122945\|>JT122945.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.640186.0 mRNA sequence CTGAGGACTAGTTTGCAGTATTGCAATATAAAGATGATATTTATAATGGATTGTGTTAAGCCATATTAAA TTTTAGAATTGTGTACTCGATGAATCAGTCAAAGCCTTAACTCTTGTTAAGATCTACACAGTAAGCAGTG ATGCATTGAGGCAGGAAGGTGAAAGAACACTTCAAGTCAAACTGAGGGAAGATGTCTGTAGATCATGTCA TCTAGATGAAGGTGCAACAGAATGTTGGAGCAAGGACAAGCAAGATGCAAGCTCACTCTTCACGGCTGAA CTCAGTGATGAGAAAACAGAATTCCTCACAACGGAACTGGAGTCCTGTCAGCAACTTCGAGAACTGGAAC CAGATAATAAATGGTGTCTGTTGACGGTGATCCTTCTCATGAGGGCTCTCGACCCTCTGAAGCTCGAGGC CGAGATGCTCGGATGTTTCACGACCATCCTGTCTCAAGACACCTACAGGGCAAACTACTTCAAGGATCTC AGAAGCAAGTTCATCATGGAGAACGCCATCATGAGATACCTGCAGGAGAGTTCAAAGGTCGCAGAGTCAC AGGTCAAGCAGGCGACATTTGATGCATCTGGAAAGGAGTTGACGACCTTACATCATCTCCACCATCTATC ATCTGTACACTGTATGGACCTCTCCAACAATGACCTTCTTGCGCTCAACGATATAGATCTACTGTTCTGT GTGTCGGACCTAAAGGCTGATAGCAACAAGCTCCAGGACATCTCACACTTGAGTGGGTTACCTTGCTTAG AAACGTTGTCACTTGAAAACAACAACATCTCTTCACTCTCACAGCTGGAGCCGCTGGCAGCTTGTCCAAA TCTTCGACAATTGGATCTGTCTGGTAATCCAGTCTGTGACCTTGACCTTTTTGGGTCAAAGGTCAGAGAA CTCCTTCCACAACTGACAAGTCTTAACAAGGAGTTACTATGATGGCTGTTTTTACTTAGGTCTGTAATAT TTCTGAAGTGCAAATAATAGGTTCTTG	S. purpuratus
	XM_030976120 >XM_030976120\|>XM_030976120.1 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha (LOC100887959), mRNA AATACATATTCATCAAGCTGCACTTCTCTCTGACTCTGCATTCTCGCCTGAATTATCAATCGTTTTTCTG TTCATACAAAGGATCCGCAAAGTTCGAGACAGAATGCATGGCCGATTGAAAGTGAAGACTACCGAAGAAC AGCAAGAAGCAAAGAGGAAGGAACGAGAAAAGAAACTTAAACTTTACACAGCTGGTACACAGAAAGTCTT TGAAAAGAGAAAGAAGAATGAATTTGATGGGGAAATTTTAGAAGTCTGTGCTCAGCTTCTTTCAGCGAAC CCAGACGTCTACACACTTTGGAATGTAAGAAAGGAGACATTCCAGGTACTTGCAGAGACAAAGACTCCCG ATGAGATGCAGGAACTGTATGATAAAGAGCTGGGTTTCATTGAGAATTGCTTGAGGGTGAACCCAAAGTC CTACGGTGCTTGGTACCATCGTTGCTGGGTGCTGGACCACACCCCCAAACCAGATTGGAAGCAAGAATTG AAACTCTGTACTCTGTATCTAGAATACGATGAGAGAAATTTCCACTGCTGGGACTACAGGAGGTTTGTAG TTGCCAAGTCGGACGTTGCCCCATCGGATGAGCTTGAATTCACCAGCAACAAGATCAGTACAAACTTCTC AAACTACTCCTCCTGGCACTATAGGAGTAAGCTCCTCCCAGTGCTTCATCCTGATCAAGAGAAGAAAGGA AGGCTCAAAGAAGACATCCTCATCCAAGGTATCGTATTAGTACCTCGACTGGTTTCTGCTTGCTTCAAGT GGCTATTAAAGACCATGATAGACCAAATAGATGCATGTATAGTAAGGAAGAAAGACATCCTCATACAAGG TATCGTATTAGTCCCTCGTCTGGTTTGTGCTTGCTCCAAGTGGCTATTAAAGACCATGATAGACCAAATT GATACATGTATAGTAAGGAAGAAAGACATCCTCATACAAGGTATCGTATTAGTCCCTCATCTGGTTTCTG TTTGCACCAAGTTTTGCACACCAATTGCAAGTTCTCTCATGGCAGCTACTTTCTTTATCTGTGCACTTCC AGGTGAGAAACCATTAGGAATCCAAGCAGTCTATGCAAACAGCGCCCTCAACCAGGTCATGGTGATATTC AGCCAGTCTGTTAACCTCCTACAGCAGCCAGCAGAGGTGTCCATCAGCGGTTCGGTCATGGATGGAACAT GGAGGAACTCAAGAGGTAGTCAATACCACTCCATCATGTGGATCTACACAGTAAGCAGTGATGCATTGAG GCAGGAAGGTGAAAGAACACTTCAAGTCAAACTGAGGGAAGATGTCTGTAGATCATGTCATCTAGATGAA GGTGCAACAGAATGTTGGAGCAAGGACAAGCAAGATGCGAGCTCACTCTTCACGGCTGAACTCAGTGATG AGAAAACAGAATTCCTCACAACGGAACTGGAGTCCTGTCAGCAACTTCGAGAACTGGAACCAGATAATAA ATGGTGTCTGTTGACGGTGATCCTTCTCATGAGGGCTCTCGACCCTCTGAAGCTCGAGGCCGAGATGCTC GGATGTTTCACGACCATCCTGTCTCAAGACACCTACAGGGCAAACTACTTCAAGGATCTCAGAAGCAAGT TCATCATGGAGAACGCCATCATGAGATACCTGCAGGAGAGTTCAAAGGTCACAGAGTCACAGGTCAAGCA GGCGACATTTGATGCATCTGGAAAGGAGTTGACGACCTTACATCATCTCCACCATCTATCATCTGTACAC TGTATGGACCTCTCCAACAATGACCTTCTTGCGCTCAACGATGTAGATCTACTGTTCTGTGTGTCCGACC TAAAGGCTGATAGCAACAAGCTCCAGGACATCTCACACTTGAGTGGGTTACCTTGCTTAGAAACGTTGTC ACTTGAAAACAACAACATCTCTTCACTCTCACAGCTGGAGCCGCTGGCAGCTTGTCCAAATCTTCGACGA TTGGATCTGTCTGGTAATTCAGTCTGTGACCTTGACCTTTTTGGGTCAAAGGTCAGAGAACTCCTTCCAC AACTGACAAGCCTTAACAAGGAGTTACTATGATGGCTGTTTTTACTTAGGTCTGTAATATTTCTGAAGTG CAAATAATAGGTTCTTGCTAGTAGATAACACACTAGTTGTCCATATAAAATATGGGGACTGGGTGTACAA TTTAAATTGCAAGGGTCCTTACAAGAATCATGTTGGTGCATACTTTCAACCTGCAAAAACATATCTGGTT CTACCGCAAGGTTGGTTCGCTCGATTAGTATCAAGTGTTAACAAATACATGTATCTACCAAAGGATTGCG GAGTGGAGTGTATGTGGTGTAATAGAAATTAGTAAGGGTATTGTGATGTATCATAACTTAAGCCTGTCTG TACTAGTTTGGCCAGGAGGGATTAGACTACCCAGGGTGGTCACTGACAGGTGGCTATCTCATCAACTCAG CTCTCAATTAACATAAGAAAAAGAGGATCATGGGGGACCAACGGGCACCGCTTAGGCATTGTTTTCTATA TAGAGGGAGCAAGTACATGTAGCTACAAGTAGTACAGAGGGACTTTAAAAGAATAAGAATATAACATGAC GATTATGTACACACATTCCAGAGTGTATTCCGTCTTTCTGTTGTTACTATTACTATCATTATAATTTAAT GATTTGGGCCTGGGCCTGGTACAAGAAAAGCACACTTAATCACCCATGGCTCTCTCCTCCCAGTGTAACT GATTGGCATGTGCAGGCGTACTACGACACCAGGGGGTGTTTCACAAAGATCCTAAGTTGAACTTATCTCT AAGTTGGACTTAAAATTTATGGACACCCATTGGAGCCTTAAAATGAAATATAT	S. purpuratus
	GHJN011331607 >GHJN011331607\| -	P. miniata
	XM_038214524 >XM_038214524\|>XM_038214524.1 PREDICTED: Patiria miniata geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha-like (LOC119739544), mRNA TAAAACCACACATGACTGGGAGAGGCAAGGACTGAGGTTGCACCCTGCTCAAAATGCACGGCCGACTGAA AGTCAAGACCACAGCTGAGCAGCAGGAGGCGAAGAGGAAAGAAAGAGAGAAGAAGCTCAAGCTGTACACA GGAGCAACTCAGAAGGTTTTTCAAAAGAGGAAGGATGGAGAATTTGACGATGAATCCCTGGAGATTACCA GCCAGCTGCTGTCATCCAACCCAGACTTCTACACTCTCTGGAATTACCGCCGGGAAATATTCCTGGATCT CACCAAAAACAGTGAATCCCAGGAGATGCAAGACAGATACAGCAAGGAGCTGAAGTTCCTTGAATCATGC CTGATGGTCAACCCTAAGTCTTACGGGTCATGGCACCATAGAGGCTGGGTCATGGACCACATGCCGGAAC CAGACTGGAAGCGGGAGGTGGCACTGTGCAACCAGTACCTGGAGTACGACGAGAGGAATTTCCATTGCTG GGACTACCGTCGCATTGTTGTCTCCAGGGCCAACGTCCCTCCTGCCGATGAGCTCAAGTTTACCGACACC AAGATCTCCAGTAACTTCTCCAACTATTCCTCCTGGCATTACCGCAGCAAACTGCTTCCATTGCTGCATC CAGACCCAGAGAACAAGGGAAGAGTCAAGGAAGACATACTGCTACAAGAGTATGAGCTGGTTCAAAACGC CTTCTTCACAGATCCCAACGACCAGAGTGCCTGGTTTTACCAGCGGTGGCTGCTGGGTAGAGCCGAGAAA CCACAGGATATTAATCTGCTTTACGCAAGACGAGAGCCTAGTAGAATTGTGGCTGTTTTTGCTCAGCCTG TTAAACTCTCTGAGGATGGCGCTGCAACATCTGTGACAGTAAACGGCAGTGGAGTTTCTGGAACATGGAG GAACTCGCAGGGAGCACATAACCACGCCTTGGTGTGGGTGTATTTGATGAACAATGATGCACTCTCTGCC CAAGGCACATTGGAAGTATGCCTGTCAGTAGATGACCTGGGCGTGTCTAGACAATGCACCCTGACAGCAG ACCAGACTGAAGGCTGGTGCCATGAGTCAACAGACAGCGTGGAGCTCTTCACTGCACAGTTGAGTATGGA GAAGTCAGGGGTTCTGACCCAGGAGCTTGAGTCTTGCCAACAGCTACAAGAACTAGAACCAGATAACAAA TGGTGCTTACTGACCATCATTCTCCTCATGAGGGCCATCGACCCCCTCAAGTATGAGGCAGAGACGTTAC GATATTTTGAAACCCTCCTACAGACAGACCCGCGCAGGGCGGGGTACTTCCGAGACCTGCGCAGCAAGTT TGTCATCGAAAATGCCATCACTCGAAACATGCAACAGCAGTCCGCTAGTAGAGAAATAGATTTATCTGGG AAGGAACTCACAACCCTCCGCCACACAGAACGCATGGTGCTGATGACCCGGGTCAATCTCTCATCCAATC AGCTTCCTTCTCTCAAGGGATGCCATACGCTGCTGTGTGCACAGACGCTATTGGCCGATAGCAACTCTAT CCGAGATTTGAAAGACCTGCCCTCTCTGCCGTGTCTTGAGACGCTATCACTGAAGGCAAATTCCATAGGA ACTGTGCAGGACCTGGCACCCCTACAGACCAGCACCAGACTACAGAATCTGGATCTAAGATCCAACCCTG TTTGCGACATTCCAGACTTCCAGCAGAGTGTGAAAGCACTTCTTCCACAACTCACCACACTGAATGAGGA AAAACTTTGATGTTGATTCAGATCTTGTTGTCTTAATTGCATATCCTGTAAG	P. miniata

ESTs (0)