pfdn5 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (9)

Interactants (59)

ECB-GENEPAGE-23167281

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for pfdn5 - All

Models - Gene (4)

Models - mRNA (1)

mRNAs (7)

ESTs (0)

Models - Gene (4)

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variegatus
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Models - mRNA (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_001178621.4 >XM_001178621.4 TAACTTACATTTCTCACGCTAATCACATTTGATTAGACCATTTATTTGTACAAATTGTGATTTAGATAAACAATCATGGCTGAAGGACAGCAAGTCGACCTTATGCAGCTCCCACTCCCACAGCTGAATGGCCTCAAAGAACAGCTAGATCAGGAGGTAGAAATGATGCAAAATTCTTTGCAGCAACTCAAGATGGCCCAATCTAGGTTTGTGGAATCATCGGATAGCATATCCAAATTAAATAAGGATAATGAAGGTAAAGAGATGCTGGTTCCACTAACATCATCTCTCTACGTACCAGGCAAACTACAAGATGTCAACAATGTCTTAATAGATATAGGAACTGGCTACTTTGTTGAAAAGCCACTAGAGGAAGCTAAGAAGTACTTCAAAAGGAAAGTAGATTTTGTCACAAAACAAATGGAGAAAGTGCAACCAGTACTAATAGAGAAATCAAAGATGAGACAAGTTGTGATGGATGTGATGAACATGAAGATTCAAGCTCAGATGTCTCAAATGCAAAACCAGCCAGTAAAGTCATAGGAGATCAAAACAGATGAGCTCATCCTTCATGTATAAATTATTCATTTTTTACAAGATATTACATGTCAGTTTCCCTTAAGATGTTCTGATGCATCCAAGTGTAAGACCATTGAAATGTATTTCTGTAACTTTGCGACATTGGATTAACCTACTTCGCTGTTGATGGTACTGTTGTTTTTACTATGAAAACTTTAAAGGAGTACCGGTAATGTGAAGAGACCAATTTAAGAATACATTCATTTTTATGGATATTTCTTTCCTACTGCGATATTCTTAGTGTAATATTTTTAGGGATGAAATCATATTCACAATACCAATTTCCACCCATGGTTACCATCTATTTCACACACATGTTGTGTATAATAGCATCTTAATGGTTAAAATTTGTAATGTGTATACAGTATTACATGTTTCTATGTCAAGCAAGCCTCTCACAAGGTTTTAGGTCGTAATGAGCAACTTTTTATTTGAGAAGCATGTATCAAATTAATATACTCATTTATTATTTAAGGCACAACTTCTCTACCCCAAAAAATTGCTGTGATAAGCATTTCATTATAAACATCTGAAAATAGAACTCCCTTTTCAGCATGTTGTCTGAATGGAACTTGATACTGATTCTGTTTACATCCTGTGAATGAAAGAATTGTGTATTTATTTTGCCACATGATATATAAGTCCATCTAATTTAAGAGGATAGAAGTTGTGTTTTGGATCCCATTGCTTTACAGCAGTACTGACTTGTTTTGTGATAAATAAAGAACATGTGGAATCTGG	S. purpuratus

mRNAs (7)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_041604308 >XM_041604308\|>XM_041604308.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus prefoldin subunit 5-like (LOC121411531), mRNA TTATTATCACCGTTTCACTCTCAATCACTGATGACTTATTAGTTCGTGTTGCAGTTTTATTTTTACGAGT TGCGATCAAAGAAATAACCATGTCTGAAGGAGGGCAGCAAGTGGACCTAATGCAGCTTCCGATTCCACAA CTGAATGGTCTTAAAGAACAGCTAGATCAGGAGGTGGAGATGATGCAGGGTTCTTTGCAGCAGCTCAAGA TGGCCCAGTCTCGGTTTATGGAATCATCAGAAAGCATAGCCAAATTAAATTCTGATAATGAAGGAAAAGA GATGCTGGTTCCACTAACATCATCTCTCTATGTACCAGGCAAATTGCAAGATGTCAATAATGTATTAATA GACATAGGGACTGGCTACTATGTAGAAAAGTCACTTGAGGAAGCTAAGAAGTACTTCAAAAGGAAAGTAG ATTTTGTCACCAAACAAATGGAAAAAGTGCAACCAGTACTAATAGAGAAATCAAAGATGAGACAAGTTGT GACAGAAGTGATGAACATGAAGATTCAAGCTCAAATGGCACAAATGCAATCACAGCAAGCAAAATCATAG GAGATCAAAAGAGATGAGCTCTTTCTTAGTGTATAAACTATTCATTTTTATAGGTGTTACATGTCATTTT CTCCCTTATGCATCTTTAGTGACCCGTGCCCACTGAATGCAGTCTAGGGCCTATTGTGGTTCAATATTAA ATGAAATATATGTATATGGATATTAGTGTACGATGAGAATGTTGTAGCAGCAATACAAATGCGCTCAAGG TTGTGCCATAGTCTCCAGGCACAGACCTTCAATTTCTCATAGTGCACAATACAGAGTCTGAAGTAGTGAG ACTAGATTCTCTCAGTCATGTTTTGTGGCTGTCTCTCCCAGGCAGAAAGTTTGGAGCCTAGTCTTCACTC TAGACTTGGTAGGCTATACATGTAATTTGTTTTGAAAATTGGAGTCTGTGCGTGCAGACTACTTGTAGGT GTACCATACAAGGTTCAACAAGCATAGTACTCATAGGGTTTGTATTAGGCATATGAAATTTGTCATTAGA AATGTATTCCTTATGCCTTTATGTAGCCTCAAGTGAGTAGGGCCCCATAATATGAA	L. variegatus
	JT094480 >JT094480\|>JT094480.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.554291.2 mRNA sequence AATTAGTGACGTCATAACTTACATTTCTCACGCTAATCACATTTGATTAGACCATTTATTTGTACAAATT GTGATTTAGATAAACAATCATGGCTGAAGGACAGCAAGTCGACCTTATGCAGCTCCCACTCCCACAGCTG AATGGCCTCAAAGAACAGCTAGATCAGGAGGTAGAAATGATGCAAAATTCTTTGCAGCAACTCAAGATGG CCCAATCTAGGTTTGTGGAATCATCGGATAGCATATCCAAATTAAATAAGGATAATGAAGGTAAAGAGAT GCTGGTTCCACTAACATCATCTCTCTACGTACCAGGCAAACTACAAGATGTCAACAATGTCTTAATAGAT ATAGGAACTGGCTACTTTGTTGAAAAGCCACTAGAGGAAGCTAAGAAGTACTTCAAAAGGAAAGTAGATT TTGTCACAAAACAAATGGAGAAAGTGCAACCAGTACTAATAGAGAAATCAAAGATGAGACAAGTTGTGAT GGATGTGATGAACATGAAGATTCAAGCTCAGATGTCTCAAATGCAAAACCAGCCAGTAAAGTCATAGGAG ATCAAAACAGATGAGCTCATCCTTCATGTATAAATTATTCATTTTTTACAAGATATTACATGTCAGTTTC CCTTAAGATGTTCTGATGCATCCAAGTGTAAGACCATTGAAATGTATTTCTGTAACTTTGCGACATTGGA TTAACCTACTTCGCTGTTGATGGTACTGTTGTTTTTACTATGAAAACTTTAAAGGAGTACCGGTAATGTG AAGAGACCAATTTAAGAATACATTCATTTTTATGGATATTTCTTTCCTACTGCGATATTCTTAGTGTAAT ATTTTTAGGGATGAAATCATATTCACAATACCAATTTCCACCCATGGTTACCATCTATTTCACACACATG TTGTGTATAATAGCATCTTAATGGTTAAAATTTGTAATGTGTATACAGTATTACATGTTTCTATGTCAAG CAAGCCTCTCACAAGGTTTTAGGTCGTAATGAGCAACTTTTTATTTGAGAAGCATGTATCAAATTAATAT ACTCATTTATTATTTAAGGCACAACTTCTCTACCCCAAAAAATTGCTGTGATAAGCATTTCATTATAAAC ATCTGAAAATAGAACTCCCTTTTCAGCATGTTGTCTGAATGGAACTTGATACTGATTCTGTTTACATCCT GTGAATGAAAGAATTGTGTATTTATTTTGCCACATGATATATAAGTCCATCTAATTTAAGAGGATAGAAG TTGTGTTTTGGATCCCATTGCTTTACAGCAGTACTGACTTGTTTTGTGATAAATAAAGAACATGTGGAAT CTGGGGGCCTAGTTTGTGAAAAGACTTTAAAAATGTGAATTTTTCATTTTTAATTCAAGTATTGAATAGT GGTTTTGAATTGATAATATTTAAAATGATGATTCCATACTGAATAGATCAGATTCTTTCATGTTTGTAAT TGAGTGATTTGTTTTCTTCCACTCTAACAAATTCAAATTCAGTTTTCTGATTGGTCATCATCATTGCACA TGTGCTAAAATGTGGATGAATAACAGTGCATGCCTACCAGAATAGAATACAGATACATGTATATCATATA ATTCATGATTATTTTCATTGAATGAGAGCAGCATTATTACCGGTACAGGGTATATCAAAGTTGTATCTGA AACTTGATTTTCTGTCAGAAAGGTGCCCAAATTTTCCCCACCCTGGGTCACCCCCTCCCAGACTGTCCCC CTATATGGGGGCTTTACACCCTCAAAAGGGCCCACCTTG	S. purpuratus
	XM_001178621 >XM_001178621\|>XM_001178621.4 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus prefoldin subunit 5 (LOC754445), mRNA TAACTTACATTTCTCACGCTAATCACATTTGATTAGACCATTTATTTGTACAAATTGTGATTTAGATAAA CAATCATGGCTGAAGGACAGCAAGTCGACCTTATGCAGCTCCCACTCCCACAGCTGAATGGCCTCAAAGA ACAGCTAGATCAGGAGGTAGAAATGATGCAAAATTCTTTGCAGCAACTCAAGATGGCCCAATCTAGGTTT GTGGAATCATCGGATAGCATATCCAAATTAAATAAGGATAATGAAGGTAAAGAGATGCTGGTTCCACTAA CATCATCTCTCTACGTACCAGGCAAACTACAAGATGTCAACAATGTCTTAATAGATATAGGAACTGGCTA CTTTGTTGAAAAGCCACTAGAGGAAGCTAAGAAGTACTTCAAAAGGAAAGTAGATTTTGTCACAAAACAA ATGGAGAAAGTGCAACCAGTACTAATAGAGAAATCAAAGATGAGACAAGTTGTGATGGATGTGATGAACA TGAAGATTCAAGCTCAGATGTCTCAAATGCAAAACCAGCCAGTAAAGTCATAGGAGATCAAAACAGATGA GCTCATCCTTCATGTATAAATTATTCATTTTTTACAAGATATTACATGTCAGTTTCCCTTAAGATGTTCT GATGCATCCAAGTGTAAGACCATTGAAATGTATTTCTGTAACTTTGCGACATTGGATTAACCTACTTCGC TGTTGATGGTACTGTTGTTTTTACTATGAAAACTTTAAAGGAGTACCGGTAATGTGAAGAGACCAATTTA AGAATACATTCATTTTTATGGATATTTCTTTCCTACTGCGATATTCTTAGTGTAATATTTTTAGGGATGA AATCATATTCACAATACCAATTTCCACCCATGGTTACCATCTATTTCACACACATGTTGTGTATAATAGC ATCTTAATGGTTAAAATTTGTAATGTGTATACAGTATTACATGTTTCTATGTCAAGCAAGCCTCTCACAA GGTTTTAGGTCGTAATGAGCAACTTTTTATTTGAGAAGCATGTATCAAATTAATATACTCATTTATTATT TAAGGCACAACTTCTCTACCCCAAAAAATTGCTGTGATAAGCATTTCATTATAAACATCTGAAAATAGAA CTCCCTTTTCAGCATGTTGTCTGAATGGAACTTGATACTGATTCTGTTTACATCCTGTGAATGAAAGAAT TGTGTATTTATTTTGCCACATGATATATAAGTCCATCTAATTTAAGAGGATAGAAGTTGTGTTTTGGATC CCATTGCTTTACAGCAGTACTGACTTGTTTTGTGATAAATAAAGAACATGTGGAATCTGG	S. purpuratus
	JT097102 >JT097102\|>JT097102.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.554303.0 mRNA sequence GGCACGCTAATCACATTTGATTAGACCGTTTTTTTGTACAAATTGCGATTTAGATAAACAATCATGGCAG AAGGACAGCAAGTAGACCTTATGCAGCTTCCACTCCCACAGCTGAATGGCCTCAAAGAACAGCTAGATCA GGAGGTAGAAATGATGCAAAATTCTTTGCAGCAACTCAAGATGGCCCAATCTAGGTTTGTGGAATCATCA GATAGCATATCCAAATTAAATAAGGACAATGAAGGTAAAGAGATGCTGGTTCCACTAACATCATCTCTCT ACGTACCAGGCAAACTACAAGATGTCAACAATGTCTTAATAGATATAGGAACTGGCTACTTTGTTGAAAA GCCACTAGAGGAAGCTAAGAAGTACTTCAAAAGGAAAGTAGATTTTGTCACAAAACAAATGGAGAAAGTG CAACCAGTACTAATAGAGAAATCAAAGATGAGACAAGTTGTGATGGATGTGATGAACATGAAGATTCAAG CTCAGATGTCTCAAATGCAAAACCAGCCAGTAAAGTCATAGGAGATCAAAACAGATGAGCTCATCCTTCA TGTATAAATTATTCATTTTTTACAAGATATTACATGTCAGTTTCCCTTAAGATGTTCTGATGCATCCAAG TGTAAGACCATTGAAATGTATTTCTGTAACTTTGCGACATTGGATTAACCTACTTCGCTGTTGATGGTAC TGTTGTTTTTACTATGAAAACTTTAAAGGAGTACCGGTAATGTGAAGAGACCAATTTAAGAATACATTCA TTTTTATGGATATTTCTTTCCTACTGCGATATTCTTAGTGTAATATTTTTAGGGATGAAATCATATTCAC AATACCAATTTCCACCCATGGTTACCATCTATTTCACACACATGTTGTGTATAATAGCATCTTAATGGTT AAAATTTGTAATGTGTATACAGTATTACATGTTTCTATGTCAAGCAAGCCTCTCACAAGGTTTTAGGTCG TAATGAGCAACTTTTTATTTGAGAAGCATGTATCAAATTAATATACTCATTTATTATTTAAGGCACAACT TCTCTACCCCAAAAAATTGCTGTGATAAGCATTTCATTATAAACATCTGAAAATAGAACTCCCTTTTCAG CATGTTGTCTGAATGGAACTTGATACTGATTCTGTTTACATCCTGTGAATGAAAGAATTGTGTATTTATT TTGCCACATGATATATAAGTCCATCTAATTTAAGAGGATAGAAGTTGTGTTTTGGATCCCATTGCTTTAC AGCAGTACTGACTTGTTTTGTGATAAATAAAGAACATGTGGAATCTGGGGGCCTAGTTTGTGAAAAGACT TTAAAAATGTGAATTTTTCATTTTTAATTCAAGTATTGAATAGTGGTTTTGAATTGATAATATTTAAAAT GATGATTCCATACTGAATAGATCAGATTCTTTCATGTTTGTAATTGAGTGATTTGTTTTCTTCCACTCTA ACAAATTCAAATTCAGTTTTCTGATTGGTCATCATCATTGCACATGTGCTAAAATGTGGATGAATAACAG TGCATGCCTACCA	S. purpuratus
	XM_038221710 >XM_038221710\|>XM_038221710.1 PREDICTED: Patiria miniata prefoldin subunit 5-like (LOC119745390), mRNA CTGTTCAATTTTATGAAGCTCAAATTCTTTGACAAGATGGCGGGTGGAAGCGGCGAACCTCAAGCTATTG ATTTGATGCAGTTGGCTCTCCCTCAGCTGAATATGCTGAAGGAAGAGATCGAACAGGAAGTTGAGGTGTT ACAGGGATCTCTTCAGCAACTGAAGATAGCCCAAGGACGCTTCATTGAATCTACCGACAGTCTGAATAAG TTCAAAAAACCAGAATCTGAAGGAAAAGAAATTCTTGTCCCCTTGACATCTTCTCTATACGTTCCGGGCA AGTTGAAAGACATCAATAACGTTCTTATAGATATAGGCACAGGTTTCTACATAGAGAAGACGTTACCCCA AGCCCAAGGGTACTTCAAGAGAAAGGTTGACTTTGTCACTAAGCAGATGGAGAGGGTTCAGCCGGTATTG ATAGAGAAATCAAAGATGAGACAAGTTGTGACAGAGGTTATGAACATGAAGATTCAAGCTCAGATGTCCG CAACACAAGGTCAAGGGGTCAAGTCGTAGCAACCTTCGCTTTCGCTGTACTTACTCTACTTTGCATTTTG ATGTTTGTGAGCACCGGATTGTCTGGAGGTCTTTGTTTTTTTGTGTGTGAAATCGATGAGACGCTAGACC AATTCTGGCGCGCTCACAGTGGCCCCCAGTTATGGCGGTAGCATTGTGCAAGCTATTGGTCAGAGTAACT GTCATGTAGTGGTTGTCTTGTTCAGCAAAGTGCTTCTCCTATTGCTGGAACCACTAGGAGTATGTTGACC AATTTATGCCCGGATATGTTTGTATGTACTTTATTTCAATATTCACCCTTCTAAACCCAAAATATTATAG AAAAACAAGGAAGTTGTATAGGGGTCTCTCACCGATGCATATGACCTGGCCTAAAGCCGGGTACCGGAAA TTCAGTGTTGCGATTGTAGACAAAGATCTTATAGTGCCGTGCGCAGAGGTAGTAGGCAAGCCTTCAAAGC TGTGATGGATGACCAAAAAAACCTGAGAGAGAAATGCAGTTACCCAGTGCCGGGTTGACATGATTATGAC AACTGTACACGGCACAGTTAGTGACCATTATGCCATTTGATAAAGAATTCACGGTTATTTTATGTGGAAA AAAAAACTTACTGTGTATTTACAATGCGCGGCGTGATTGCTCACCAAACGCTCGCCTACTGCAATGGTGG TCGATCACGGGAAAACCTTATGGTCATTTGGTACTTTGATGTTTTACGATCGGAACCTATAGATTCTTGC ATAGAGTTCCCTTCCTAATGACAGGTTTTGTTATTTAAATTCAGTGACAAAAGTAAAAAGAGTCTGCTCA TACTATCACAGATAAACAAGAGTTTCCTCAGTGAGGCAGCCCTGTGCTAGGGGGTTCATTGGGTGAATCG TAGGGCTCCCTTTTGGGCAAACATTGAGGCAAAATGTTATGGCAGGTTTCTTTGCTACATCCCCAGTTAA AAAAACAAGATACACCTTCAAATGGTATTTTTTTTTATCAAAACAGGTCTGCCAAATTAGCCCACTTTAA ATGGTTTGTACATTACTTTGAATTTGTATTTCGTTAGTGATAATAAAACGTATGCAATCACGCGA	P. miniata
	GGEY02041739 >GGEY02041739\| -	P. miniata
	XM_022226054 >XM_022226054\|PREDICTED: Acanthaster planci prefoldin subunit 5-like (LOC110974427), mRNA TCATTACTTCTTTTGGCAACATGGCGGGTGGAAGCGGGGGGCCACAAGCAATCGACCTGATGCAATTGGCGCTTCCTCAGCTGAATATGCTGAAGGAGGAGATCGAACAGGAGGTAGAGATGTTGCAGGGATCCCTCCAGCAGCTGAAGATGGCGCAAGGACGCTTTGTGGAGTCCACTGAAAGTCTGAGCAAGTTTGATCCCAAATCAGAGGGAAAAGAAATTCTGGTACCGCTTACAGCATCTCTTTATATTCCTGGCAAGCTGAAAGACGTCAATAATGTTCTAATTGATATAGGCACCGGCTACTATGTAGAGAAGACGTTACCCCAAGCCCAGGAGTACTTCAAGAGGAAGGTGGACTTTGTCACCAAGCAAATGGAGCGGGTACAGCCAGTATTGATAGAGAAATCAAAGATGAGACAAGTTGTAACCGAGGTCATGAACATGAAGATTCAAGCGCAGATGTCCATGACACAAGGTCAAGGGGTCAAGTCGTAGCAACCTTTGGTCTTACCGTACTGTTCAGCCGTATTTTACTTTTTTGCGAGCATTGGACGTCAGCAAGCAGCTTTGAGCCCCGGTTGTCTTGCCTTTGTCTGGTCATTTTGCTCATTCCTTGAGAGACCAGAGCAAGCTTTGGTGTGACAATCATTCATCCAAAAGTCATAATTCCTCATGTTTTTAGTCTTGCAGTTCCTGCTCTTACCTGGCCCTGACAAGCCTAAATTTGATTTAGGATTGGCACCTGAAGCAGCTGTTGGAAATCAGCTGTTTGGCACAAACATCAGATGCGGAACTGTTTCACCTTGTGTCAGGCAATTTCTGCTGTTTTGTTTCTGTAATAGGGATATAATCAACTTGAAGCAAAGAACAGGTTGTGTACCTAGTGGTGTTATATGTGACTATCAGTACAGTGAAGAGGTAAAGAGTGAGACAGTATTTGGAAAGGAAAGTGTTAACAAAATGATGTAAATAAAAACTTCTTGATTAAGGCCGTTTTCCAAAATGGAAAAGTCACAGACTGTCCGCTAACTTTTCAGCACTAGATAAAAATGTGAAATATTTCAAAATAAAATATGAACACAAAGCTTGTAGAAACCGGAAAAAAATACATCCACAAAATTGGACCGACTAGGAGGATGAGATTGCAGAAAAAAGGGGGTTCTAGTCGGACTTGGTGATGTCTTGAGTATGTTACCTTTTGGTAAACATGCACCTGTTAATAAAAGTGGTGCAGTGGAGGAATGAATATAGGGGCGGAGCTAGGTCATTTAGGAGCTTGTTCACTCCTCGCCAGAAGTCCCTTGAAACGGCATGACGTTTTCAAGCCCAGGAGGTTCAGAGAAAGAGAAGGGAAGAAAAATGAAAGTAGAAGAGATTCCGTTTTTGTGAACACTGGAATGAGATGATTTTGTGAAGATTGGCACTGTCCCTGTCCAAATTTCTCTACTAAATCGTACAGGTGTGGTTATTGTTTGTACATTAATTTTGACTGTGCGTTTGTATTTTGCAACAATAAAATGTAAAAGTGACACAA	A. planci

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