LOC580966 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (26)

Nucleotides (25)

Interactants (80)

ECB-GENEPAGE-23157105

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for LOC580966 - Lytechinus variegatus

RefSeq mRNAs(2)

Models - Gene (1)

Models - mRNA (0)

mRNAs (3)

ESTs (0)

RefSeq mRNAs (2)

Accession	Version	name	Length	Protein	Species
XM_041602435 >LOC121410387 TGCCTGAGAAAGCCAAGATGGGAATGAAGCAAGTGAGCTCTTTAAATCAGGATCTTGGTCTGGAATAGGAAAACTACACATCACATCATAGGAGTTGCAGCATGTTCAGCCCATCCAAACTGCGACAGCATAACTCGTTGCCTAACTCTCCATGTTCTTTAAGATCTCATCATCATCACCACCATAGTTCATGTGGGCGGGGCAAGCTAGTGGAAGTACCCCTTTGGTTTCATGGTCTAATGGAGCGTAAGGTGGCTGAGGAACTACTTCTCAAGAGTCCTTTCAGAGGTCATACCAGTGGCAAAGAAGGATTGTTTTTAGTAAGACAAAGCAGTAATAGAGGAGGACATTTTGTGATATCTGTGTGTACCAGAAACCATTGCAATCATTACCTGATCGAGACCATTGAATCAATGTTCTATGTGAGGAGAGATCGGAGTGAGGACAGGGGGCGAGATATCCAGGCTTGTGATTTAAGAAACCTTATTCAGTGCTATAGAACAACTCCTCTTGATGAGTCAGGTCTGGTTCTTAAAGAACCCTTACTTCGAACAACTCCGGTTACGATCACTACATCTCTGTTGCCCTTACCTCAGCCTAGAGACAATCATAATTATATCCCTCTTCATGTAGAACACAAGGAGTATGTAGCAAACCAGGATTATGCTGCTCCTGATCCAGTAATGCTCTCATTCTGTGAAGGTGAACTCCTTACAGTTTTACAGAAAGACAACAAGAATTGGTGGTTTGGACATAATGACCGTAGGGAACTGGGTTACATCCCAGCTGCTCTGCTTAGGAGCTTGACTGAGTCACAACCTACAGAGAAAAGTGCCTTTTTGAATGCAGGGTATGTTGGGAATGAGGAAGCAACAAAGACTGATGCTGGAATTGATACATCATCCTTACCGCTCACAGACTGTAATTCAAACTTTATGAGTGAGAACCAGAACAAAGGTAACATTCATATGCAGAGGATACACACAGTGCCATGTGGCCTCACATTGCGAAACTGTGGAAATGAGGATATTTACGTTTCTAGTGAATATATCACAAGTTGCCTCGAGAACAGAGATCGATGGATGTCTCCAGAACTACCAAGACTGGGGGTCCTACGGTGTGTCTCTCCCAGGCAGTTGCAAAGACATTTATCAGAACCAACGGCATGGATTGACTTCTCTGTCAAACCTGAAAGGTTGATTGATGTAGAGCCACAAGATCTGATGCACTTCAGTGATATGTCACCAGATGTTTCACCAACGCATACATTCAGTGGTAGGCGCATTAGACATAAAGCAGCAAGGCAAAATAGTTCACCAGCTAGGGGTTCTAACATATCATCGTCAGCAGAATCATCACCAGTGCGAAGGAAAAAAGATTCCATGACAGATTACATGACTACAAGAGACTATGATCCAATTGAAACCTATCTAAGATTATCAGAATGTACTACTGGCCCTAGTCATCAGAAAAAGGGGAAAACAGGTAAATGAATACATTCTATGATTTTTGTTATTAAATTATATTTGAAAATGTTATTTTGATATGTGTGATTACAGATGATACTATTATCTTATGAGATATTAATTTGTATTAGCATCACAGAGAGGATGCTCATGAGCCTATGTATTTATATTTCATTTTTATATGTTATTACTGATTCAAATACAAAGTACTAAGTATTTATTAAACTATTTTTTTATCATCTACCGAAATGAATGATAAAATCATTTAGAGAGGCTGTTCTTTTTCATTTTAGACCATTCTAAATAAAGAACTTGAAACAACTGATCAAAGTCAGATTTATTTACAAGTCTAATGCTGGAAGATTGTAAGAACTGTTATCAAGGGAATTTAAAACTTTTGTATTTTTTTTAGTATTTACTTCTACTGACTTCTATTTAAAAACAGTATTGCCCAGGAACATGAAATATCTAAACAGTTATACAATTACCGTTTACTATAAATCTATAGCACATCATGTAAAAATGGTTGGTCAATTGATTATGTTACAGAGCCCATACATAATAAATGGGTCATGGTCGATCATTAAAAATTAATCTTTTTTGGTTCAGAAATGACTTGGAAATTAAAGGTAAAAATAGTAATTGCAGGAAACAATTATTTCATGAGAAAGTCTTTAAAATCAAGGTTAATTGTCACCATATTACATATATCTAGATCTGGTACATTAATGTAAACTTATCTTTGTGGAATCATAAAATCTTAGCCCAGAACCAATAATTCTGATTATCACTAACACAGAAAAGCGTATGTGGGACAGTGTATTCACATTGCTCGGAATAACACCCGACATTTGATGGAATTCCGTGCTTATTTCGCTCATTTCTCAGCAATTACATATTTTCTTCCAGAGCCACTTGGCACAT	XM_041602435.	XP_041458369.1 uncharacterized protein LOC121410387 isoform X2	2390 bp	XP_041458369	L. variegatus
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Models - Gene (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	3.0	LOC121410387 >LOC121410387 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variegatus

mRNAs based on gene models(0)

mRNAs from cDNA libraries (3)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_041602435 >XM_041602435\|XM_041602435.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus uncharacterized LOC121410387 (LOC121410387), transcript variant X2, mRNA TGCCTGAGAAAGCCAAGATGGGAATGAAGCAAGTGAGCTCTTTAAATCAGGATCTTGGTCTGGAATAGGAAAACTACACATCACATCATAGGAGTTGCAGCATGTTCAGCCCATCCAAACTGCGACAGCATAACTCGTTGCCTAACTCTCCATGTTCTTTAAGATCTCATCATCATCACCACCATAGTTCATGTGGGCGGGGCAAGCTAGTGGAAGTACCCCTTTGGTTTCATGGTCTAATGGAGCGTAAGGTGGCTGAGGAACTACTTCTCAAGAGTCCTTTCAGAGGTCATACCAGTGGCAAAGAAGGATTGTTTTTAGTAAGACAAAGCAGTAATAGAGGAGGACATTTTGTGATATCTGTGTGTACCAGAAACCATTGCAATCATTACCTGATCGAGACCATTGAATCAATGTTCTATGTGAGGAGAGATCGGAGTGAGGACAGGGGGCGAGATATCCAGGCTTGTGATTTAAGAAACCTTATTCAGTGCTATAGAACAACTCCTCTTGATGAGTCAGGTCTGGTTCTTAAAGAACCCTTACTTCGAACAACTCCGGTTACGATCACTACATCTCTGTTGCCCTTACCTCAGCCTAGAGACAATCATAATTATATCCCTCTTCATGTAGAACACAAGGAGTATGTAGCAAACCAGGATTATGCTGCTCCTGATCCAGTAATGCTCTCATTCTGTGAAGGTGAACTCCTTACAGTTTTACAGAAAGACAACAAGAATTGGTGGTTTGGACATAATGACCGTAGGGAACTGGGTTACATCCCAGCTGCTCTGCTTAGGAGCTTGACTGAGTCACAACCTACAGAGAAAAGTGCCTTTTTGAATGCAGGGTATGTTGGGAATGAGGAAGCAACAAAGACTGATGCTGGAATTGATACATCATCCTTACCGCTCACAGACTGTAATTCAAACTTTATGAGTGAGAACCAGAACAAAGGTAACATTCATATGCAGAGGATACACACAGTGCCATGTGGCCTCACATTGCGAAACTGTGGAAATGAGGATATTTACGTTTCTAGTGAATATATCACAAGTTGCCTCGAGAACAGAGATCGATGGATGTCTCCAGAACTACCAAGACTGGGGGTCCTACGGTGTGTCTCTCCCAGGCAGTTGCAAAGACATTTATCAGAACCAACGGCATGGATTGACTTCTCTGTCAAACCTGAAAGGTTGATTGATGTAGAGCCACAAGATCTGATGCACTTCAGTGATATGTCACCAGATGTTTCACCAACGCATACATTCAGTGGTAGGCGCATTAGACATAAAGCAGCAAGGCAAAATAGTTCACCAGCTAGGGGTTCTAACATATCATCGTCAGCAGAATCATCACCAGTGCGAAGGAAAAAAGATTCCATGACAGATTACATGACTACAAGAGACTATGATCCAATTGAAACCTATCTAAGATTATCAGAATGTACTACTGGCCCTAGTCATCAGAAAAAGGGGAAAACAGGTAAATGAATACATTCTATGATTTTTGTTATTAAATTATATTTGAAAATGTTATTTTGATATGTGTGATTACAGATGATACTATTATCTTATGAGATATTAATTTGTATTAGCATCACAGAGAGGATGCTCATGAGCCTATGTATTTATATTTCATTTTTATATGTTATTACTGATTCAAATACAAAGTACTAAGTATTTATTAAACTATTTTTTTATCATCTACCGAAATGAATGATAAAATCATTTAGAGAGGCTGTTCTTTTTCATTTTAGACCATTCTAAATAAAGAACTTGAAACAACTGATCAAAGTCAGATTTATTTACAAGTCTAATGCTGGAAGATTGTAAGAACTGTTATCAAGGGAATTTAAAACTTTTGTATTTTTTTTAGTATTTACTTCTACTGACTTCTATTTAAAAACAGTATTGCCCAGGAACATGAAATATCTAAACAGTTATACAATTACCGTTTACTATAAATCTATAGCACATCATGTAAAAATGGTTGGTCAATTGATTATGTTACAGAGCCCATACATAATAAATGGGTCATGGTCGATCATTAAAAATTAATCTTTTTTGGTTCAGAAATGACTTGGAAATTAAAGGTAAAAATAGTAATTGCAGGAAACAATTATTTCATGAGAAAGTCTTTAAAATCAAGGTTAATTGTCACCATATTACATATATCTAGATCTGGTACATTAATGTAAACTTATCTTTGTGGAATCATAAAATCTTAGCCCAGAACCAATAATTCTGATTATCACTAACACAGAAAAGCGTATGTGGGACAGTGTATTCACATTGCTCGGAATAACACCCGACATTTGATGGAATTCCGTGCTTATTTCGCTCATTTCTCAGCAATTACATATTTTCTTCCAGAGCCACTTGGCACAT	L. variegatus
	XM_041602434 >XM_041602434\|XM_041602434.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus uncharacterized LOC121410387 (LOC121410387), transcript variant X1, mRNA GGGACCTAATCTGTATGTAAATGAGGTTGGTGATTGAAGTTTGTTGAAGCATGGTATGCTGGTCGTTTTATGACCTCATATCCTGTGTGAGTGGGTGATGAGGGGTGAGGGGGAAAAAAAGATGAAAAAAAAACCTGAGAAGGTTAGCGGATGGAGTGTGGTTGACTGGCTTCATCTGTTCTCCCAGCTGTGTGGCCTGTGCTTCTCCATCAGCTTGTTAGATCGGAAGTCGCTTGGCATTCAGAGTGAATCTTCTGTGTGCTTATCATGCTCCGCAGGGGCTGCCCGATATTTATGACAGCTCAATTGTTTGCATGTGGGTCCTTACACAGGTTTAACAACACGTTTGAACTGAATAGACATTCGTACCAATAAAGCTCCAGGTTTATCACAGAGAGAGAAGCAGACATCAGTGGTGGAATTCTTTGGATGTAAGAATCTACATTGTAATTTTGGCTCTTGCTTTCCTCAAAACCATCCTGCAGCCAGGACTTCCTGTGCAATTCATCATAAGGAATGATCACAGCATGAACATCCAATGGAGCCTTGAGCCTTGCAATCTCTCATTTTGTCAGTGAAATATATCATTGGAATACTTGTCTTCAACTTTAGTTTGTTGAAGTATAAGGCAGTAGAAGACGTGCCTTACTCTCTTCAAACATGTATCGGTGATTCATGGCATCCCCAATCTACACAAAAGTTTCTTCCATGTGTCTCCCAGAAAATTTCTGCACCACGAGTTGCAGCATGTTCAGCCCATCCAAACTGCGACAGCATAACTCGTTGCCTAACTCTCCATGTTCTTTAAGATCTCATCATCATCACCACCATAGTTCATGTGGGCGGGGCAAGCTAGTGGAAGTACCCCTTTGGTTTCATGGTCTAATGGAGCGTAAGGTGGCTGAGGAACTACTTCTCAAGAGTCCTTTCAGAGGTCATACCAGTGGCAAAGAAGGATTGTTTTTAGTAAGACAAAGCAGTAATAGAGGAGGACATTTTGTGATATCTGTGTGTACCAGAAACCATTGCAATCATTACCTGATCGAGACCATTGAATCAATGTTCTATGTGAGGAGAGATCGGAGTGAGGACAGGGGGCGAGATATCCAGGCTTGTGATTTAAGAAACCTTATTCAGTGCTATAGAACAACTCCTCTTGATGAGTCAGGTCTGGTTCTTAAAGAACCCTTACTTCGAACAACTCCGGTTACGATCACTACATCTCTGTTGCCCTTACCTCAGCCTAGAGACAATCATAATTATATCCCTCTTCATGTAGAACACAAGGAGTATGTAGCAAACCAGGATTATGCTGCTCCTGATCCAGTAATGCTCTCATTCTGTGAAGGTGAACTCCTTACAGTTTTACAGAAAGACAACAAGAATTGGTGGTTTGGACATAATGACCGTAGGGAACTGGGTTACATCCCAGCTGCTCTGCTTAGGAGCTTGACTGAGTCACAACCTACAGAGAAAAGTGCCTTTTTGAATGCAGGGTATGTTGGGAATGAGGAAGCAACAAAGACTGATGCTGGAATTGATACATCATCCTTACCGCTCACAGACTGTAATTCAAACTTTATGAGTGAGAACCAGAACAAAGGTAACATTCATATGCAGAGGATACACACAGTGCCATGTGGCCTCACATTGCGAAACTGTGGAAATGAGGATATTTACGTTTCTAGTGAATATATCACAAGTTGCCTCGAGAACAGAGATCGATGGATGTCTCCAGAACTACCAAGACTGGGGGTCCTACGGTGTGTCTCTCCCAGGCAGTTGCAAAGACATTTATCAGAACCAACGGCATGGATTGACTTCTCTGTCAAACCTGAAAGGTTGATTGATGTAGAGCCACAAGATCTGATGCACTTCAGTGATATGTCACCAGATGTTTCACCAACGCATACATTCAGTGGTAGGCGCATTAGACATAAAGCAGCAAGGCAAAATAGTTCACCAGCTAGGGGTTCTAACATATCATCGTCAGCAGAATCATCACCAGTGCGAAGGAAAAAAGATTCCATGACAGATTACATGACTACAAGAGACTATGATCCAATTGAAACCTATCTAAGATTATCAGAATGTACTACTGGCCCTAGTCATCAGAAAAAGGGGAAAACAGGTAAATGAATACATTCTATGATTTTTGTTATTAAATTATATTTGAAAATGTTATTTTGATATGTGTGATTACAGATGATACTATTATCTTATGAGATATTAATTTGTATTAGCATCACAGAGAGGATGCTCATGAGCCTATGTATTTATATTTCATTTTTATATGTTATTACTGATTCAAATACAAAGTACTAAGTATTTATTAAACTATTTTTTTATCATCTACCGAAATGAATGATAAAATCATTTAGAGAGGCTGTTCTTTTTCATTTTAGACCATTCTAAATAAAGAACTTGAAACAACTGATCAAAGTCAGATTTATTTACAAGTCTAATGCTGGAAGATTGTAAGAACTGTTATCAAGGGAATTTAAAACTTTTGTATTTTTTTTAGTATTTACTTCTACTGACTTCTATTTAAAAACAGTATTGCCCAGGAACATGAAATATCTAAACAGTTATACAATTACCGTTTACTATAAATCTATAGCACATCATGTAAAAATGGTTGGTCAATTGATTATGTTACAGAGCCCATACATAATAAATGGGTCATGGTCGATCATTAAAAATTAATCTTTTTTGGTTCAGAAATGACTTGGAAATTAAAGGTAAAAATAGTAATTGCAGGAAACAATTATTTCATGAGAAAGTCTTTAAAATCAAGGTTAATTGTCACCATATTACATATATCTAGATCTGGTACATTAATGTAAACTTATCTTTGTGGAATCATAAAATCTTAGCCCAGAACCAATAATTCTGATTATCACTAACACAGAAAAGCGTATGTGGGACAGTGTATTCACATTGCTCGGAATAACACCCGACATTTGATGGAATTCCGTGCTTATTTCGCTCATTTCTCAGCAATTACATATTTTCTTCCAGAGCCACTTGGCACAT	L. variegatus
	GAUR01050621 >GAUR01050621\|GAUR01050621.1 TSA: Lytechinus variegatus AMR9006.36365.3.5 transcribed RNA sequence ACTTTCTCATGAAATAATTGTTTCCTGCAATTACTATTTTTACCTTTAATTTCCAAGTCATTTCTGAACCAAAAAAGATTAATTTTTAATGATCGACCATGACCCATTTATTAAGTATGAGCTCTGTAACATAATCAATTGACCAACCATTTTTACATGATGTGCTATAGATCTAAAGTAAACGGTAATTGTACAACTGTTTAGATATTTCATGTTCCTGGGCAATACTGTTTTTAAATAGAAGTCAGTAGACGTAAATACTAAAAAAATACAAAAGTTTTAAATTCCCTTGATAACATTTCTTACAATCTTCCAGCATTAGACTTGTAAATAAATCTGACTTTGATCAGTTGTTTCAAGTTCTTTATTTAGAATGGTCTAAAATGAAAAAGAACAGCCTCTCTAAATGATTTTATCATTCATTTCGGTAGATGATAAAAAAATAGTTTAATAAATACTTAGTACTTTGTATTTGAATCAGTAATAACATATAAAAATGAAATATAAATACATAGGCTCATGAGCATCCTCTCTGTGATGCTGAATTAATATCTCATAGGATAATAATATCAACTGTAATCACACATATCAAAATAACATTTTCAAATATAATTTAATAACAAAAATCATAGAATGTATTCATTTGCCTGTTTTCCCCTTTTTCTGATGACTAGGGCCAGTAGTACATTCTGATAATCTTAGATAGGTTTCAATTGGATCATAGTCTCTTGTAGTCATGTAATCTGTCATGGAATCTTTTTTCCTTCGCACTGGTGATGATTCTGCTGACGATGATATGTTAGAACCCCTAGCTGGTGAACTATTTTGCCTTGCTGCTTTATGTCTAATGCGCCTACCACTGAATGTATGCGTTGGTGAAACATCTGGTGACATATCACTGAAGTGCATCAGATCTTGTGGCTCTACATCAATCAACCTTTCAGGTTTGACAGAGAAGTCAATCCATGCCGTTGGTTCTGATAAATGTCTTTGCAACTGCCTGGGAGAGACACACCGTAGGACCCCCAGTCTTGGTAGTTCTGGAGACATCCATCGATCTCTGTTCTCGAGGCAACTTGTGATGTATTCACTAGAAACGTAAATATCCTCATTTCCACAGTTTCGCAATGTGAGGCCACATGGCACTGTGTGTATCCTCTGCATATGAATGTTACCTTTGTTCTGGTTCTCACTCATAAAGTTTGAATTACAGTCTGTGAGCGGTAAGGATGATGTATCAATTCCAGCATCAGTCTTTGTTGCTTCCTCATTCCCAACATACCCTGCATTCAAAAAGGCACTTTTCTCTGTAGGTTGTGACTCAGTCAAGCTCCTAAGCAGAGCAGCTGGGATGTAACCCAGTTCCCTACGGTCATTATGTCCAAACCACCAATTCTTGTTGTCTTTCTGTAAAACTGTAAGGAGTTCACCTTCACAAAATGAGAGCATTACTGGATCAGGAGCAGCATAATCCTGGTTTGCTACATACTCCTTGTGTTCTACATGAAGAGGGATATAATTATGATTGTCTCTAGGCTGAGGTAAGGGCAACAGAGATGTAGTGATCGTAACCGGAGTTGTTCGAAGTAAGGGTTCTTTAAGAACCAGACCTGACTCATCAAGAGGAGTTGTTCTATAGCACTGAATAAGGTTTCTTAAATCACAAGCCTGGATATCTCGCCCCCTGTCCTCACTCCGATCTCTCCTCACATAGAACATTGATTCAATGGTCTCGATGAGGTAATGATTGCAATGGTTTCTGGTACACACAGATATCACAAAATGTCCTCCTCTATTACTGCTTTGTCTTACTAAAAACAATCCTTCTTTGCCACTGGTATGACCTCTGAAAGGACTCTTGAGAAGTAGTTCCTCAGCCACCTTACGCTCCATTAGACCATGAAACCAAAGGGGTACTTCCACTAGCTTGCCCCGCCCACATGAACTATGGTGGTGATGATGATGAGATCTTAAAGAACATGGAGAGTTAGGCAACGAGTTATGCTGTCGCAGTTTGGATGGGCTGAACATGCTGCAACTCCTATGATGTGATGTGTAGTTTTCCTATTCCAGACCAAGATCCTGATTTAAAGAGCTCACTTGCTTCATTCCCATCTTGGCTTTCTCAGGCATAGCCTGTCTATTGTCCTTGACTGTACCATACCACATCCGATCACATGACCTACATGTTGCACATGAGCGCTCAAGCAAAGTGATGAAGCTGATTAATGTATTGCTGGGGTGTCACTGGGTCTCTTCCTGGCTGTTTTATTGTCAAGGTGATGAGGATTGCATCATTTGATCAAATCACCATCATTTACTGATTAAACTTCTTAAACCGGTAATGGCATAATACGTGACAGGAAAGGTCAGTTGATGATATACTGTCCTCAAGGCCAAGGTAACAGAGACACACTTCACATGGTTTCATCGGCCTCCACTGAGATGTCCTCCAGTCCCAACTATCCATATCTGTGTGAGGTATATTTTCCTATTCATCATCCTCTCTATCAGCTGAGCTCCACTGTCCTATTGTAAGTACA	L. variegatus

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