rpl23a Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (12)

Interactants (32)

ECB-GENEPAGE-23109296

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for rpl23a - All

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mRNAs (8)

ESTs (0)

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NCBI_REFSEQ/JGI	3.1	LOC588157 >LOC588157 aaaaatcaaaagcaggatgaacattttctgtaaaaaaataatccaAAAGTTCAAATATATTTACTGAATGATGTTACAACAGAAAagtattacatttgtttttatttttttgatgcTACTCAATCTTCAAATTGGATCGTCCTTTTTCGTTCAACATGGCTCCCAAGTCCAGAACTGATGGTATTTATCGATGAATTTCCATGATAATAAATggataaaataaagatttttactAAAAGCCACAGAAATCAAACTAAATTTAAACTGTTTGAGCTTTTGATAAGTcttgtttttattcatgaaaatgacGCCTTCTGTGTAAAATTACCCTTTATATGCAATTAGTTGAAGTCGTGAGTGTGTGCGTGATCTTGGGTGCTCGGTATCGCGGTACATGTGCACGTAAAACGTGTGTTCAGTAGTGTGCATGCACATGAGCTGAAGGGGACAGGGTGACCTAAGTTCGCGGAGATTTTGCAAATATTAGGAAATGTGATATTAGAGCTTTGGTTTCTCATACTCGAACAAAATGTCCTAGAAAAATGGTAATAGGTTCCTTTCCTAGTTGgggtagatctaggcctagatNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGAAAGTAAATTTTACGaggtagaaaatttgaaaggagTTCTCAATGTGCCTTGATCCTGTGCAAGTACTTGTAAACCTCTAGTTTACTTTAAGAATGTCATGCTGCAATTAcaaagtagatttttttttttctaggaagacaaaaatacaatatatttacGAAAGTAGATCTAAAAGGGCTTTTTGTGTTTCAAGGAAGTATGGAAATAACTACAGTTGTTgcatttaatgttattatttactttatactcttcatgatttttctttcatgtacGAAAGTGAACCGATGCACCTTCTTGTTACGTacaagatgaaataaaaaaattaacatggcTTGTGTTGATTTCTTTGACTTGCAGCTCAGCGAAGGGCTGGCAAGAAGGGCCCAGCCGTGCGAGAATCTGCTGCCAAGGTCGAGGCACGTGCAGAGGCCAAAGCCAAGGCCAAGGCCAAGCAAGATGCTCTCAAGGTAAGGAATCATGTAGTTTATATTCTAAATGTGTCAAACTCAAAGCAAAAGAGATTTCATACTGTTGAGCAGGTTCTTTCTATCAAACGACATAAATTTGTTATATAACTTGATAAATGGAGACATGTTTAACTGATGTAGCCATGTTTGTTTTACCGATATGTCACAACATGTACTTTATTGGTTTGTTCTTGCtcaagaatgattgaataaaataaaaaattggggggaaaatcGCATGTTTTGGATGGCTGCACCCAAATATCTTGGTAATGGGAATCAGTTTAAGGAATGTTATTGTCAAAACTAGGTAAGTCCAGCTTATATTTCAGGTAATGGTGATGAAAAAGATTTAAGAAGGGAAGTTGGCTGAAAGTAAGTCATTTATTATTGAGTAATTGAGCTATTTAGACcagcaaaatataaataaactaaCACACATTGAGGTCACTGGAAAAGCACATCATTAGAACATATATGGGACCACTTCTTTTGCTTATGGACAAGACTATTAGTTTAATTTTCATGCTATCACAACATTAGAATGTTGGCCGGGTTTTACAACGCAGTACAATGCTGGTACATATGAGAGACGCATTCATTTGCATCGGTCAGGATACTGCTGAATGAATATGAAGCATGGTTTGGCTCGTATTTTAAAACTCTTGAGATCCTAAgaataaagcaggtttgactgtatttgatttattttagaaTGCATCACTCCTTTGGAATTACTTTGTGCATCTTCCAACAACTCCTTTTGTCCTCTTCATCCACAGACTAAGAAAGCTGCCCTGCGTGGAACTCATGCAACTCGCAAGAGGAAGATCCACACCAAGGTGACCTTCCGTCGCCCCAAGACCTACAAGGCTGCTCGCGTGCCCAAATACACAAGGAAGAGTATCCCCAAGAGACCAAggtaaaaattactttaaatatCTTAATTGCAATCTCAGTAGAATTATGTTTTAGGGATGATAGGTTTCCTTTGATTGTTTTAAATTGCTCAATACCCCCACTTACACTGATTAAACCAACCTGACCCAAAAGTTCTTTCAATGTAATGTTTGAAACTGTCTGTTTGGGTGAATATAGaatgacatcatttttttcatggTCACGTACTAGTTGAGTGTGCCTTTGAGCTCTGGTAAGTTGCACAAGAGCCTCTTGCAAATTCATAGAAAACTGTGGAGAAAGAGTTGGAAATTACTGTGGAGTAATCTCACTTAAATTCCAGCCGATCAAAAAATggcccaaataaaaaaaaggtacGATTACACTGTCAACATTACAGTCCGGTTTGCTATTTGAAACGAGATGAAAAGGATCAAGCAAATTGCTTATTGCTTATCTTCTTTCTATGTGAATGTGTTGCATGCTTTTGAAGAGAAGTTCTAACCacagtcttctttttttcattgtcgCATTTATTTCTAAGGCTTGACCAGTTCAGCACCATCAAGTACCCCCTGACGACCGAGAGCGCCATGAAGAAGATCGAGGAGAACAACACCCTCGTCTTCATCGTTGCCCTCAAGGCAAACAAGTTCGCCGTCAAGACCGCGGTCAAGAAGCTCTACGACATCGATGTGGCCAAGGTCAACACGCTCATCAGGCCAGATGGACAGAAGAAGGCCTACGTCAGGTTAGCACCGGACTACGATGCCTTGGATGTTGCCAACAAGGTGAGCCAGAGTTTTAACTGAAGATTTGGGATTGTTCGTATGGCAGGGTTAATAGTAAAGAACCATGTTATTGCGCAAGAAATCACATGGCTGAAAACACGGTGttaatgtttgtgtgtgttattgggtttttacagacgtgtaactatcaatcagatatgattgtTTATGTCTGGGGACGGACCTTCCACGCCACCATCTAAAaaacgtgactcagtttcgaatcTGCGTCCTCGGccgaatcagtttgtaacttccatcgTTGGCTGGATTACAGGCACATGCCACATCAGAACGcccaatgataatgataatggtggcttcttcaTATGATGTCCTCCAAGATAAGTCATAGCTGGTGGCCAAATATGAagttacccatttacacctgagCTTAGTGTGGCGTAGGACGTTTCAAGTCTTGCCACCAAATGCAAGTCCTGGGCTGGTATCAAACCCTCGACCTtgggattgagagtcaagtgaatgaaccactataccacaacacATTCACAAGGTGTATTGCTGTGTTGCCGTGGAAAATGGCTACAAAGGGCACTAAAATAAATGGAGattggaaaatgaaaagaagagaagcaAAACAACTGAATTAAATGTTTCTCAAAGACAGTATCAAGCACTTAAAGACCTACACCTATTCTCTTAGACGGAATTGTCATCagcaaaaatgatatttttgtgttGAAATGAAAGACATCTCCAGTTCTGAAATTGcgtattcatattttctgacaTTGAATATGAGTGCACCTTTATGAAGTCCTTCTTTAAACGTGGTCATTTCatctgaaatatgttttttctgatatctTCAGCTCTTGTGAACCAATGCATATATATAGGGGTACGATTCTCACATATCAAGGCCATAAAGAGATAGTCCATTTAAtgtttgtattcctttttttctgctttcttgaCAGATCGGTATCATCTAAACAGTCCTACCAGCCTCAGGTTTGTGAAAGGAGACAGTAGCATTACGATCATTGGCACTGTTAAGAAAATAAACAGTGTATATAGGTAACAAAAGATGCAttgatttgtgttttgtt	S. purpuratus

Models - mRNA (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_030991923.1 >XM_030991923.1 TACTCAATCTTCAAATTGGTTCGTCCTTTTTCGTTCAACATGGCTCCTAAGTCGAGAACCGACGCTCAGCGAAGGGCTGGCAAGAAGGGCCCAGCCGTGCGAGAATCTGCTGCCAAGGTCGAGGCCCGTGCAGAGGCCAAAGCCAAGGCCAAGGCCAAGCAAGATGCTCTCAAGACTAAGAAAGCTGCCCTGCGTGGAACTCATGCAACTCGCAAGAGGAAGATCCACACCAAGGTGACCTTCCGTCGCCCTAAGACCTACAAGGCTGCTCGTGTGCCCAAATACACAAGGAAGAGTATCCCCAAGAGACCAAGGCTTGACCAGTTCAGCACCATCAAGTACCCCCTGACAACCGAGAGCGCCATGAAGAAGATCGAGGAGAACAACACCCTCGTCTTCATCGTTGCCCTCAAGGCAAACAAGTTCGCCGTCAAGACTGCGGTCAAGAAGCTCTACGACATCGATGTGGCCAAGGTCAACACGCTCATCAGGCCAGATGGACAGAAGAAGGCCTACGTCAGGTTAGCACCGGACTACGATGCCTTGGATGTTGCCAACAAGATTGGTATCATCTAAACAGCCGTACCAGCCTCAGGTTTGTGAAAGGAGACAGTAGCATTACGATCATTGGCACTGTTAAGAAAATAAACAGTGTATATAGGTAACAAA	S. purpuratus

mRNAs (8)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	JI442576 >JI442576\|>JI442576.1 TSA: Lytechinus variegatus isotig06574.Lvaragast mRNA sequence TGGCTCCCAAGTCAAGAACAGAGGCTCAGCGCAAGGCTGGCAAGAAGGGCCCAGCTCAGCGAGAATCTGC TGCTAAGGTTGAGGCCCGAGCTGAGGCCAAGGCAAAGGCCAAGGCTAAACAAGATGCACTCAAGACCAAG AAAGCTGCCCTTCGTGGAACCCATGCTACTCGCAAGAGGAAAATTCGCACCAAGGTGACATTCCGTCGTC CCAAGACCTTCAAGGCTCCTCGCCAACCCAAGTACCCAAGAAAGAGTATTCCCAGGAGACCAAGACTTGA CCAGTACAGCACGATCAAGTTTCCCCTGACGACAGAAAGCGCCATGAAGAAGATTGAGGAGAACAACACC TTGGTCTTTATCGTTGCTCTGAAGGCAAACAAATTCACCATCAAGACCGCCGTAAAGAAGCTCTACGACA TTGATGTGGCAAAGGTCAACACACTCATCAGGCCAGATGGACAGAAGAAGGCCTACGTCAGGCTAGCTCC AGACTATGATGCCTTAGATGTCGCCAACAAGATTGGTATTATCTAAACAGCCAGACCAGCCTCAGGTTTG TGATGGGAGACAGTAGCATTACGATCATTGGCACTGTTAACATAATAAACAGTGTAAATAGGTAACAAAA A	L. variegatus
	XM_041601131 >XM_041601131\|>XM_041601131.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus 60S ribosomal protein L23a-like (LOC121409255), mRNA GTTTGGCTCTTTGCGCAACTCTGCAAAGAGACTGCAAAGTGTTGCTGCCCTCTACTTTCGTTGCAACAGT CTTTTTCGTTCAACATGGCTCCCAAGTCAAGAACAGAGGCTCAGCGCAAGGCTGGCAAGAAGGGCCCAGC TCAGCGAGAATCTGCTGCTAAGGTTGAGGCCCGAGCTGAGGCCAAGGCAAAGGCCAAGGCTAAACAAGAT GCACTCAAGACCAAGAAAGCTGCCCTTCGTGGAACCCATGCTACTCGCAAGAGGAAAATTCGCACCAAGG TGACATTCCGTCGTCCCAAGACCTTCAAGGCTCCTCGCCAACCCAAGTACCCAAGAAAGAGTATTCCCAG GAGACCAAGACTTGACCAGTACAGCACGATCAAGTTTCCCCTGACGACAGAAAGCGCCATGAAGAAGATT GAGGAGAACAACACCTTGGTCTTTATCGTTGCCCTGAAGGCAAACAAATTCACCATCAAGACCGCCGTAA AGAAGCTCTACGACATTGATGTGGCAAAGGTCAACACACTCATCAGGCCAGATGGACAGAAGAAGGCCTA CGTCAGGCTAGCTCCAGACTATGATGCCTTGGATGTCGCCAACAAGATTGGTATTATCTAAACAGCCAGA CCAGCCTCAGGTTTGTGATGGGAGACAGTAGCATTACGATCATTGGCACTGTTAACATAATAAACAGTGT AAA	L. variegatus
	GAVU01000804 >GAVU01000804\| -	S. purpuratus
	XM_030991923 >XM_030991923\|>XM_030991923.1 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus 60S ribosomal protein L23a (LOC588157), mRNA TACTCAATCTTCAAATTGGTTCGTCCTTTTTCGTTCAACATGGCTCCTAAGTCGAGAACCGACGCTCAGC GAAGGGCTGGCAAGAAGGGCCCAGCCGTGCGAGAATCTGCTGCCAAGGTCGAGGCCCGTGCAGAGGCCAA AGCCAAGGCCAAGGCCAAGCAAGATGCTCTCAAGACTAAGAAAGCTGCCCTGCGTGGAACTCATGCAACT CGCAAGAGGAAGATCCACACCAAGGTGACCTTCCGTCGCCCTAAGACCTACAAGGCTGCTCGTGTGCCCA AATACACAAGGAAGAGTATCCCCAAGAGACCAAGGCTTGACCAGTTCAGCACCATCAAGTACCCCCTGAC AACCGAGAGCGCCATGAAGAAGATCGAGGAGAACAACACCCTCGTCTTCATCGTTGCCCTCAAGGCAAAC AAGTTCGCCGTCAAGACTGCGGTCAAGAAGCTCTACGACATCGATGTGGCCAAGGTCAACACGCTCATCA GGCCAGATGGACAGAAGAAGGCCTACGTCAGGTTAGCACCGGACTACGATGCCTTGGATGTTGCCAACAA GATTGGTATCATCTAAACAGCCGTACCAGCCTCAGGTTTGTGAAAGGAGACAGTAGCATTACGATCATTG GCACTGTTAAGAAAATAAACAGTGTATATAGGTAACAAA	S. purpuratus
	JT094954 >JT094954\|>JT094954.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.186040.0 mRNA sequence AAAAATCAAAAGCAGGATGAACATTTTCTGTAAAAAAATAATCCAAAAGTTCAAATATATTTACTGAATG ATGTTACAACAGAAAAGTATTACATTTGTTTTTATTTTTTTGATGCTACTCAATCTTCAAATTGGATCGT CCTTTTTCGTTCAACATGGCTCCCAAGTCCAGAACTGATGCTCAGCGAAGGGCTGGCAAGAAGGGCCCAG CCGTGCGAGAATCTGCTGCCAAGGTCGAGGCACGTGCAGAGGCCAAAGCCAAGGCCAAGGCCAAGCAAGA TGCTCTCAAGACTAAGAAAGCTGCCCTGCGTGGAACTCATGCAACTCGCAAGAGGAAGATCCACACCAAG GTGACCTTCCGTCGCCCCAAGACCTACAAGGCTGCTCGCGTGCCCAAATACACAAGGAAGAGTATCCCCA AGAGACCAAGGCTTGACCAGTTCAGCACCATCAAGTACCCCCTGACGACCGAGAGCGCCATGAAGAAGAT CGAGGAGAACAACACCCTCGTCTTCATCGTTGCCCTCAAGGCAAACAAGTTCGCCGTCAAGACCGCGGTC AAGAAGCTCTACGACATCGATGTGGCCAAGGTCAACACGCTCATCAGGCCAGATGGACAGAAGAAGGCCT ACGTCAGGTTAGCACCGGACTACGATGCCTTGGATGTTGCCAACAAGATCGGTATCATCTAAACAGTCCT ACCAGCCTCAGGTTTGTGAAAGGAGACAGTAGCATTACGATCATTGGCACTGTTAAGAAAATAAACAGTG TATATAGGTAACAAAAGATGCATTGATTTGTGTTTTGTT	S. purpuratus
	GAWB01012208 >GAWB01012208\|>GAWB01012208.1 TSA: Patiria miniata AMR9002.21368.0.1 transcribed RNA sequence GGTTCTAAATGACGTCACACTTCTGTACTCCATTGCATTCAAACCTGGAATATTAGAAGCTAAGACCAAT TATGTACATGTATCACTCAACACTCATTTAATCACGACAAATAAAATTGCTTCTGTTTTTTTCCTTTCCA CTGCTTGTGAGTGGATTTATTGTACAACTATGGAAAATTTATGAATTATTTTCTGTATGTGTTTTTTGTA CTTTTAAAGAACAGTAGGTTGGGGCTTCCAATTTCTCAGGTCGAGTTTAGTGATCCTGTCATGTTCCAGA AGTTTAGATGATGCCAATCTTGTTTGCAATGTCCAAGGCATCGTAGTCTGGGGCCAGTCTCACGTACGCC TTCTTCTGCCCATCAGGTCTGATGAGTGTGTTGACCTTGGCCACATCGATGTCGTACAGCTTCTTGACAG CCGTCTTGATCTGAAACTTGTTGGCCTTGAGTGCCGTGATGAAGACTAACGTGTTGTTCTCCTCGATCTT CTTCATGGCGCTCTCTGTGGTCAGGGGGTACTTGATGATGGTGAACTGGTCAAGCTTGGGCCGACTGGGC ACGCTCTTGCGGGGGTATTTGGGCTTCCTGGGCGTCTTGAGCGTCTTGGGTCGTCTGAAGGTGACCTGCT TGCGGACCTTCCTCTTACGGGTGGAGATGTTGCCACGGAGGGCAGCCTTCTTGGCCTTGAGTGCCTCAGC CTTAGCCTTGGACTTGGCCTCTTGCTTGGCTCTGGCTTCTACCTTGGCTGCAGGCTCGGCCTGTGCTGGC CCTTTCTTGCCCGTTTTGCGGAGAGCTTCTTTGCGAGCTTTTGGCCCCATCTTGGAAAAAAGAGCTCGCA AAGAAGCTCTCCGCA	P. miniata
	XM_038198927 >XM_038198927\|>XM_038198927.1 PREDICTED: Patiria miniata 60S ribosomal protein L23a-like (LOC119727037), mRNA CAAGGGTCAGCACGGGAAACCCGACTGCCAACATCCGGTCTCTTTTTTCCAAGATGGGGCCAAAAGCTCG CAAAGAAGCTCTCCGCAAAACGGGCAAGAAGGGGCCGGCACAGGCCGAGCCTGCAGCCAAGGTAGAAGCC AGAGCCAAGCAAGAGGCCAAGTCCAAGGCTAAGGCTGAGGCACTCAAGGCCAAGAAGGCTGCCCTCCGTG GCAACATCTCCACCCGTAAGAGGAAGGTCCGCAAGCAGGTCACCTTCAGACGACCCAAGACGCTCAAGAC GCCCAGGAAGCCCAAATACCCCCGCAAGAGCGTGCCCAGTCGGCCCAAGCTTGACCAGTTCACCATCATC AAGTACCCCCTGACCACAGAGAGCGCCATGAAGAAGATCGAGGAGAACAACACGTTAGTCTTCATCACGG CACTCAAGGCCAACAAGTTTCAGATCAAGACGGCTGTCAAGAAGCTGTACGACATCGATGTGGCCAAGGT CAACACACTCATCAGACCTGATGGGCAGAAGAAGGCGTACGTGAGACTGGCCCCAGACTACGATGCCTTG GACATTGCAAACAAGATTGGCATCATCTAAACTTCTGGAACATGACAGAATCACTAAACTCGACATGAGA AATTGGAAGCCCCAACCTACTGTTCTTTAAAAGTACAAAAAAACACATACAGAAAATAATTCATAAATTT TCCATAGTTGTACAATAAATCCACTCACAAGCAGTGGAAAGGAAAAAAACAGAA	P. miniata
	XM_022248933 >XM_022248933\|PREDICTED: Acanthaster planci 60S ribosomal protein L23a-like (LOC110986757), mRNA CAGAATTAATTCTAAAAAATACGAAGAGAGGTCAGCAAGAGAAACCCGGCTGTCTATTTCCGGTCTCTTTCATCCAAGATGGGGCCGAAAGCTCGCAAGGAAGCTCTGCGTAAAACAGGCAAGAAGGGGCCCGCGCAGAATGAGCCTGCAGCAAAGGTGGAGGCCAGAGCCAAGCAGGAGGCTAAGGCCAAGGCCAAGAGTGATGCACTCAAGGCCAAGAAGGCTGCCCTCCGCGGCAACATTGCCACCCGCAAGAGGAAGGTTCGCAAGCAGGTAACCTTCAGACGGCCCAAGACCCTCAAGACTCCCAGGAAGCCCAAGTACCCGCGCAAGAGCGTGCCCAATCGGCCGAAGCTTGACCAGTTCACCATCATCAAGTACCCTCTGACCACGGAGAGTGCCATGAAGAAGATCGAGGAGAACAACACGCTGGTCTTCATCACCGCCCTCAAGGCCAACAAGTTCCAGATCAAGACAGCCGTCAAGAAGCTGTACGACATTGACGTGGCCAAGGTCAACACACTCATCAGACCCGATGGGCAGAAGAAGGCCTATGTCAGACTGGCTCCAGACTATGACGCCTTGGACATTGCAAACAAAATTGGCATCATCTAAACCACTGGAACATGGCAGTTTCACCTCCTGGGCCATGGGATTTAGAAACCTCCTCAGTTAACTAAAATTTACCTGAAAACGCATGTAAGAGTCATTCAGTAATGTCCCATAGTGTACAATAAACCCACTCACAAGCGGTGGAACGGAAGAAAAGA	A. planci

ESTs (0)