sm30f Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (8)

Interactants (0)

ECB-GENEPAGE-23087898

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for sm30f - All

Models - Gene (3)

Models - mRNA (1)

mRNAs (4)

ESTs (0)

Models - Gene (3)

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Models - mRNA (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_791608.4 >XM_791608.4 ATAATGACGGATGAGGAACACATGAGTGAGCGATCTTCCATGTCATCTAAATGGAGAAGGAGACTTTCTAACAGCGGCAAGACGTTTGTATAAATAGGACCAGTACGACAGTTAAGACAGGATATACCACTATTGTAGTCGTTCGAGTTGGTCACATACAAAACCATTTCCAGTTTCCTCTTTACAGTTTTAGTCGAACCTCTTTCCGGGATTTTTGTCAAGAAGTCTCGCCCGTTTGAGAAGATGCGGGGTTTAGTTTGTGTGTTGGTGTGTCTAGCGGCTCTGGCTGATCAGACTCAAGGGCAGGTTGGACAACCGGTGCCAACTGGTGGCCAGCCCAGTGGACAACCGGTTACTCCTACAGGTGGACAACCAGTTACTCCAACAGGAGGACAAACGGGAACACCCTTTGGAACGACAGGACAACCAGGTACTACTGGAATGCCAGGACAAACGGGAATGCCGGGACAACCAGGACGTCCAGGACAACCAGGAATGCCAGGACAACCCGGTGTGCCAGGAGTACCCGGTGGGCAACCAGGACAACCTTTACAACCTCACGGCCACACGCCCCCAAACCACCCCATCACAGCTGGTCCCAATCTTAATGGCCCCGGAAAATGTCGCCCGAAGTGGACTGAATACAAAGGCCACTGCTATCTTTATTCAAGTGGCGCAGTCGAGCAGGTAGGGAATCCTGTGACACATCTTGGTGTCAACGCACAAGAAGGAAAGACCCAGGATGCGGCCAACCTGTTCTGTGCTTCTCAGCAGCTTGGCGCTACACTGGTGACACTCAATGATGTAGAGGAGAACGACTTTCTCTATAGCTGGGCTGTAGACATGATGGTTGAACCAGTCCCGGTGTGGATCGGTCTCCATGCCCACCCTACCCCGACCGGGTATGCGTGGCAGTGGTTCGACGAGAAAGAGCCAGTCCTCTTCACCAACTGGGATCGCCTTCCTGCACCTGTGGTCAGGGCTGGTTTAGGAGCAGTGCTGTTCGATGCTGACTTAACTGTGGTACCACCCAATGCAATCGAAATCAGCGGAAAATGGCTTCCGGTCGAAGGATTAGGACCGCAAGCTGAGCCTCTAGGGTTGATCTGCGAGTATTCCCTGCATGCTGGTCATATCCACACACCAACCGGAACCACCAACGGTTATGGGACAACTAAACTGCCAGCAACACCCTTCCAGCCTGTCTTGCTCAAAAACAATCCTGCTAACCTAAGAGATATTCTGAGAGGAGGACCTTTCGGAGGATCACAGCTCCATGAGGTACCACGAAAACCTGCCAGCTATAGGAAGAACCCCTACTTCGCTGTCCAGCCATAACTGCATCTTAAGCTGAACTATTTTATTTCCAGATTTCTCCATTCATACCGAGGACACCAAACCGGTGATAGCCCGAATTATGAATGACCTGTCCGTGAATGGTCAACATTATGGGTTGGTTTGGAGTCGGTTGAGAATGATTCCCTCTTTAACTTTCTGTTAACACTTCAACGGGAGTCGTAACACTTCCCAGGTACAATCTGTTATTAAGCTATCGTAGAGGGCGTCGTGCAAAGCACTGTAAGAAGGCATGTCTTTGCTTTTAAGGGTACTGTGTATAAAGCCGTTAAAAACAAAAGCAATTGCGACTGTCACACGAGCACCGGAGTCCATTGATGATGTTTGCGATAAATTGTTTTCTTAAAGCTACTACCTTGCTGTATACTGCATTTGACATTTACACCCTTTATCTCAATTGTAAGGCAAAATTGTATAGCTGTGTTCTCTCATAAAAGCAATTTCTGTCCTGTATGCAGAAGATGTCATATGACACTATTCATGTGACAATTTTAATATTTGTGTCAATTAATGCGCTGTAACGTGCGTGATCTATACGTTGTATCATTACTTCTTTGTAAATTGCATTATGAAGTAAAAATTAAAGAATTATTTCAGA	S. purpuratus

mRNAs (4)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_041597395 >XM_041597395\|>XM_041597395.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus 30 kDa spicule matrix protein alpha-like (LOC121406359), mRNA TGACGGACCGTCAACACACTTGAGTGTGACACCTTACATGTCACCTTAAAGAAGGAAGGGACAGTCGAAG GAAGATTGGTATAAATAGGACCACACTACAGGCGTGGCAGGATATGTAATCGCTGTCGTTGAAAGAACTG GCTTCCCTGCTGGAAAATTTTATGTTGTAGTTTTTACACGTTGAATATTTAGCAGACCATTTTGTGCATG ACTTTTTTGGAGGAAACTAGCCCATTTTTAAGAAGATGAGAGGTTTTATTTGTGTTTTCCTGTGTCTCGC GGTGTTCACTGCTCGATCGCAAGGACAGATCGGGCAACCTGTCCCACCAGGTGGTCCGCAAGGAGGTCCC GGTGGGCAGCCATTACCACCAGGTAGCCCACAAGGAGGCGTTCCAGGGACTCCCGGAGGACAGCCCACTT TCCCGCAAGGTGGTATGCCTGGAACCCCCGGGGGACAACCCAATTTCCCGCAAGGTGGCATGCCTGGAAC TCCCGGGGGACAACCCACTTTCCCGCAAGGTGGTGTGCCAGGAATTCCCGGAGGACAACCCAATTTCCCG CAAGGTGGTATGCCAGGAACTCCCGGAGGACAACCCAATTTCCCGCAAGGAGGCATGCCAGGAAATCCCG GAGGGCCAACAACTCGACCCCATCCTCCCAATTCAAATGGCCCCGGACGTTGCAACCCCGAATGGACCGA ATGGAGAAACAACTGCTACCTTTACTCCAGTGCAATGGTCAGAAAACACAACGCCACAGGCATCTTTCAT GAAACTGTCAACGAGGGCCTGACCCAGGACATGGCCAACGCGAAATGCGCACAGGAACACGCGGGAGCAT GCCTAGTGACAATCAACAGCCAAGCGGAAAACGATTTTCTCTTCGCCTGGGCGGTCAAGATGATGGGACA ACCGGTTCCAGTGTGGATCGGTCTTCATGCGAAACAAAACCCTACCGGTGTTCCAACGTGGGAATGGTAC GACGGGACGGTTCCCACCTTCTTCAACTGGGAAGAAGTGCCAGCGCCAGTAGCCACACCTGGAATGGGCG CAATGCTTTTCGATGCTGACCTCATCCCTACTGGGCCTGTCCCGCAAAATCCAGTCGAAATTACTGGAAA GTGGACTGCCGAGGTTGCCCACTCTATGGCGATGGGCGAGTACCTCGGAATGATCTGCAAGCATTCACTG GTGACAACGCCCACGGAAGCACCGACCACCACCGCGACCACCATCAACACCGCCACCACGAACACTGCTC TAACAACGACACCTGCAGCACCCACCACGGTAGCACCAACAACTACAGTCAGGCCAGTTATGCTGAACAA CAATCCAGCTCATCTTAGGGATGTCCTGAGGGGAGGGCGCTACGGTGGTTCAAGGCTCTTTGAGGTACCG CGAAGGCCTGCGAACTACAGACAGAATCCATACTATGCTGTTCGGCCATAGCCAATACGTTAGTCCGAAC TTTGTGAATTACGATAACCCAAGGATACCACAAATACCACAATGATGATTCGATGGTGAATGGGTTTGAT GATACTATACATTTATGATAACGATTGGTTTGATTATCGCCAATTGGGTGCGTCACATCACCTTCATTTA CATTTTATTTCCACTCATCAAAGTAAAAATACCGTTTCAGTGTATATTTTTGTGTGAATTAGTTGTGGTT AAACCATTTGCGAGTCTGGTCACGTGATCTTTCTTCAGAGAATACGCTGCTAAAGGCCTGGTCACACCGC CCGAGCGTTGTTGGAGCGGTCGTGGAGCGGTAGGAAGAAAGGGTCGAATTTCGCCACAAACTTGGGGGAA AAACCGAAAAAAACACAAAAACAATCGAAAACGGTGAACGGTAGCGAGCGGTGATGATTATTTTTCTCTC CGCTCAAC	L. variegatus
	XM_791608 >XM_791608\|>XM_791608.4 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus 30 kDa spicule matrix protein (LOC592067), mRNA ATAATGACGGATGAGGAACACATGAGTGAGCGATCTTCCATGTCATCTAAATGGAGAAGGAGACTTTCTA ACAGCGGCAAGACGTTTGTATAAATAGGACCAGTACGACAGTTAAGACAGGATATACCACTATTGTAGTC GTTCGAGTTGGTCACATACAAAACCATTTCCAGTTTCCTCTTTACAGTTTTAGTCGAACCTCTTTCCGGG ATTTTTGTCAAGAAGTCTCGCCCGTTTGAGAAGATGCGGGGTTTAGTTTGTGTGTTGGTGTGTCTAGCGG CTCTGGCTGATCAGACTCAAGGGCAGGTTGGACAACCGGTGCCAACTGGTGGCCAGCCCAGTGGACAACC GGTTACTCCTACAGGTGGACAACCAGTTACTCCAACAGGAGGACAAACGGGAACACCCTTTGGAACGACA GGACAACCAGGTACTACTGGAATGCCAGGACAAACGGGAATGCCGGGACAACCAGGACGTCCAGGACAAC CAGGAATGCCAGGACAACCCGGTGTGCCAGGAGTACCCGGTGGGCAACCAGGACAACCTTTACAACCTCA CGGCCACACGCCCCCAAACCACCCCATCACAGCTGGTCCCAATCTTAATGGCCCCGGAAAATGTCGCCCG AAGTGGACTGAATACAAAGGCCACTGCTATCTTTATTCAAGTGGCGCAGTCGAGCAGGTAGGGAATCCTG TGACACATCTTGGTGTCAACGCACAAGAAGGAAAGACCCAGGATGCGGCCAACCTGTTCTGTGCTTCTCA GCAGCTTGGCGCTACACTGGTGACACTCAATGATGTAGAGGAGAACGACTTTCTCTATAGCTGGGCTGTA GACATGATGGTTGAACCAGTCCCGGTGTGGATCGGTCTCCATGCCCACCCTACCCCGACCGGGTATGCGT GGCAGTGGTTCGACGAGAAAGAGCCAGTCCTCTTCACCAACTGGGATCGCCTTCCTGCACCTGTGGTCAG GGCTGGTTTAGGAGCAGTGCTGTTCGATGCTGACTTAACTGTGGTACCACCCAATGCAATCGAAATCAGC GGAAAATGGCTTCCGGTCGAAGGATTAGGACCGCAAGCTGAGCCTCTAGGGTTGATCTGCGAGTATTCCC TGCATGCTGGTCATATCCACACACCAACCGGAACCACCAACGGTTATGGGACAACTAAACTGCCAGCAAC ACCCTTCCAGCCTGTCTTGCTCAAAAACAATCCTGCTAACCTAAGAGATATTCTGAGAGGAGGACCTTTC GGAGGATCACAGCTCCATGAGGTACCACGAAAACCTGCCAGCTATAGGAAGAACCCCTACTTCGCTGTCC AGCCATAACTGCATCTTAAGCTGAACTATTTTATTTCCAGATTTCTCCATTCATACCGAGGACACCAAAC CGGTGATAGCCCGAATTATGAATGACCTGTCCGTGAATGGTCAACATTATGGGTTGGTTTGGAGTCGGTT GAGAATGATTCCCTCTTTAACTTTCTGTTAACACTTCAACGGGAGTCGTAACACTTCCCAGGTACAATCT GTTATTAAGCTATCGTAGAGGGCGTCGTGCAAAGCACTGTAAGAAGGCATGTCTTTGCTTTTAAGGGTAC TGTGTATAAAGCCGTTAAAAACAAAAGCAATTGCGACTGTCACACGAGCACCGGAGTCCATTGATGATGT TTGCGATAAATTGTTTTCTTAAAGCTACTACCTTGCTGTATACTGCATTTGACATTTACACCCTTTATCT CAATTGTAAGGCAAAATTGTATAGCTGTGTTCTCTCATAAAAGCAATTTCTGTCCTGTATGCAGAAGATG TCATATGACACTATTCATGTGACAATTTTAATATTTGTGTCAATTAATGCGCTGTAACGTGCGTGATCTA TACGTTGTATCATTACTTCTTTGTAAATTGCATTATGAAGTAAAAATTAAAGAATTATTTCAGA	S. purpuratus
	JT123298 >JT123298\|>JT123298.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.70606.0 mRNA sequence GAGTGAGCGATCTTCCATGTCATCTAAATGGAGAAGGAGACTTTCTAACAGCGGCAAGACGTTTGTATAA ATAGGACCAGTACGACAGTTAAGACAGGATATACCACTATTGTAGTCGTTCGAGTTGGTCACATACAAAA CCATTTCCAGTTTCCTCTTTACAGTTTTAGTCGAACCTCTTTCCGGGATTTTTGTCAAGAAGTCTCGCCC GTTTGAGAAGATGCGGGGTTTAGTTTGTGTGTTGGTGTGTCTAACGGCTCTGGCTGTGCAGACTCAAGGG CAGGTTGGACAACCGGTGCCAACTGGTGGCCAGCCCAGTGGACAACCGGTTACTCCTACAGGTGGACAAC CAGTTACTCCAACAGGAGGACAAACGGGAACACCCTTTGGAACGACAGGACAACCAGGTACTACTGGAAT GCCAGGACAAACGGGAATGCCGGGACAACCAGGACGTCCAGGACAACCAGGAATGCCAGGACAACCCGGT GTGCCAGGAGTACCCGGTGTGCAACCAGGACAACCATTACAACCTCACGGTCACACGCCCCCGAACCACC CCATCACAGCTGGTCCCAATCTTAATGGCCCCGGAAAATGTCGCCCGAAGTGGACTGAATACAAAGGCCA CTGCTATCTTTATTCAAGTGGCGCAGTCGAGCAGGTAGGGAATCCTGTGACCCATTTGGGTGTCAACGCA CAAGAAGGAAAGACCCAGGATGCGGCCAACCTATTCTGTGCTTCTCAGCAGATTGGGGCTACACTGGTGA CACTCAATGATGTAGAGGAGAACGACTTCCTCTATAGCTGGGCTGTAGACATGATGGTTGAACCAGTCCC GGTGTGGATCGGACTCCATGCCCACCCCACCCCTACTGGGTACGTGTGGCAGTGGTTCGACGAGAAAGAG CCAGTCCTCTTCACCAACTGGGATCGCCCTCCTGCACCTGTGGCCAGGGCTGGTTTAGGAGCAGTGCTGT TCGATGCTGACTTAACTGTGGTCCCACCCAATGCAATCGAAATCAGCGGAAAGTGGCTTCCGGTCGAAGG ATTAGGACCGCAAGCTGAGCCTCTAGGGTTGATCTGCGAGTATTCCCTGCATGCTGGTCATATCCACACA CCAACCGGAACCACCAACGGTTATGGGACAACTAAACTGCCAGCAACACCCTTCCAGCCTGTCTTGCTCA AAAACAATCCTGCTAACCTAAGAGATATTCTGAGAGGAGGACCTTTCGGAGGATCACAGCTCCATGAGGT ACCACGAAAACCTGCCAGCTATAGGAAGAACCCCTACTTCGCTGTCCAGCCATAAATGCATCTTAAGCTG AACTATTTTATTTCCAGATTTCTCCATTCATACCGAGGACACCAAACCGGTGATAGCCCGAATTAAGAAT GACCTGTCCGTGAATGGTCAACATTATGGGTTGGTTTGGAGTCGGTTGAGAATGATTCCCTCTTTAACTT TCTGTTAACACTTCAACGGGAGTCGTAACAATTCCCAGGTACAATCTGTTATTAAGCTATCGTAGAGGGC GTCGTGCAAAGCACTGTAAGAAGGCATGTCTTTGCTTTTAAGGGTACTGTGCATAAAGCCGTTAAAAACA AAAGCAATTGCGACTGTCACACGAGCACCGGAGTCCATTGATGATGTTTGCGATAAATTGTTTTCTTTAA GCAACTACCTTGCTGTATACTGCATTTGACATTTACACCCTTTATCTCAATTGTAAGGCAATATTGTATA GCTGTGTTTTCCCATAAAAGCAATTTCTGTCCTGTATGCAGAAGATGTCATATGACACTATTCATGTGAC ATTTTAACATTTGTGTCAATTAAGGCGCTGTAACGTGCGTGATCTATACGTTGTATTATTACTTCTTTGT AAATTGCATTGTGAAGTAAAAATTAAAGAATTATTTCAGATATCTAGTGTGCATTGATTCCTTTTTGTTT AAGGTAAACCGGTAAAGCTCATTCGAGAAAATCG	S. purpuratus
	GHFM01012480 >GHFM01012480\| -	S. purpuratus

ESTs (0)