rps20 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (13)

Interactants (26)

ECB-GENEPAGE-23060095

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for rps20 - All

Models - Gene (5)

Models - mRNA (1)

mRNAs (9)

ESTs (0)

Models - Gene (5)

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variegatus
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NCBI_REFSEQ/JGI	3.1	LOC576658 >LOC576658 GGCGCTCGTTCACTGAACACCGACGAAAAGCCGCTAGCTCACCTCTGTTCAATTTCTGCCAAATTCAGAGTTGATTAAGTCTGCTAGCATACATAAAACATGGTATGAATATTTTAGAGATGATATAGACCTCTACAAtaaaatgttagttttaaaaTCTACCAAAACGACAGAATTTATCCATGAATGAGTGCCAGTGATTGTGTGACTGGGTGACTGATGAAAGCGCTCACGTGTGTCTAGGTTATGGCCATGCCTATGGCAATGCCTGTGTAGTGCAGTGTAGACAGTCGAAATATTGTGTgcatgatggtggtggtggtggtggtggtggtgcgaGTCCATAGTTCGCTATCGCTAAAAATCGgaaagatttcgaaaatctgatgtCACCCATGGAAAGAGGAACTTTAAATTGTCGAGAGATGGAATTTTGGGGGGAATTTGGTGTGAAATTAGGGAAAATTTGACAAAAGATTTGCATATTTGCGTCCGTTCCAAAAAAGATTGGCGCTAATTaattcagaatcatatccatACTTGGACAATTCCGGCCTGGAgttaccctactaaaacataccaaaaattggctaaatcttcatcaattgttcaaataatggtcatgaattctaacctgtttcgtgtcaattttctaatccttttttgagtatttttcctaaaaacaaagacttataatTCTGTACACTTTCTCTTGGGATTCATGGCAAACTAccgcacaatacaattgcaatcGCATACTGTAGTCCGTACCGACTATGAGGTGCAGGTgctcgtgtgtgtgtgtgaagttAACAACCGTAATGATAAATTGCTTAGATAAGTTATTATGGCAATGAGATCATTCAGTAGTCGATAGACTCAGGTGAGGGTTTAAATTAAAACTCGTGAATTTGGCCTGGTGGGATCTCTTGTTGAGGAAAGACACTTATTGCAGTAGACCCTTGGTACGACATGTAAAAAGCAGGCCTGATAATTGCCGGATTTAGGaaaccaatttttattttcctcccAATTTTAcccatttttcctgatttttaccCTTGTccctattttccatttttttcccaattttttttactcaatGTTTTGCGATGCCAATGGGTTTTCCCccgaaacttttttttttttttacttaaggGAGGGTGGtcgaggaagaaaaaaaaagaaaagtaatatcacctttgaaaatgttgtcatccttctctctctctcaccgtAGGCTTACAGCAAGGATCCAATGAAGGGGCCAGTGGAGGAAGTCCCAGCCCATCGCATCCGCATCACCCTCACCAGCCGCAATGTCAAGAGCCTGGAGAAGGTGTGCGCAGATCTCAAGCGCGGAGCCCAGGAGAAGAACCTGAAGGTGAAGGGACCGGTCCGCATGCCGACCAAGACCCTGCGTATCACCACCAGGAAGACACCCTGTGGTGAAGGGTCCAAGACCTGGGATCGCTTCCAGATGCGCATCCACAAACGTCTCATCGACCTGGAGAGCCCCTCTGAGATCGTCAAGCAGATCGTATCCTTTtttcaccaataattattggaCTCGAGGAAATGttcttttctctgttttctttttttacgaGGATGGTATGAGTGGCATATGGTGTTATATTCAGGTTCAGTGAGTCTGGACTTCGGTTATGATACTTTGCATATAGATTGGACAGTTGTGAGGACAATGCATGTAGGAATTGgggtctggggggggggggggaagaaagtGGTAGATATGGACctggaaataaatgaagaatGCCAGTTTACCACAAGCAGATTTGTTGCATTGTTACAATCGTCATCTTACTGTCTTATGACAATCGCTCAAAAACGTGTatgcaaaaatattgtttataataGGTAAATAAGATACATAAATATCACACCATCTCATTTTCCTAGTATTTCAATCTCTGTATTGATTATCCTAATTTTGTaagaaatatgtaatttaattgatagttctttgttttctttcacacACAATGCTTTTCATAGACTGTATTCAATTGTGATACATAGTTTTTACTTTGTTATTGATccttgacctttgaactttacAGACCTCTATCAGCATCGAGCCTGGTGTCGAGGTTGAGGTCACCATCGCCGACGCTTAGATGCAACTATGTTACAAGCCTGGTGAACATCACGAAGGAGAACAACATCGGGCTATGGTTTTCTTGCACTTTCGTTATAACATCATCTGAATAAAGGCACAGAATTTGATTCTTGCTGtaatgacaaaaatgaatttgtggTTTAGAggagttctttttttttaatcttgcaTCTCTAGGGCCAGTATCCATTTTGTAACTAAGCAAATAACCCTGCTTTATAAAAGTAGTACTGTGGAAGCTTGTTATAACAATCTTCTTTTGGACAAGGAAGTTACTCTCTTATGCTTCTTTTTATGAAAACTTATTATGTTCGGCCTTTAC	S. purpuratus

Models - mRNA (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_776941.5 >XM_776941.5 ATTCACATGTATTGAGTTCTCTTTAGATCGGCGCTCGTTCACTGAACACCGACGAAAAGCCGCTAGCTCACCTCTGTTCAATTTCTGCCAAATTCAGAGTTGATTAAGTCTGCTAGCATACATAAAACATGGCTTACAGCAAGGATCCAATGAAGGGGCCAGTGGAGGAAGTCCCAGCCCATCGCATCCGCATCACCCTCACCAGCCGCAATGTCAAGAGCCTGGAGAAGGTGTGCGCAGATCTCAAGCGCGGAGCCCAGGAGAAGAACCTGAAGGTGAAGGGACCGGTCCGCATGCCGACCAAGACCCTGCGTATCACCACCAGGAAGACACCCTGTGGTGAAGGGTCCAAGACCTGGGATCGCTTCCAGATGCGCATCCACAAACGTCTCATCGACCTGGAGAGCCCCTCTGAGATCGTCAAGCAGATCACCTCTATCAGCATCGAGCCTGGTGTCGAGGTTGAGGTCACCATCGCCGACGCTTAGATGCAACCATGTTACAAGCCTGGTGAACATCACGAAGGAGAACAACATCGGGCTATGGTTTTCTTCCACGTTTGTTATAACATCTGAATAAAGGCACAGAATTTGATTCTTGCTGTGAT	S. purpuratus

mRNAs (9)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_041628486 >XM_041628486\|>XM_041628486.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus 40S ribosomal protein S20-like (LOC121431023), mRNA TTAACTCGTATACTGCAATCTCTTTAGATCGGCGCTCGTTGACAGAACACCGACGTGAAGTGGCTAGCTC ACCTCTGTTCAATTCCTGTCAAATTCCGAATTGATTAAGTCTGCTAGCATCCATAAAAACATGGCTTACA GCAAGGATCCAATGAAGGGACCCGTTGAGGAAGTCCCAGCCCATCGTATCCGCATCACCCTTACCAGCCG CAACGTCAAGAGCCTGGAGAAGGTGTGCGCTGATCTCAAGCGTGGTGCCCAGGACAAGAACCTGAAGGTG AAAGGACCCGTCCGTATGCCCACCAAGACCCTCCGCATCACCACCAGGAAGACGCCCTGTGGAGAAGGGT CCAAGACCTGGGATCGCTACCAGATGCGCATCCACAAGCGTCTCATCGACCTGGAGAGCCCCTCGGAGAT TGTCAAGCAGATTACCTCTATCAACATCGAGCCTGGCGTCGAGGTTGAGGTTACCATCGCTGATGCATAG ATGCAATGCTGTTGAAAGACGATCGTCTTCAGTTATGGGTTGATATTGTTTAAACATCATTTGAATAAAA AGCAAAGAATTTGATTCTTGCTGTAATGACAAAAATGAAAA	L. variegatus
	GAUR01013534 >GAUR01013534\|>GAUR01013534.1 TSA: Lytechinus variegatus AMR9006.26012.0.1 transcribed RNA sequence GATTTTTTTTTTTTCATTTTTGTCATTACAGCAAGAATCAAATTCTTTGCTTTTTATTCAAATGATGTTT AAACAATATCAACCCATAACTGAAGACGATCGTCTTTCAACAGCATTGCATCTATGCATCAGCGATGGTA ACCTCAACCTCGACGCCAGGCTCGATGTTGATAGAGGTAATCTGCTTGACAATCTCCGAGGGGCTCTCCA GGTCGATGAGACGCTTGTGGATGCGCATCTGGTAGCGATCCCAGGTCTTGGACCCTTCTCCACAGGGCGT CTTCCTGGTGGTGATGCGGAGGGTCTTGGTGGGCATACGGACGGGTCCTTTCACCTTCAGGTTCTTGTCC TGGGCACCACGCTTGAGATCAGCACACACCTTCTCCAGGCTCTTGACGTTGCGGCTGGTAAGGGTGATGC GGATACGATGGGCTGGGACTTCCTCAACGGGTCCCTTCATTGGATCCTTGCTGTAAGCCATGTTTTTATG GATGCTAGCAGACTTAATCAATTCGGAGTTTGACAGGAATTGAACAGAGGTGAGCTAGCCACTTCACGTC GGTGTTCTGTCAACGAGCGCCGATCTAAAGAGATTGCAGTACACGAGTTAACATGTGAGCATCATTCAGC GGGCATATTGTTCACACGAACGAGAAAAACTGCGCGTTGTCGCGGTGGCTACGCAATGTGAATTGGTGTC ATTCGTGTCGATAAATAAACTCAGCAATGGAAACAATACTCGG	L. variegatus
	GHFM01029595 >GHFM01029595\| -	S. purpuratus
	JT115344 >JT115344\|>JT115344.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.25838.1 mRNA sequence GGCGCTCGTTCACTGAACACCGACGAAAAGCCGCTAGCTCACCTCTGTTCAATTTCTGCCAAATTCAGAG TTGATTAAGTCTGCTAGCATACATAAAACATGGCTTACAGCAAGGATCCAATGAAGGGGCCAGTGGAGGA AGTCCCAGCCCATCGCATCCGCATCACCCTCACCAGCCGCAATGTCAAGAGCCTGGAGAAGGTGTGCGCA GATCTCAAGCGCGGAGCCCAGGAGAAGAACCTGAAGGTGAAGGGACCGGTCCGCATGCCGACCAAGACCC TGCGTATCACCACCAGGAAGACACCCTGTGGTGAAGGGTCCAAGACCTGGGATCGCTTCCAGATGCGCAT CCACAAACGTCTCATCGACCTGGAGAGCCCCTCTGAGATCGTCAAGCAGATCACCTCTATCAGCATCGAG CCTGGTGTCGAGGTTGAGGTCACCATCGCCGACGCTTAGATGCAACTATGTTACAAGCCTGGTGAACATC ACGAAGGAGAACAACATCGGGCTATGGTTTTCTTGCACTTTCGTTATAACATCATCTGAATAAAGGCACA GAATTTGATTCTTGCTGTAATGACAAAAATGAATTTGTGGTTTAGAGGAGTTCTTTTTTTTTAATCTTGC ATCTCTAGGGCCAGTATCCATTTTGTAACTAAGCAAATAACCCTGCTTTATAAAAGTAGTACTGTGGAAG CTTGTTATAACAATCTTCTTTTGGACAAGGAAGTTACTCTCTTATGCTTCTTTTTATGAAAACTTATTAT GTTCGGCCTTTAC	S. purpuratus
	XM_776941 >XM_776941\|>XM_776941.5 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus 40S ribosomal protein S20 (LOC576658), mRNA ATTCACATGTATTGAGTTCTCTTTAGATCGGCGCTCGTTCACTGAACACCGACGAAAAGCCGCTAGCTCA CCTCTGTTCAATTTCTGCCAAATTCAGAGTTGATTAAGTCTGCTAGCATACATAAAACATGGCTTACAGC AAGGATCCAATGAAGGGGCCAGTGGAGGAAGTCCCAGCCCATCGCATCCGCATCACCCTCACCAGCCGCA ATGTCAAGAGCCTGGAGAAGGTGTGCGCAGATCTCAAGCGCGGAGCCCAGGAGAAGAACCTGAAGGTGAA GGGACCGGTCCGCATGCCGACCAAGACCCTGCGTATCACCACCAGGAAGACACCCTGTGGTGAAGGGTCC AAGACCTGGGATCGCTTCCAGATGCGCATCCACAAACGTCTCATCGACCTGGAGAGCCCCTCTGAGATCG TCAAGCAGATCACCTCTATCAGCATCGAGCCTGGTGTCGAGGTTGAGGTCACCATCGCCGACGCTTAGAT GCAACCATGTTACAAGCCTGGTGAACATCACGAAGGAGAACAACATCGGGCTATGGTTTTCTTCCACGTT TGTTATAACATCTGAATAAAGGCACAGAATTTGATTCTTGCTGTGAT	S. purpuratus
	JT107892 >JT107892\|>JT107892.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.25838.0 mRNA sequence CGAAAAGCCGCTAGCTCACCTCTGTTCAATTTCTGCCAAATTCAGAGTTGATTAAGTCTGCTAGCATACA TAAAACATGGCTTACAGCAAGGATCCAATGAAGGGGCCAGTGGAGGAAGTCCCAGCCCATCGCATCCGCA TCACCCTCACCAGCCGCAATGTCAAGAGCCTGGAGAAGGTGTGCGCAGATCTCAAGCGCGGAGCCCAGGA GAAGAACCTGAAGGTGAAGGGACCGGTCCGCATGCCGACCAAGACCCTGCGTATCACCACCAGGAAGACA CCCTGTGGTGAAGGGTCCAAGACCTGGGATCGCTTCCAGATGCGCATCCACAAACGTCTCATCGACCTGG AGAGCCCCTCTGAGATCGTCAAGCAGATCACCTCTATCAGCATCGAGCCTGGTGTCGAGGTTGAGGTCAC CATCGCCGACGCTTAGATGCAACTATGTTACAAGCCTGGTGAACATCACGAAGGAGAACAACATCGGGCT ATGGTTTTCTTGCACTTTCGTTATAACATCATCTGAATAAAGGCACAGAATTTGATTCTTGCTGTAATGA CAAAAATGAATTTGTGGTTTAGAGGAGTTCTTTTTTTTTAATCTTGCATCTCTAGGGCCAGTATCCATTT TGTAACTAAGCAAATAACCCTGCTTTATAAAAGTAGTACTGTGGAAGCTTGTTATAACAATCTTCTTTTG GACAAGGAAGTTACTCTCTTATGCTTCTTTTTATGAAAACTTATTATGTTCGGCCTTTAC	S. purpuratus
	GGEY02043730 >GGEY02043730\| -	P. miniata
	XM_038201252 >XM_038201252\|>XM_038201252.1 PREDICTED: Patiria miniata 40S ribosomal protein S20-like (LOC119728844), mRNA TCAGAATTTGGGGCGTTTAAAGATCAAATAGTATTTTAAAAACAAAACAAACGGCATAGGACACAGCCTT TAGGCTAGTTTATTATAATTTCGTAATTTCAATAATAGCTGGTTTCCGCCTTTGTAATCAATACAAATGC GTAGAAAGAGTCCGTATGGATACCAGTGTTCCCATTCACCGGTCTTTTCCACGCTGCGTTTCCAGCGATA CGGACAACTCCCAAAGCCGCTAGCTCACCGCTGTTCAAATTTCTGTAATTTGTCAGGATTTGATTAAGTC GGCTAGCACTTGAAACCATGTCGCACTTCAAGGAACCAGGGAAAGGGGGACCAGCCGAGGAGTCCACCGC CCATCGCATCCGTATCACGCTGACGAGCCGAAATGTCAAGAACCTGGAAAAGGTGTGCGCTGATCTGAAG CGCGGGGCACAGGACAAGAACCTGGAAGTCAAGGGGCCGGTGCGCATGCCCACCAAGACGCTACGCATCA CTACCCGCAAGACGCCCTGCGGTGAAGGGTCCAAGACGTGGGACCGATACCAGATGCGCATCCACAAGCG ACTGATCGATCTCCAGAGCCCCTCTGAGATTGTCAAACAGATCACATCCATCAGCATTGAACCAGGTGTG GAGGTGGAAGTGACCATTGCCGATGCGTAAAGGATGCGCGAACTCGGCCCCGACCCGCACCCGGAATGGA TCGGAGGTGACCCCCACATCTCAGGCAATATCACTTGGTCATTTTGTCCATGAAGGTGGCATGAGATTTC ATTCCATACAAAAAAAATATTAATTTCCAATAAAGTCACAGTAAGATGTGAACTTGAAAAGGA	P. miniata
	XM_022233800 >XM_022233800\|PREDICTED: Acanthaster planci 40S ribosomal protein S20-like (LOC110978651), mRNA CAACAATTGACCTTTTCCACGCTGAACGTACAGCAGTGCGGTCAACTGAGTGTCGCTAGCTCACCGCTGTTCAATTTCTGTAATCTAACAGGACTTGATTAAGTCGGCTAGCACTCGAAACCATGTCATACTTCAAGGAACCAGGCAAGGGGGGACCAGCTGAAGAAAGCACAGCCCACCGCATCCGAATCACGCTGACAAGCCGAAATGTCAAGAATCTGGAAAAGGTGTGCGCTGATCTGAAGCGCGGAGCCCAGGACAAGAACCTGGAGGTCAAGGGCCCGGTGCGCATGCCTACCAAGACGTTACGCATCACCACCCGCAAGACGCCGTGCGGTGAGGGGTCCAAGACGTGGGACCGATACCAGATGCGTATCCACAAGCGGCTCATCGACCTCCAGAGTCCGTCAGAGATTGTCAAGCAGATTACGTCGATCAGCATTGAGCCAGGTGTAGAGGTCGAAGTCACCATCGCTGATGCATAAAGGACAAAGCTCAACCCTCCCCCATCCTCCTGACCCTATCCACAGAATCTGAAGTGACCTCCCACCCCTGGGCACACATCAGCACATCATTTGATTGAAATGGACGACATGGGATTTCAGTTCGTATAAAAACTTCCAATAAAGTTGCAACCACGTGTAAACTTGAAAAGGA	A. planci

ESTs (0)