sox2 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (15)

Nucleotides (12)

Interactants (85)

ECB-GENEPAGE-23054148

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for sox2 - Patiria miniata

Models - Gene (1)

Models - mRNA (0)

mRNAs (3)

ESTs (0)

Models - Gene (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	3.0	LOC119723839 >LOC119723839 ACGTGATATCCAAAGAGGGCTAAAAATAACGAGAGTTTCACACTGAACAGTCGCAGTTGTAGCGTAGCTCCCGTACGAAGAACGGCTATCGTCAGTAATTTCACGTTCGCTGAATACGTTTACAATCTGTGTTTTACTACCAAACTCAAAGCTCGATGTATAAGTCCACGTCGGAGATGATGGAGCAGACGGAGTTGAAGCCTAACATCAGTGTATCTTCGATGTCCAGCCCCACACAGTCCCTCAGCCAGGGGCATCACGGCCCACCTGGTACTCCCATCATGGTGGGCACACCCAACACCCCAAACAGTGGCGGTAAGAACACTCCTAATGACCGAGTCAAGCGGCCTATGAACGCCTTCATGGTGTGGTCTCGGGGCCAACGTCGTAAGATGGCCCAGGACAACCCCAAGATGCACAACTCCGAAATCAGCAAGCGACTTGGCGCCGAATGGAAGTTGCTGTCGGACGAAGAGAAACGACCATTCATCGATGAGGCCAAGCGTCTGCGGGCAGTCCACATGAAGGAGCATCCCGACTACAAGTACCGGCCACGCCGCAAGACGAAGACCCTGATGAAGAAAGAGAAGTACGCCCTACCAGGCATGATTTCACCGGGACAAGGACCACCAGGTATGCAGAGACAAGTACCTGAAGGTATGCAGGGTTACCACCATTTGAATGGTTACATGAATGGTGGATATCCTATGATGCAGCATGAACAGCTGCAACATTTGCAGGCCCACAGCTTCAGCGGCTCACAAATGGCCGGTAACACAGGACTCCATCCCCGCTACGACATGGCGGGACAGATCGCCTACCCACCCATGACATGCGCTCCAGGGTCGGCCTACCTGAATTCCGCCAGTTACACCACACCTTACGCCTCCCATGTCCAAATGCAACAGCCCTCGTCCAAGGCAGAGCAAGTGTCAGACCGGGCAGCTGCCGTGGCTGCTGCACGAAACATGCCCGGTGATTCGTTGAAAGAGATGATCAGCATGTACCTGCCAGGAACTGACTCTAACGACCCAAACACACAGAGACAACACGCAGCGGCCATGCAGGCAGCTTACCATCAGAGTGTGGCCGGTGCCAACGGGACAGTCCCATTAACACACATGTAAGACACAAACATTTTTTGTGATACTAGTATAGTGAACGGGCACTATAAACGCCATTTTAAGACACTAGAACTTTGGACTTGAGTTGCCTTTACCGATTTCCACGCGGACAATGTGGTCGGGTTGGCAGGTTTTGGGAGTCTTCCCGCGCTGTATATTTTGTAACATTTTTGAGTACACGGGGTCAAGTTAAACCCGCAGACGTGTGTTATTTTATACATAAAATGCTAACACAAGAGTTTACACCCTAAAAATGCTGTACCTTGATTTAATTTATCTTGGATTGTTCAGTTTTTAAGCTCGGCTTTGCAAAGTTCTGTGTAAATTTCGGCAACCATTTTAGTATTTCAGTTTGAAGCGAGTGTTCTTTAGTAACTAGAGTGGCTATATTTTCACCTACGCAAAGTTGGTTTGTTAAATGGCCGTGCTAAGTTTGGAATTGTGATAGTGGATTGTAAAGTTTGTTAAAAATGTCATCTTCTGAATGCCTACAAAAATTCAAACTAATGGTTTTGCCATTTATTTTTTGTTAACTTTGTATAACTGTTTGAATTGAATTTGAGGGCATTGGCCCCAAAGATAACCATATTTTTTTGTATATATTTGCACAGTTGTAATTTAGACTTTGTTTGCCTTCACTGAGACTCAGTCTTGCACAAAAAATGTGAAATGACTGACCCACATTAAAATAATTATTTTTACTTCAAGCTGTACAGAAATAACCAGACATTGCTTGTTTTGCCACACTGGGAAATCCCCCGACCGCCAAACTTTAAGCCTTAAGATTTCGTTTCAATGTCTCACTCGTATGTATTGAAAGCAGAAGAATTGCTTTTATGCCGTCTATTCAACGCAACGTTGGGCATCCCCGTGCGGTTGAATTGTAAATGCTAGACTGGCCCATTGATATTTATCCACACTAAATATTGTTTCATCATGGAGGACCTATGGACTGTAGGGGACAATGGCGCGCTTTTTTGCCTTCACAATGGCGGAGTGACAATGGAAACAATGCAGTATTTGGACGAGGGAACCCCTCGCCTTGTTAGTAGCCACTTCGCTTGGGTTCGCGCTCAGAGTACACATTTTTTTTCATGATTTGGCTTTGGATAAGCGCTGTCATGTGGTTTATAGTTAAATGCAACTAACGAGGTGGATGGTTTCCGATTTTAAACGGTGCTTCGCATTTTCAGCGGTGCATTATAAAACAAATTATTTGAATTAGTTTATAGTTGTGTTATATACTTTGGGTGGTTTATTTGGAGGTTTTACCTATCATGTTGCTTTTTAATTGTGACACATCATCACTTGAGTCATAAACTGAAAGTTATAGCTAGTTAGATAATTCTTGTATTTCCATGTTACTAACGATTTTCAATTGCGCTCTGTCAAATTTCATTTCAAATTTGATGACTTCTGTTTGTCTTAAGGAAATAAACGGGCTGAATGCCATTTGTAATGTCAGGGTAAAATCAA	P. miniata

Models - mRNA (0)

mRNAs (3)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_038194718 >XM_038194718\|>XM_038194718.1 PREDICTED: Patiria miniata transcription factor Sox-3-like (LOC119723839), mRNA ACGTGATATCCAAAGAGGGCTAAAAATAACGAGAGTTTCACACTGAACAGTCGCAGTTGTAGCGTAGCTC CCGTACGAAGAACGGCTATCGTCAGTAATTTCACGTTCGCTGAATACGTTTACAATCTGTGTTTTACTAC CAAACTCAAAGCTCGATGTATAAGTCCACGTCGGAGATGATGGAGCAGACGGAGTTGAAGCCTAACATCA GTGTATCTTCGATGTCCAGCCCCACACAGTCCCTCAGCCAGGGGCATCACGGCCCACCTGGTACTCCCAT CATGGTGGGCACACCCAACACCCCAAACAGTGGCGGTAAGAACACTCCTAATGACCGAGTCAAGCGGCCT ATGAACGCCTTCATGGTGTGGTCTCGGGGCCAACGTCGTAAGATGGCCCAGGACAACCCCAAGATGCACA ACTCCGAAATCAGCAAGCGACTTGGCGCCGAATGGAAGTTGCTGTCGGACGAAGAGAAACGACCATTCAT CGATGAGGCCAAGCGTCTGCGGGCAGTCCACATGAAGGAGCATCCCGACTACAAGTACCGGCCACGCCGC AAGACGAAGACCCTGATGAAGAAAGAGAAGTACGCCCTACCAGGCATGATTTCACCGGGACAAGGACCAC CAGGTATGCAGAGACAAGTACCTGAAGGTATGCAGGGTTACCACCATTTGAATGGTTACATGAATGGTGG ATATCCTATGATGCAGCATGAACAGCTGCAACATTTGCAGGCCCACAGCTTCAGCGGCTCACAAATGGCC GGTAACACAGGACTCCATCCCCGCTACGACATGGCGGGACAGATCGCCTACCCACCCATGACATGCGCTC CAGGGTCGGCCTACCTGAATTCCGCCAGTTACACCACACCTTACGCCTCCCATGTCCAAATGCAACAGCC CTCGTCCAAGGCAGAGCAAGTGTCAGACCGGGCAGCTGCCGTGGCTGCTGCACGAAACATGCCCGGTGAT TCGTTGAAAGAGATGATCAGCATGTACCTGCCAGGAACTGACTCTAACGACCCAAACACACAGAGACAAC ACGCAGCGGCCATGCAGGCAGCTTACCATCAGAGTGTGGCCGGTGCCAACGGGACAGTCCCATTAACACA CATGTAAGACACAAACATTTTTTGTGATACTAGTATAGTGAACGGGCACTATAAACGCCATTTTAAGACA CTAGAACTTTGGACTTGAGTTGCCTTTACCGATTTCCACGCGGACAATGTGGTCGGGTTGGCAGGTTTTG GGAGTCTTCCCGCGCTGTATATTTTGTAACATTTTTGAGTACACGGGGTCAAGTTAAACCCGCAGACGTG TGTTATTTTATACATAAAATGCTAACACAAGAGTTTACACCCTAAAAATGCTGTACCTTGATTTAATTTA TCTTGGATTGTTCAGTTTTTAAGCTCGGCTTTGCAAAGTTCTGTGTAAATTTCGGCAACCATTTTAGTAT TTCAGTTTGAAGCGAGTGTTCTTTAGTAACTAGAGTGGCTATATTTTCACCTACGCAAAGTTGGTTTGTT AAATGGCCGTGCTAAGTTTGGAATTGTGATAGTGGATTGTAAAGTTTGTTAAAAATGTCATCTTCTGAAT GCCTACAAAAATTCAAACTAATGGTTTTGCCATTTATTTTTTGTTAACTTTGTATAACTGTTTGAATTGA ATTTGAGGGCATTGGCCCCAAAGATAACCATATTTTTTTGTATATATTTGCACAGTTGTAATTTAGACTT TGTTTGCCTTCACTGAGACTCAGTCTTGCACAAAAAATGTGAAATGACTGACCCACATTAAAATAATTAT TTTTACTTCAAGCTGTACAGAAATAACCAGACATTGCTTGTTTTGCCACACTGGGAAATCCCCCGACCGC CAAACTTTAAGCCTTAAGATTTCGTTTCAATGTCTCACTCGTATGTATTGAAAGCAGAAGAATTGCTTTT ATGCCGTCTATTCAACGCAACGTTGGGCATCCCCGTGCGGTTGAATTGTAAATGCTAGACTGGCCCATTG ATATTTATCCACACTAAATATTGTTTCATCATGGAGGACCTATGGACTGTAGGGGACAATGGCGCGCTTT TTTGCCTTCACAATGGCGGAGTGACAATGGAAACAATGCAGTATTTGGACGAGGGAACCCCTCGCCTTGT TAGTAGCCACTTCGCTTGGGTTCGCGCTCAGAGTACACATTTTTTTTCATGATTTGGCTTTGGATAAGCG CTGTCATGTGGTTTATAGTTAAATGCAACTAACGAGGTGGATGGTTTCCGATTTTAAACGGTGCTTCGCA TTTTCAGCGGTGCATTATAAAACAAATTATTTGAATTAGTTTATAGTTGTGTTATATACTTTGGGTGGTT TATTTGGAGGTTTTACCTATCATGTTGCTTTTTAATTGTGACACATCATCACTTGAGTCATAAACTGAAA GTTATAGCTAGTTAGATAATTCTTGTATTTCCATGTTACTAACGATTTTCAATTGCGCTCTGTCAAATTT CATTTCAAATTTGATGACTTCTGTTTGTCTTAAGGAAATAAACGGGCTGAATGCCATTTGTAATGTCAGG GTAAAATCAA	P. miniata
	JX844802 >JX844802\|>JX844802.1 Patiria miniata SoxB1 mRNA, complete cds TTCACACTGAACAGTCGCAGTTGTAGCGTAGCTCCCGTACGAAGAACGGCTATCGTCAGTAATTTCACGT TCGCTGAATACGTTTACAATCTGTGTTTTACTACCAAACTCAAAGCTCGATGTATAAGTCCACGTCGGAG ATGATGGAGCAGACGGAGTTGAAGCCTAACATCAGTGTATCTTCGATGTCCAGCCCCACACAGTCCCTCA GCCAGGGGCATCACGGCCCACCTGGTACTCCCATCATGGTGGGCACACCCAACACCCCAAACAGTGGCGG TAAGAACACTCCTAATGACCGAGTCAAGCGGCCTATGAACGCCTTCATGGTGTGGTCTCGGGGCCAACGT CGTAAGATGGCCCAGGACAACCCCAAGATGCACAACTCCGAAATCAGCAAGCGACTTGGCGCCGAATGGA AGTTGCTGTCGGACGAAGAGAAACGACCATTCATCGATGAGGCCAAGCGTCTGCGGGCAGTCCACATGAA GGAGCATCCCGACTACAAGTACCGGCCACGCCGCAAGACGAAGACCCTGATGAAGAAAGAGAAGTACGCC CTACCAGGCATGATTTCACCGGGACAAGGACCACCAGGTATGCAGAGACAAGTACCTGAAGGTATGCAGG GTTACCACCATTTGAATGGTTACATGAATGGTGGATATCCTATGATGCAGCATGAACAGCTGCAACATTT GCAGGCCCACAGCTTCAGCGGCTCACAAATGGCCGGTAACACAGGACTCCATCCCCGCTACGACATGGCG GGACAGATCGCCTACCCACCCATGACATGCGCTCCAGGGTCGGCCTACCTGAATTCCGCCAGTTACACCA CACCTTACGCCTCCCATGTCCAAATGCAACAGCCCTCGTCCAAGGCAGAGCAAGTGTCAGACCGGGCAGC TGCCGTGGCTGCTGCACGAAACATGCCCGGTGATTCGTTGAAAGAGATGATCAGCATGTACCTGCCAGGA ACTGACTCTAACGACCCAAACACACAGAGACAACACGCAGCGGCCATGCAGGCAGCTTACCATCAGAGTG TGGCCGGTGCCAACGGGACAGTCCCATTAACACACATGTAAGACACAAACATTTTTTGTGATACTAGTAT AGTGAACGGGCACTATAAACGCCATTTTAAGACACTAGAACTTTGGACTTGAGTTGCCTTTACCGATTTC CACGCGGACAATGTGGTCGGGTTGGCAGGTTTTGGGAGTCTTCCCGCGCTGTATATTTTGTAACATTTTT GAGTACACGGGGTCAAGTTAAACCCGCAGACGTGTGTTATTTTATACATAAAATGCTAACACAAGAGTTT ACACCCTAAAAATGCTGTACCTTGATTTAATTTATCTTGGATTGTTCAGTTTTTAAGCTCGGCTTTGCAA AGTTCTGTGTAAATTTCGGCAACCATTTTAGTATTTGAGTTTGAAGCGAGTGTTCTTTAGTAACTAGAGT GGCTATATTTTCACCTACGCAAAGTTGGTTTGTTAAATGGCCGTGCTAAGTTTGGAATTGTGATAGTGGA TTG	P. miniata
	GAWB01033029 >GAWB01033029\|>GAWB01033029.1 TSA: Patiria miniata AMR9002.33870.0.2 transcribed RNA sequence GTCAAGAACGCTCGCGCTGATTGGCCAAAGCCGGAATAATTCTCCCTCTGCCAATCAATTACACATGGAC GTGATATCCAAAGAGGGCTAAAAATAACGAGAGTTTCACACTGAACAGTCGCAGTTGTAGCGTAGCTCCC GTACGAAGAACGGCTATCGTCAGTAATTTCACGTTCGCTGAATACGTTTACAATCTGTGTTTTACTACCA AACTCAAAGCTCGATGTATAAGTCCACGTCGGAGATGATGGAGCAGACGGAGTTGAAGCCTAACATCAGT GTATCTTCGATGTCCAGCCCCACACAGTCCCTCAGCCAGGGGCATCACGGCCCACCTGGTACTCCCATCA TGGTGGGCACACCCAACACCCCAAACAGTGGCGGTAAGAACACTCCTAATGACCGAGTCAAGCGGCCTAT GAACGCCTTCATGGTGTGGTCTCGGGGCCAACGTCGTAAGATGGCCCAGGACAACCCCAAGATGCACAAC TCCGAAATCAGCAAGCGACTTGGCGCCGAATGGAAGTTGCTGTCGGACGAAGAGAAACGACCATTCATCG ATGAGGCCAAGCGTCTGCGGGCAGTCCACATGAAGGAGCATCCCGACTACAAGTACCGGCCACGCCGCAA GACGAAGACCCTGATGAAGAAAGAGAAGTACGCCCTACCAGGCATGATTTCACCGGGACAAGGACCACCA GGTATGCAGAGACAAGTACCTGAAGGTATGCAGGGTTACCACCATTTGAATGGTTACATGAATGGTGGAT ATCCTATGATGCAGCATGAACAGCTGCAACATTTGCAGGCCCACAGCTTCAGCGGCTCACAAATGGCCGG TAACACAGGACTCCATCCCCGCTACGACATGGCGGGACAGATCGCCTACCCACCCATGACATGCGCTCCA GGGTCGGCCTACCTGAATTCCGCCAGTTACACCACACCTTACGCCTCCCATGTCCAAATGCAACAGCCCT CGTCCAAGGCAGAGCAAGTGTCAGACCGGGCAGCTGCCGTGGCTGCTGCACGAAACATGCCCGGTGATTC GTTGAAAGAGATGATCAGCATGTACCTGCCAGGAACTGACTCTAACGACCCAAACACACAGAGACAACAC GCAGCGGCCATGCAGGCAGCTTACCATCAGAGTGTGGCCGGTGCCAACGGGACAGTCCCATTAACACACA TGTAAGACACAAACATTTTTTGTGATACTAGTATAGTGAACGGGCACTATAAACGCCATTTTAAGACACT AGAACTTTGGACTTGAGTTGCCTTTACCGATTTCCACGCGGACAATGTGGTCGGGTTGGCAGGTTTTGGG AGTCTTCCCGCGCTGTATATTTTGTAACATTTTTGAGTACACGGGGTCAAGTTAAACCCGCAGACGTGTG TTATTTTATACATAAAATGCTAACACAAGAGTTTACACCCTAAAAATGCTGTACCTTGATTTAATTTATC TTGGATTGTTCAGTTTTTAAGCTCGGCTTTGCAAAGTTCTGTGTAAATTTCGGCAACCATTTTAGTATTT GAGTTTGAAGCGAGTGTTCTTTAGTAACTAGAGTGGCTATATTTTCACCTACGCAAAGTTGGTTTGTTAA ATGGCCGTGCTAAGTTTGGAATTGTGATAGTGGATTGTAAAGTTTGTTAAAAATGTCATCTTCTGAATGC CTACAAAAATTCAAACTAATGGTTTTGCCATTTATTTTTTGTTAACTTTGTATAACTGTTTGAATTGAAT TTGAGGGCATTGGCCCCAAAGATAACCATATTTTTTGTATATATTTGCACAGTTGTAATTTAGACTTTTG TTTGCCTTCACTGAGACTCAGTCTTGCACAAAAAATGTGAAATGACTGACCCACATTAAAATAATTATTT TTACTTCAAGCTGTACAGAAATAACCAGACATTGCTTGTTTTGCCACACTGGGAAATCCCCCGACCGCCA AACTTTAAGCCTTAAGATTTCGTTTCAATGTCTCACTCGTATGTATTGAGAGCAGAAGAATTGCTTTTAT GCCGTCTATTCAACGCAACGTTGGGCATCCCCGTGCGGTTGAATTGTAAATGCTAGACTGGCCCATTGAT ATTTATCCACACTAAATATTGTTTCATCATGGAGGACCTATGGACTGTAGGGGACAATGGCGCGCTTTTT TGCCTTCACAATGGCGGAGTGACAATGGAAACAATGCAGTATTTGGACGAGGGAACCCCTCGCCTTGTTA GTAGCCACTTCGCTTGGGTTCGCGCTCAGAGTACACATTTTTTTTTCATGATTTGGCTTTGGATAAGCGC TGTCATGTGGTTTATAGTTAAATGCAACTAACGAGGTGGATGGTTTCCGATTTTAAACGGTGCTTCGCAT TTTCAGCGGTGCATTATAAAACAAATTATTTGAATTAGTTTATAGTTGTGTTATATACTTTGGGTGGTTT ATTTGGAGGTTTTACCTGTCATGTTGCTTTTTAATTGTGACACATCATCACTTGAGTCATAAACTGAAAG TTATAGCTAGTTAGATAATTCTTGTATTTCCATGTTACTAACGATTTTCAATTGCGCTCTGTCAAATTTC ATTTCAAATTTGATGACTTCTGTTTGTCTTAAGGAAATAAACGGGCTGAATGCCATTTGTAATGTCAGGG TAAAATCAACTATGGTTATGCTTTCTTGTTTTTCCTTTTAATTGTTAAACACAGCATTCAACAAAATATT TTTCACCGTTACATTTTTATAGTTTATAAAAGTTCGAAATTCTACCCCCACAAAATTAGAAAGAAGCACA TTGATTTTCCTTTTTCATAGATACTTAAAGTATGAATGGTGTCCAATGAAAACCTATGTTAACCAAGAGT GAAAAGATAATTCAATGTTTCCGTGAATGAGGTGGGGTATGGGTTTCTTTATGAAAGGGGTGATGGCGCA TTTCTTTCACAAAGCTTCTTGATCACTCTAATTGAACATTTTTTGGTTCAAATAGTTTTCTTTGTTAAGT TAAGCAAATTATTTCACAAATATGAACTTATTTGGAAATTAAGTATTTCTTCGGTTTGAAGACGATATAC AACCTATCGGTGGCGAATGGGTTAGAACTGACTTGCCAAA	P. miniata

ESTs (0)