LOC589020 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (1)

Nucleotides (20)

Interactants (1)

ECB-GENEPAGE-23048967

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for LOC589020 - Patiria miniata

RefSeq mRNAs(2)

Models - Gene (1)

Models - mRNA (0)

mRNAs (3)

ESTs (0)

RefSeq mRNAs (2)

Accession	Version	Protein Name	Length	Protein	Species
XM_038200583 >LOC119728366 ACCTCTTGAGGGCGCAATGTCAGTACACTGTTGGTCGTCTGCTGCGTGCGTTTGTGTGTGGAACCATAATTGCTTCAAATGCTTGTGTGGATGGGAAGGTTTTTTGAGAGGACTTTGACAAGAAATGAGCCTAGAGTCCAATGTGTAGTCCACAGGATCGCATTGAGACACTGATTGGTCATTTGCGAGAAGGCTGCGAAGTTCAGCTGAATGAGACAGCCATGGCCAACAGCCCACTGACCACCCATGTACTAGACACAGCTCTCGGACGACCGGCTCAGAACCTTAACATTGACGTATTCTTCCAGAGATCCGACTCGCAGGAATTTGACATCATCGCAAAGGGGAAAACAAACAACGATGGCAGGGCTCCAGGCCTACTGACTCAGGCTCAGTTTGTGTCTGGTGTCTATAAGATCAAGTTTGATACTGGTAACTACTTCAAGTCCATCAACACCAGAGGTTTCTACCCCTATGTAGAGATTGTGTTTGAGATAGTGGACCCTAGCCAACACTACCACGTGCCGTTACTACTGAGTCCTTACTCCTACAGCACCTATAGAGGGAGCTAGACAGCAGACAGGAGGTGTGAAATGGGGAGGGGCTATGAGTAGGATTAAATGGGGGGGGGGGGGCCAATAGCAATTATATTCTCATATTGTCATAATCCTGGGAACCGAACCATTAGTGGTAGATGGAATATTAAAGCAAGTAGTCTCTTTTCCCCAGATCGAGTAGACCCTCACATCTGCCGTTGCCTTTTGATGAAGAAGGGACAGAAATTATTCTTAATAGTTGCGTTCATGTACCTGACTAAAAACAATCTCCTGCCTTTTGTGAATTTTTAAGTTGATCCTAAACCTCATGATCTCGTATCTCTTTCCTCCCTCCTTCCCCTATACCCCAACCCAAATAAGGTCTGCTGACATTGCTTGGAAGATTTAAAGGGGAAATAAAGACTTTACCAAGGTTTTTATTGAATATATATATGTATCACTGTAAAATTTCATTTTAAAAATTTTACCATAAAAATTTATTTAAATCAAAGTCACATAATTCAGGTTATTTAAGGTGGAAAGGAAAATTAGTCGAAGAGAAAATTGTATTGGTATTAATTTACTCCTGTAGTTTTTATTGATCATAACTGTTTAATTAAGAATCTGAAGTTTTCCAAATGACTTTTTTTGTGAATGTTTGTTTGATAAATTACTTATTTAATGTTTGTTAAAATAAAAGACATTTGTATTTGAACATA		XP_038056511.1 5-hydroxyisourate hydrolase-like isoform X2	1255 bp	XP_038056511	P. miniata
XM_038200582 >LOC119728366 ACCTCTTGAGGGCGCAATGTCAGTACACTGTTGGTCGTCTGCTGCGTGCGTTTGTGTGTGGAACCATAATTGCTTCAAATGCTTGTGTGGATGGGAAGGTTTTTTGAGAGGACTTTGACAAGAAATGAGCCTAGAGTCCAATGTGTAGTCCACAGGATCGCATTGAGACACTGATTGGTCATTTGCGAGAAGGCTGCGAAGTTCAGTCAACCCCTCACCCTGTTCAGCTGAATGAGACAGCCATGGCCAACAGCCCACTGACCACCCATGTACTAGACACAGCTCTCGGACGACCGGCTCAGAACCTTAACATTGACGTATTCTTCCAGAGATCCGACTCGCAGGAATTTGACATCATCGCAAAGGGGAAAACAAACAACGATGGCAGGGCTCCAGGCCTACTGACTCAGGCTCAGTTTGTGTCTGGTGTCTATAAGATCAAGTTTGATACTGGTAACTACTTCAAGTCCATCAACACCAGAGGTTTCTACCCCTATGTAGAGATTGTGTTTGAGATAGTGGACCCTAGCCAACACTACCACGTGCCGTTACTACTGAGTCCTTACTCCTACAGCACCTATAGAGGGAGCTAGACAGCAGACAGGAGGTGTGAAATGGGGAGGGGCTATGAGTAGGATTAAATGGGGGGGGGGGGGCCAATAGCAATTATATTCTCATATTGTCATAATCCTGGGAACCGAACCATTAGTGGTAGATGGAATATTAAAGCAAGTAGTCTCTTTTCCCCAGATCGAGTAGACCCTCACATCTGCCGTTGCCTTTTGATGAAGAAGGGACAGAAATTATTCTTAATAGTTGCGTTCATGTACCTGACTAAAAACAATCTCCTGCCTTTTGTGAATTTTTAAGTTGATCCTAAACCTCATGATCTCGTATCTCTTTCCTCCCTCCTTCCCCTATACCCCAACCCAAATAAGGTCTGCTGACATTGCTTGGAAGATTTAAAGGGGAAATAAAGACTTTACCAAGGTTTTTATTGAATATATATATGTATCACTGTAAAATTTCATTTTAAAAATTTTACCATAAAAATTTATTTAAATCAAAGTCACATAATTCAGGTTATTTAAGGTGGAAAGGAAAATTAGTCGAAGAGAAAATTGTATTGGTATTAATTTACTCCTGTAGTTTTTATTGATCATAACTGTTTAATTAAGAATCTGAAGTTTTCCAAATGACTTTTTTTGTGAATGTTTGTTTGATAAATTACTTATTTAATGTTTGTTAAAATAAAAGACATTTGTATTTGAACATA		XP_038056510.1 5-hydroxyisourate hydrolase-like isoform X1	1276 bp	XP_038056510	P. miniata

Models - Gene (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	3.0	LOC119728366 >LOC119728366 ACCTCTTGAGGGCGCAATGTCAGTACACTGTTGGTCGTCTGCTGCGTGCGTTTGTGTGTGGAACCATAATTGCTTCAAATGCTTGTGTGGATGGGAAGGTTTTTTGAGGTAACTAATTGATTTCGGTTTTCCCTGAAATTTGGCAGTAATGATGAAAAATGTGACCTAGCCTTTATAACTGAGAATGGGTTTAGATGGGATGCCAAGATTTTGGAGTTCCAAGGTGTTGGACCAGACCGGCTGGGGGCGCgggcgggcggggggggggggggggggggcaaagcggATATCTGTGTCTTCCTTGCACCTTACCTTGGTTGGTGCCTACTTATTTTAGGCCTGTCATTGTCTGTACTAAGTTCTAGTCTGTGGAATAGACTGCAAAGGTCTATGACATTGATATGCCAGTGGATTCGGtgatgcaaaacaagactgcgtcttgacttGACATCGAGATTCcgaccattcagcaggcgccttgtatcgggtcttccgtaacccgttgtgttacaaaaacatttcaTCAAATTTTACCAATCAACAGttaagtccacatttctgattgtTTCCGAAAAATGTATGCACcggtaggccccccccccccccacaccccaaGTTTAAATCTAGTAATGTACGCCACCAGACATCGACAGTGCACACAGCACAGCATAACATTTCCCCATCCTTCTGATGCATCTGTGAAAGGGaacattgtaggcctacatggtcAGTCTGCCTAACGTTTCGCCATATCATGTCTAACAGCTGAAAAACGCAGGGACATGAACCCTAACACCTGTTGAACAGTGACTTACTCttttaatgtgttttgttttctagAGGACTTTGACAAGAAATGAGCCTAGAGTCCAATGTGTAGTCCACAGGATCGCATTGAGACACTGATTGGTCATTTGCGAGAAGGCTGCGAAGTTCAGGTAGGGCCTGGATTACAGTCAGCGGTGTTCCTAAGCaggacactttaccacaattgcttCACTCTCTGAGAATCTGgcttttatacaacgcctgaataaatcccctcCATGTGATtgatgggtcgttgatcacgtgtcattgactTATGCTCCCAAACAATAGTCCCAAAGCCGAGAAGTTCCACTCTATAGTACTAGTTCAATACCAATCAGatacgaggatttattcaggcattgtataaAATGAGTGTTAAATTTTAATACAGGTTTTGAAAGATGGATAAAGATACGGCCCACAGTGTGACTGTAGGAAATATGTTGGGTTCCAAAATATAACTCTCATCAGGAGTAACGGTTTTTACCGGggaattctgtaaaaaaaatttaaagaagatttttttttcgttctgtTGCAGTCAACCCCTCACCCTGTTCAGCTGAATGAGACAGCCATGGCCAACAGCCCACTGACCACCCATGTACTAGACACAGCTCTCGGACGACCGGCTCAGAACCTTAACATTGACGTATTCTTCCAGAGATCCGACTCGCAGGAATTTGACATCATCGCAAAGGGGTATAGTACTGAAAAATCACAGTGTTGAAAGATGCCTATCAACttagcaaatttaaaaaaaaaactaaaaatgaatttgaatgtaAACATTTTATAAAGATTTCTATGACTGTATTATGCAAACATTgagtgtgtggtttttttttttaaaggtattttccttttttttcttctaaataagTGTTTGGAAGGACTTTCAGGCTGATAAATTTTGGGTTCTTGTTGCAGGAAAACAAACAACGATGGCAGGGCTCCAGGCCTACTGACTCAGGCTCAGTTTGTGTCTGGTGTCTATAAGATCAAGTTTGATACTGGTAACTACTTCAAGTCCATCAACACCAGAGGTTTCTACCCCTATGTAGAGGTAACAGCAAAATCAGTCTTTCTTCTTCCAAACACCTTTCTTGTTGACTTGGTGCCCTTATTCTGCAATGCACTTCTCATTTGGCTTGAACTTatagggaataaacaacatttgctttcttctgtaattttcagaaatggatggatttggggggttagtattttatagaaaatatagtccagtaaggtatttcataataatttggttgttttgttttctgatgtttgcaaatgtatattttctttGACAACTGACCTTTTGTCCTCTGACAGACTCGGTCAAGTCTAGCCTtgtttaaataattatttttgaatGGCATATCATGCTGTATAATGTTGTGTTATTGGTCTTTTTTTGCAGATTGTGTTTGAGATAGTGGACCCTAGCCAACACTACCACGTGCCGTTACTACTGAGTCCTTACTCCTACAGCACCTATAGAGGGAGCTAGACAGCAGACAGGAGGTGTGAAATGGGGAGGGGCTATGAGTAGgattaaatgggggggggggggccaatagCAATTATATTCTCATATTGTCATAATCCTGGGAACCGAACCATTAGTGGTAGATGGAATATTAAAGCAAGTAGTCTCTTTTCCCCAGATCGAGTAGACCCTCACATCTGCCGTTGCCTTTTGATGAAGAAGGGACAGAAATTATTCTTAATAGTTGCGTTCATGTACCTGACTAAAAACAATCTCCTGCCTTTTGTGAATTTTTAAGTTGATCCTAAACCTCATGATCTCGTATCTCTTTCCTCCCTCCTTCCCCTATACCCCAACCCAAATAAGGTCTGCTGACATTGCTTGGAAGATTTAAAGGGGAAATAAAGACTTTACCAAGGTTTTTATTGAATATATATATGTATCACtgtaaaatttcattttaaaaattttaccataaaaatttatttaaatcaaagtcaCATAATTCAGGTTATTTAAGGTGGAAAGGAAAATTAGTCGAAGAGAAAATTGTATTGGTATTAATTTACTCCTGTAGTTTTTATTGATCATAACTGTTTAATTAAGAATCTGAAGTTTTCCAAATgactttttttgtgaatgtttgtttgATAAATTACTTATTTaatgtttgttaaaataaaagaCATTTGTATTTGAACATA	P. miniata

mRNAs based on gene models(0)

mRNAs from cDNA libraries (3)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_038200583 >XM_038200583\|XM_038200583.1 PREDICTED: Patiria miniata 5-hydroxyisourate hydrolase-like (LOC119728366), transcript variant X2, mRNA ACCTCTTGAGGGCGCAATGTCAGTACACTGTTGGTCGTCTGCTGCGTGCGTTTGTGTGTGGAACCATAATTGCTTCAAATGCTTGTGTGGATGGGAAGGTTTTTTGAGAGGACTTTGACAAGAAATGAGCCTAGAGTCCAATGTGTAGTCCACAGGATCGCATTGAGACACTGATTGGTCATTTGCGAGAAGGCTGCGAAGTTCAGCTGAATGAGACAGCCATGGCCAACAGCCCACTGACCACCCATGTACTAGACACAGCTCTCGGACGACCGGCTCAGAACCTTAACATTGACGTATTCTTCCAGAGATCCGACTCGCAGGAATTTGACATCATCGCAAAGGGGAAAACAAACAACGATGGCAGGGCTCCAGGCCTACTGACTCAGGCTCAGTTTGTGTCTGGTGTCTATAAGATCAAGTTTGATACTGGTAACTACTTCAAGTCCATCAACACCAGAGGTTTCTACCCCTATGTAGAGATTGTGTTTGAGATAGTGGACCCTAGCCAACACTACCACGTGCCGTTACTACTGAGTCCTTACTCCTACAGCACCTATAGAGGGAGCTAGACAGCAGACAGGAGGTGTGAAATGGGGAGGGGCTATGAGTAGGATTAAATGGGGGGGGGGGGGCCAATAGCAATTATATTCTCATATTGTCATAATCCTGGGAACCGAACCATTAGTGGTAGATGGAATATTAAAGCAAGTAGTCTCTTTTCCCCAGATCGAGTAGACCCTCACATCTGCCGTTGCCTTTTGATGAAGAAGGGACAGAAATTATTCTTAATAGTTGCGTTCATGTACCTGACTAAAAACAATCTCCTGCCTTTTGTGAATTTTTAAGTTGATCCTAAACCTCATGATCTCGTATCTCTTTCCTCCCTCCTTCCCCTATACCCCAACCCAAATAAGGTCTGCTGACATTGCTTGGAAGATTTAAAGGGGAAATAAAGACTTTACCAAGGTTTTTATTGAATATATATATGTATCACTGTAAAATTTCATTTTAAAAATTTTACCATAAAAATTTATTTAAATCAAAGTCACATAATTCAGGTTATTTAAGGTGGAAAGGAAAATTAGTCGAAGAGAAAATTGTATTGGTATTAATTTACTCCTGTAGTTTTTATTGATCATAACTGTTTAATTAAGAATCTGAAGTTTTCCAAATGACTTTTTTTGTGAATGTTTGTTTGATAAATTACTTATTTAATGTTTGTTAAAATAAAAGACATTTGTATTTGAACATA	P. miniata
	XM_038200582 >XM_038200582\|XM_038200582.1 PREDICTED: Patiria miniata 5-hydroxyisourate hydrolase-like (LOC119728366), transcript variant X1, mRNA ACCTCTTGAGGGCGCAATGTCAGTACACTGTTGGTCGTCTGCTGCGTGCGTTTGTGTGTGGAACCATAATTGCTTCAAATGCTTGTGTGGATGGGAAGGTTTTTTGAGAGGACTTTGACAAGAAATGAGCCTAGAGTCCAATGTGTAGTCCACAGGATCGCATTGAGACACTGATTGGTCATTTGCGAGAAGGCTGCGAAGTTCAGTCAACCCCTCACCCTGTTCAGCTGAATGAGACAGCCATGGCCAACAGCCCACTGACCACCCATGTACTAGACACAGCTCTCGGACGACCGGCTCAGAACCTTAACATTGACGTATTCTTCCAGAGATCCGACTCGCAGGAATTTGACATCATCGCAAAGGGGAAAACAAACAACGATGGCAGGGCTCCAGGCCTACTGACTCAGGCTCAGTTTGTGTCTGGTGTCTATAAGATCAAGTTTGATACTGGTAACTACTTCAAGTCCATCAACACCAGAGGTTTCTACCCCTATGTAGAGATTGTGTTTGAGATAGTGGACCCTAGCCAACACTACCACGTGCCGTTACTACTGAGTCCTTACTCCTACAGCACCTATAGAGGGAGCTAGACAGCAGACAGGAGGTGTGAAATGGGGAGGGGCTATGAGTAGGATTAAATGGGGGGGGGGGGGCCAATAGCAATTATATTCTCATATTGTCATAATCCTGGGAACCGAACCATTAGTGGTAGATGGAATATTAAAGCAAGTAGTCTCTTTTCCCCAGATCGAGTAGACCCTCACATCTGCCGTTGCCTTTTGATGAAGAAGGGACAGAAATTATTCTTAATAGTTGCGTTCATGTACCTGACTAAAAACAATCTCCTGCCTTTTGTGAATTTTTAAGTTGATCCTAAACCTCATGATCTCGTATCTCTTTCCTCCCTCCTTCCCCTATACCCCAACCCAAATAAGGTCTGCTGACATTGCTTGGAAGATTTAAAGGGGAAATAAAGACTTTACCAAGGTTTTTATTGAATATATATATGTATCACTGTAAAATTTCATTTTAAAAATTTTACCATAAAAATTTATTTAAATCAAAGTCACATAATTCAGGTTATTTAAGGTGGAAAGGAAAATTAGTCGAAGAGAAAATTGTATTGGTATTAATTTACTCCTGTAGTTTTTATTGATCATAACTGTTTAATTAAGAATCTGAAGTTTTCCAAATGACTTTTTTTGTGAATGTTTGTTTGATAAATTACTTATTTAATGTTTGTTAAAATAAAAGACATTTGTATTTGAACATA	P. miniata
	HP125863 >HP125863\|HP125863.1 TSA: Patiria miniata isotig21061.Pminagast mRNA sequence CGGGGTATAGGGGAAGGAGGGAGGAAAGAGATACGAGATCATGAGGTTTAGGATCAACTTAAAAATTCACAAAAGGCAGGAGATTGTTTTTAGTCAGGTACATGAACGCAACTATTAAGAATAATTTCTGTCCCTTCTTCATCAAAAGGCAACGGCAGATGTGAGGGTCTACTCGATCTGGGGAAAAGAGATTACTTGCTTATTCCATCAACCACTAATGGTTGGTTCCCAGGATTATGACAATATGAGAATATAATTGCTATTGCCCTCATTTAATCCTACTCATAGCCCCTCCCCATTTCACACCTCCTGTCTGCTGTCTAGCTCCCTCTATAGGTGCTGTAGGAGTAAGGACTCAGCAGTAACGGCACGTGGTAGTGTTGGCTAGGGTCCACTATCTCAAACACAATCTCTACATAGGGGTAGAAACCTCTGGTGTTGATGGACTTGAAGTAGTTACCAGTATCAAACTTGATCTTATAGACACCAGACACAAACTGAGCCTGAGTCAGTAGGCCTGGAGCCCTGCCATCGTTGTTTGTTTTCCCCTTTGCGATGATGTCAAATTCCTGCGAGTCGGATCTATGGAAGAATACGTCAATGTTAAGGTTCTGAGCCGGTCGTCCGAGAGCTGTGTCTAGTACATGGGTGGTCAGTGGGTTGTTGGCCATGGCTGTCTCATTCAGCTGAACAGGGTAAGGGGTTGACTGAACTTGGCAGCCTTCTCGCAAATGACCAATCAGTGTCTCAATGCGATCCTGTGGACTACACATTGGACTCTAGGCTCATTTCTTGTCAAAGTCCTCTCAAAAAACCTTCCCATCCACACAAGCATTTGAAGCAACTACATGAACTAAGTTCC	P. miniata

ESTs (0)