LOC100888121 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (4)

Interactants (0)

ECB-GENEPAGE-23013393

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for LOC100888121 - All

RefSeq mRNAs(2)

Models - Gene (1)

Models - mRNA (0)

mRNAs (4)

ESTs (0)

RefSeq mRNAs (2)

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XM_030983273 >LOC100888121 AGCGACGCGGGATCGGAATGAGAGTTCGAACTGTGCCACTTAGACTAGAGCTCAAGAATCACTGATATTTATCGATAGACTGGGTGATGTGGATAATTAGAACAAACATGGAAAACAAGTGGAGTAAAAGTGAGACTTGCAATGGAATACCTTATTACATCAACCATTACAGCGAGGTCACACAATGGGACCATCCAGATCTCGTGTCTGCTGTTTCAAATTTGAGTACAATGGATAACATACACTTTGGTGCGTACAGAACTGCTGCCAAGCTTAGAATGCTACAAAAAGTCTTGCACATGGACGTAGTGAACCTCATCACTGTCAGGATGGCTTTTGAGCTCCATGGTTACAGTCACCATAACGACAGTGTGATGGATGCGGTCCAGCTCTACAACATCATCAACGAGATGTATCACATGACCAAGGTTCGTGGGAGGAGCACCCTCAAAGTCAATCGATCTAGTGACCTGCTTCTCAATTGGCTCCTTAATCTGTTTGATATCCAAAGAACAGGTTGCATAAGAGTTCTGCCTGTCAAATTGGGAATTGCCGTCATATGTTCTGGAAGCATAACAGATAAATACAGATATTTCCAAGATCTCCTTGCAAATAAAACAGGCAGCATCCCCCGTAAGATGATGACAGAATTCATGCATGATGTTACGCAGATAACAAACATGATTGGTGAGAGTGAAACATTTGGAAAAGGTGTTGCAGCATCTGTAGAAGACTGCTTCCAATCGGCTTTGGGACAAACCATTACACAGGATGACTTTCATCAATGGTTGCTTTCTGAACCACAAACTCTAGTTTGGCTGCCCACACTTCATAGATTCTCTGCTGCAGAAACAATGAAGCATGAGGTCAAGTGTTCCGTTTGTAAGATGCATCCCATCATAGGACTACGCTACCAGTGCCTCAAGTGTTTCAACTTTGACCTCTGCCAGAATTGCTTCTTCACCCGTAGGTCGTCCAAACATCACAAGCAGAGTCACCCTATGCAGGAGTACTGCCTCTCGAGTAAATCAAAGGAGGATGTCCGTGCCTTTACAAAGACCGTCCGCAACAACTTGAGTAAGAAACATGGCCGCCATATCAAGAAGAAATATCGCTCAATAGAGGATGGTTATGATTCCGATGACAGAGCAAGTGATAACCAAGATGCTGGATTGGAGACACACGTTAGGCTCAGTCAGATGTCAGAGAGTTTTCACGGAGCAAGTGTGATGGAATTAGTTGACATAGAATAA	XM_030983273.1	XP_030839133.1 dystrophin	1253 bp	XP_030839133	S. purpuratus
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Models - Gene (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	LOC100888121 >LOC100888121 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ATTCTTGCCCTTTTCCCAACACAGAGTAAATCAAAGGAGGATGTCCGTGCCTTTACAAAGACCGTCCGCAACAACTTGAGTAAGAAACATGGCCGCCATATCAAGAAGAAATATCGCTCAATAGAGGATGGTTATGATTCCGATGACAGAGCAAGGTAAAATGACTGAAAATACCTTAAAATTAGATGAGTTAAAAGGAGTGTAACATTTTCTGGCTTCGGATAAGGTTGAATCTAGCAAGCGGTATCAATGAATAACAAATTCAGCGGAAAATTAAAGCATAATGAGCTATTAATAAGTTTTATTGTATGTTCAGCTATAATACAAGTGCCTTATCATTAACTATATTTGTCTTAATTATTAGATAAATAAACATCACTCTACCATATTTCTTATACTCAAGTTAACCTTTGCAATCTCATGTGTTAAAATTGTACCATGGATGCATCTGATATGTTGCACTAGAAATTGCACTAGATGATAGCCATGttcaaaagatatgaaaaactttttgttaaatttcaaatgaCATTGAGAAATACTGACTTTGTAAAATCTTTATTCATTAGAGatgtttgattttgatatttacTATGATTGATGGATATTAACTAGGGATCTGCTGTCggaattttaattaaaaaatacttgAGTGAAATGTACAATATGATTGACAGCTGTGCTGGTGTAATTAACAATCTTGTTGATGTGGAATGTTGGATGGAGGAGGCAAGTTGTACATTACAGGAAGGGTAGTTTGTTACATTCCTCGTCAGTCATGACCTTCCCAATTAAAGgtgtcttaaagggatccggtaactttgtcttagatcctttagaaataatccttgatttagctcatgctgcaatgataattataaacctttaggtcggtcaggaactccatgacttttactgacaagccgatcgcctgtctgattatcaagatattaatgattgaaattacaaattttgaagacCGTTCACCAAAcgtttttcataacactacagtctattggggaaaacgagtatggtaaaaccggtcactcaaagattttgaggtacttcttgatcattttgaagcgcgatttttttttagggcttcaatattacaccatatcacagacactggtaacatgtaggaccgtgtatctcagatttaacattgttaaacgatccctttaagaagtAGGTCATGATTATTGAAGGTCAAATATATTCCAAACATATGAGGCTTACAAGATGTGATGAAAAGAGGAGAGTTTTCTTGCACATATTGAAAATAATggttatgtgttttttttacaaatagtggcaaaaagtattcaataacttgaaaataaaattagacAATCCAAAAGGTGTAGTTTATGGGAAGCAAAGttaaatgataatgttaatggtTAAGAACAGAATCACATTTTATAGTTGTTCTTAccatattacaaatataattattataatcattaacaatcattgttattttatttattttccccttATCTTCATTGATTAGGAATGTGTTTTTTTACAATTGCAAGACAGATTGCTGCTTTCTAAACCATATCAAGGTAACAGTtacagagacgccaagttcaatgATCAGccatgcgtgacattttcatattTCGGGTTGAGGGTATAACTCACTTAGCGTTTTttcgaaaacgcgcacgcacaTTGTGCGTGAGAGCGTTTTCAGGCCCTCGAAATGCGTGACGTCACGCACAATGCATGTCACTTGGTAGCTCTGCAGTTATAGTAGCTTTAACTATGAATTTGATATAGGCAGAGGGATATGAGAGattgatttatttgttgttttatctTCCTATATTAGTGATAACCAAGATGCTGGATTGGAGACACACGTTAGGCTCAGTCAGATGTCAGAGAGGTGAGAAGAGACAAATTGGATTATAATTACAAATGAAGCACTATAGTGCTTCATACTGTACGTTCAGTTGAGAGGTTTGGTGTTCAAAACCACAATCAGAACGATTCTCTTGAACCTCTCACTTGAAAATCTTTATGTATGACATTGTTAATGTGATCGTTTATGAGAGTTAGTTTATCTGACAAAAAGGAGTATTCTGACTTACGTCATGGGCTGAAATAGCGCCATCTACGCTTTCCTAATTCCGACATAGCAGTAGCAACGAATTGGATGTTCGCACCGAAATCTTGTCCTAAATTACACCTGTTATTGATACGAAGCCAACCCGTTTGCAACAATAAGGAGGCAAGAAGGTTCGTTAATTCGATATATTAATGTATAACGAGTATAAATAGTATAAATAATGAGAAATGATGATATGAATGTAATCTAATATGCTTAAGTGATAATGAATGGTGTGTGTAGTATTAGTGTATGCACGGACACGTATGATACCGTATACGGCTGTAGTGGACGttatatatatgcaaattagatgCACGTAAAACAGGTATACGATATATACGATATAGAGTGTAAGCTAGGGTGCTACGTAAGGCAATGTTAATTGTATGCACGTAAATAGGTATACGATATTAACGATACGAATGACGTGTCCGCTATAAGAAGGACGCAGTCATTGATATGCGTTATGCTAATAAGTCTTTGTGATTCAAACTATCTACCACGAATATTGGTCACGTGACTTGAGTGAAGGTATTGTTTATAGATAATTGCATATACACAAATGAtaagagacaaagagaagaaaTTCATTTGTTATTAATCACTGCATTTAATAGGCGAACTGATGATATtatttatacacatgtattcGAAAATGCCTGTATGAACAATTACTTATAatctgttctttttctttatcatgtttTGTTCATACAGTTTTCACGGAGCAAGTGTGATGGAATTAGTTGACATAGAATAA	S. purpuratus

mRNAs based on gene models(0)

mRNAs from cDNA libraries (4)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	JT102612 >JT102612\|JT102612.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.7623.3 mRNA sequence GGGGGCGCCACGCCCAATTGATATCGGTATCGTAGATACGAGCGACGCGGGATCGGAATGAGAGTTCGAACTGTGCCACTTAGACTAGAGCTCAAGAATCACTGATATTTATCGATAGACTGGGTGATGTGGATATTTAGAACAAACAATGGAAAATAAGTGGAGTAAAAGTGAGACTTGCAATGGAATACCTTATTACATCAACCATTACAGCGAGGTCACACAATGGGACCATCCAGATCTCGTGTCTGCTGTTTCAAATTTGAGTACAATGGATAACATACACTTTGGTGCGTACAGAACTGCTGCCAAGCTTAGAATGCTACAAAAAGTCTTGCACATGGACGTAGTGAACCTCATCACTGTCAGGATGGCTTTTGAGCTCCATGGTTACAGTCACCATAACGACAGTGTGATGGATGCGGTCCAGCTCTACAACATCATCAACGAGATGTATCACATGACCAAGGTTCGTGGGAGGAGCACCCTCAAAGTCAATCGATCTAGTGACCTGCTTCTCAATTGGCTCCTTAATCTGTTTGATATCCAAAGAACAGGTTGCATAAGAGTTCTGCCTGTCAAATTGGGAATTGCCGTCATATGTTCTGGAAGCATAACAGATAAATACAGATATTTCCAAGATCTCCTTGCAAATAAAACAGGCAGCATCCCCCGTAAGATGATGACAGAATTCATGCATGATGTTACGCAGATAACAAACATGATTGGTGAGAGTGAAACATTTGGAAAAGGTGTTGCAGCATCTGTAGAGGACTGCTTTCAATCTGCTTTGGGACAAACCATAACACAGGATGATTTTCATCAATGGTTGCTTTCTGAACCACAAACTCTAGTTTGGCTGCCTACACTTCATAGATTCTCTGCTGCAGAAA	S. purpuratus
	JT113929 >JT113929\|JT113929.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.7623.0 mRNA sequence GGGGGCGCCACGCCCAATTGATATCGGTATCGTAGATACGAGCGACGCGGGATCGGAATGAGAGTTCGAACTGTGCCACTTAGACTAGAGCTCAAGAATCACTGATATTTATCGATAGACTGGGTGATGTGGATATTTAGAACAAACAATGGAAAATAAGTGGAGTAAAAGTGAGACTTGCAATGGAATACCTTATTACATCAACCATTACAGCGAGGTCACACAATGGGACCATCCAGATCTCGTGTCTGCTGTTTCAAATTTGAGTACAATGGATAACATACACTTTGGTGCGTACAGAACTGCTGCCAAGCTTAGAATGCTACAAAAAGTCTTGCACATGGACGTAGTGAACCTCATCACTGTCAGGATGGCTTTTGAGCTCCATGGTTACAGTCACCATAACGACAGTGTGATGGATGCGGTCCAGCTCTACAACATCATCAACGAGATGTATCACATGACCAAGGTTCGTGGGAGGAGCACCCTCAAAGTCAATCGATCTAGTGACCTGCTTCTCAATTGGCTCCTTAATCTGTTTGATATCCAAAGAACAGGTTGCATAAGAGTTCTGCCTGTCAAATTGGGAATTGCCGTCATATGTTCTGGAAGCATAACAGATAAATACAGATATTTCCAAGATCTCCTTGCAAATAAAACAGGCAGCATCCCCCGTAAGATGATGACAGAATTCATGCATGATGTTACGCAGATAACAAACATGATTGGTGAGAGTGAAACATTTGGAAAAGGTGTTGCAGCATCTGTAGAGGACTGCTTTCAATCTGCTTTGGGACAAACCATTACACAGGATGACTTTCATCAATGGTTGCTTTCTGAACCACAAACTCTAGTTTGGCTGCCCACACTTCATAGATTCTCTGCTGCAGAAACAATGAAGCATGAGGTCAAGTGTTCCGTTTGTAAGATGCATCCCGTCATAGGACTACGCTACCAGTGCCTCAAGTGTTTCAACTTTGACCTCTGCCAGAATTGCTTCTTCACCCGTAGGTCGTCCAAACATCACAAGCAGAGTCATCCTATGCAGGAGTACTGCCTCTCGAGTAAATCAAAGGAGGATGTCCGTGCCTTTACAAAGACTGTGCGCAACAACTTGAGTAAGAAACATGGCCGCCGTATCAAGAAGAAATATCGCTCAATAGAGGATGGTTATGATTCCGATGACAGAGCAAGTGATAATCAAGATGCTGAATTGGAGACTCACGTTAGGCTCAGTCAGATGTCAGAGAGACTAAAAGCGGTAGAAACTCAGCAACCTCCCGGGTTGAATCGTTCCGATAGTCTGCCTCCCTCTATCAAGTCGACTAGGCAATCAATCGGCACGGCAACCACAGATGAGAGCAGATACCAAGAGAGGAGAGAGCTGGAGGATCTCATAGATCAACTGGAGAAAGAGAACGATGATCTGATGGATGATCTAGAGCGATGTGGCCTACATGTCCAAGACACCAGCTCATCGTCTGAGACAGACTCTGAACCGAGGCAGCGTGAACCATCCCAACATGACAGGACTAAGCTGGTGGAGCAGCGAAATGAAGTCTTTGCTCGCTATGAAGTCCTTGAGGAACATAACAAGAGGTTGGAGGAGCAGCTAAGAAACTTCAGAGCCATGATTAGGAAGGAGACAAGCCAAGGAAGGACTGATCACTCCTTGGGATCTGCTAATTATGAATCTCTCAAGCACAGCCCTTCATTTCCACCAGGCAACACAACATTCCACCATGGAGGGTCTATGAACCAAGTGTCTAACCGTAGTTCTGGATACCAGGCCAGTAGTGGCTATGACAGGACAGGTGAACGACTGCCCCCCTACGGACAATCACACCCTGCCCTGGACACCATAGCTGACCACTCCTCTGGGTCGTCCGGTGCTTCGGCTGTGAGACCACGTTTTGTCATGATGGGGAAGGACTACCCAGATGGGCGTGGTGACCCAAGGCGTGGTCATCCACCCCTCTATACCGATCAGGTGTCTTCATTCGGGGTAGATGGTATGGGTCAACCGGTGCTTGTTAATGATTATGGTCAGGGCAATCGAAGTGGAGGACTCGGTCAGCATCGATCAATGGCTGGTCCTTTATCGAACGTTCAGACTGGTAGCATTCAAAATCTGCCACCGGCTCCATCTTACCACCACAATATGGATCCTTCTGCCTTAGCTTCACCAGTGTATGCTCACGGTCCACAAACTTCAGCATCAGTTGCGTATCAGGATAGTGGAGATGGTGCACATAATTTGTATGGTCAGCAGACTAACGCATCACCTGTGCATCACGTTGGTGGAGTTGGTGCACATCGTTTGTTACATCCATCTATGAGTACCGGTACTATCAACCAGCACCATGAGAATAGCCAGTTACTCCTGCTGGGAAATCAGACCGGTCAGTTGCATTCTGCGGACATTCCATTCAACAGCCAGCATCCCTCTCACCTTGAGCAGTCCCATCATGTAGGATTCCAAATCGACCAATCACATCCATCTGGGCTTCACACTGACCAATCACATGCATCTAGATTTCAAACTGACCAATCACATGCATCTAGATTTCAAACTGACCAATCACATGCTGCATCTAGATTTCAAATGGACAAGTCACGTGCCTTGGAGAGTGTATTGGATCTTGATCGTTTCCTGCCTCACATCAATGATCAATCCACAGTTCACTTTCCTACTACAGGTGTATCCATGGCTTACCCCTCAGAGGAGGCTGAACTGGATGAGCTGATTCAGAGAATGACCGATGCCTTCCCGCTTCACGAGAGCCCCTCTCCTCCTCCTCTTCCAGATGAACCTGATGTGCCTGTAGTAACAATGGAAGAACTCCTTCAAGCAAGACCAAGGAGATCAAGAGGAAGCAGACGAGGGAGTGGAGACATATTTTCAGCTGCTAATCGTATTGGAGAAGCTATGTCAACTCTAGTTACTAGAGTTAGTGTTGGAGGAGCTCCTGTTCACTCTTCCTAATGGATGCTAAGATCCCAGTCTCGTC	S. purpuratus
	JT120242 >JT120242\|JT120242.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.7623.1 mRNA sequence GGGGGCGCCACGCCCAATTGATATCGGTATCGTAGATACGAGCGACGCGGGATCGGAATGAGAGTTCGAACTGTGCCACTTAGACTAGAGCTCAAGAATCACTGATATTTATCGATAGACTGGGTGATGTGGATATTTAGAACAAACAATGGAAAATAAGTGGAGTAAAAGTGAGACTTGCAATGGAATACCTTATTACATCAACCATTACAGCGAGGTCACACAATGGGACCATCCAGATCTCGTGTCTGCTGTTTCAAATTTGAGTACAATGGATAACATACACTTTGGTGCGTACAGAACTGCTGCCAAGCTTAGAATGCTACAAAAAGTCTTGCACATGGACGTAGTGAACCTCATCACTGTCAGGATGGCTTTTGAGCTCCATGGTTACAGTCACCATAACGACAGTGTGATGGATGCGGTCCAGCTCTACAACATCATCAACGAGATGTATCACATGACCAAGGTTCGTGGGAGGAGCACCCTCAAAGTCAATCGATCTAGTGACCTGCTTCTCAATTGGCTCCTTAATCTGTTTGATATCCAAAGAACAGGTTGCATAAGAGTTCTGCCTGTCAAATTGGGAATTGCCGTCATATGTTCTGGAAGCATAACAGATAAATACAGATATTTCCAAGATCTCCTTGCAAATAAAACAGGCAGCATCCCCCGTAAGATGATGACAGAATTCATGCATGATGTTACGCAGATAACAAACATGATTGGTGAGAGTGAAACATTTGGAAAAGGTGTTGCAGCATCTGTAGAGGACTGCTTTCAATCTGCTTTGGGACAAACCATTACACAGGATGACTTTCATCAATGGTTGCTTTCTGAACCACAAACTCTAGTTTGGCTGCCCACACTTCATAGATTCTCTGCTGCAGAAACAATGAAGCATGAGGTCAAGTGTTCCGTTTGTAAGATGCATCCCGTCATAGGACTACGCTACCAGTGCCTCAAGTGTTTCAACTTTGACCTCTGCCAGAATTGCTTCTTCACCCGTAGGTCGTCCAAACATCACAAGCAGAGTCATCCTATGCAGGAGTACTGCCTCTCGAGTAAATCAAAGGAGGATGTCCGTGCCTTTACAAAGACCGTCCGCAACAACTTGAGTAAGAAACATGGCCGCCATATCAAGAAGAAATATCGCTCAATAGAGGATGGTTAT	S. purpuratus
	XM_030983273 >XM_030983273\|XM_030983273.1 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus dystrophin (LOC100888121), mRNA AGCGACGCGGGATCGGAATGAGAGTTCGAACTGTGCCACTTAGACTAGAGCTCAAGAATCACTGATATTTATCGATAGACTGGGTGATGTGGATAATTAGAACAAACATGGAAAACAAGTGGAGTAAAAGTGAGACTTGCAATGGAATACCTTATTACATCAACCATTACAGCGAGGTCACACAATGGGACCATCCAGATCTCGTGTCTGCTGTTTCAAATTTGAGTACAATGGATAACATACACTTTGGTGCGTACAGAACTGCTGCCAAGCTTAGAATGCTACAAAAAGTCTTGCACATGGACGTAGTGAACCTCATCACTGTCAGGATGGCTTTTGAGCTCCATGGTTACAGTCACCATAACGACAGTGTGATGGATGCGGTCCAGCTCTACAACATCATCAACGAGATGTATCACATGACCAAGGTTCGTGGGAGGAGCACCCTCAAAGTCAATCGATCTAGTGACCTGCTTCTCAATTGGCTCCTTAATCTGTTTGATATCCAAAGAACAGGTTGCATAAGAGTTCTGCCTGTCAAATTGGGAATTGCCGTCATATGTTCTGGAAGCATAACAGATAAATACAGATATTTCCAAGATCTCCTTGCAAATAAAACAGGCAGCATCCCCCGTAAGATGATGACAGAATTCATGCATGATGTTACGCAGATAACAAACATGATTGGTGAGAGTGAAACATTTGGAAAAGGTGTTGCAGCATCTGTAGAAGACTGCTTCCAATCGGCTTTGGGACAAACCATTACACAGGATGACTTTCATCAATGGTTGCTTTCTGAACCACAAACTCTAGTTTGGCTGCCCACACTTCATAGATTCTCTGCTGCAGAAACAATGAAGCATGAGGTCAAGTGTTCCGTTTGTAAGATGCATCCCATCATAGGACTACGCTACCAGTGCCTCAAGTGTTTCAACTTTGACCTCTGCCAGAATTGCTTCTTCACCCGTAGGTCGTCCAAACATCACAAGCAGAGTCACCCTATGCAGGAGTACTGCCTCTCGAGTAAATCAAAGGAGGATGTCCGTGCCTTTACAAAGACCGTCCGCAACAACTTGAGTAAGAAACATGGCCGCCATATCAAGAAGAAATATCGCTCAATAGAGGATGGTTATGATTCCGATGACAGAGCAAGTGATAACCAAGATGCTGGATTGGAGACACACGTTAGGCTCAGTCAGATGTCAGAGAGTTTTCACGGAGCAAGTGTGATGGAATTAGTTGACATAGAATAA	S. purpuratus

ESTs (0)