VAMP Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (12)

Nucleotides (10)

Interactants (13)

ECB-GENEPAGE-23011356

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for VAMP - All

Models - Gene (1)

Models - mRNA (2)

mRNAs (7)

ESTs (0)

Models - Gene (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	VAMP >VAMP 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purpuratus

Models - mRNA (2)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	NM_001349028.1 >NM_001349028.1 TCTGTATATAATTTGTAGGTGTGTGAAAACACCCCCAGAAAATTCATCAAAATGGCTGCACCACCACCACCACAACCAGCGCCCTCCAACAAGAGGTTACAACAGACTCAAGCACAAGTAGATGAGGTTGTGGATATTATGAGAGTAAATGTTGACAAAGTTCTTGAGCGAGATCAGGCGCTATCAGTCTTGGATGACCGTGCAGATGCCCTCCAGCAAGGAGCATCACAGTTTGAGACGAATGCTGGCAAACTCAAACGGAAGTACTGGTGGAAAAACTGCAAGATGATGATCATCCTAGCAATTATTATCATTGTCATTTTAATAATCATTATCGTCGCTATCGTGCAAAGCCAAAAAAAGTAACACACACAGGGAACCAGCTTTAGCACCATCAAAGGAAAAAAAAGGAATATCTCAACAAGTCATCTTCCCCTGGCCGACTCGGACGCATCTCCGCAAGGTCAAAGGTCACCCCGCTCATTTGTCCCAGGTGAAAGGTCATCAGCTGCACACTGAACCTTGAGAGGCAAATATCCTGTGAATCGACCATCTCTACATTTCTGTAAACTTTTACGGGGAAAGTCTATTTTTAATAAGGTAACCGGTGTATTTAAAAGGAATGGTAGTTATCCTTTAAGATGTTATGGGAAGGACTAATCTTAATCTCTCATTTTAAGTTTGACTAATCCCTTTCAGATCAGTTTCA	S. purpuratus
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	NM_001349029.1 >NM_001349029.1 ATCTGTATATAATTTGTAGGTGTGTGAAAACACCCCCAGAAAATTCATCAAAATGGCTGCACCACCACCACCACAACCAGCGCCCTCCAACAAGAGGTTACAACAGACTCAAGCACAAGTAGATGAGGTTGTGGATATTATGAGAGTAAATGTTGACAAAGTTCTTGAGCGAGATCAGGCGCTATCAGTCTTGGATGACCGTGCAGATGCCCTCCAGCAAGGAGCATCACAGTTTGAGACGAATGCTGGCAAACTCAAACGGAAGTACTGGTGGAAAAACTGCAAGATGATGATCATCCTAGCAATTATTATCATTGTCATTTTAATAATCATTATCGTGTGGGCCACACAGGCTTAGAAGTCGCTATCGTGCAAAGCCAAAAAAAGTAACACACACAGGGAACCAGCTTTAGCACCATCAAAGGAAAAAAAAGGAATATCTCAACAAGTCATCTTCCCCTGGCCGACTCGGACGCATCTCCGCAAGGTCAAAGGTCACCCCGCTCATTTGTCCCAGGTGAAAGGTCATCAGCTGCACACTGAACCTTGAGAGGCAAATATCCTGTGAATCGACCATCTCTACATTTCTGTAAACTTTTACGGGGAAAGTCTATTTTTAATAAGGTAACCGGTGTATTTAAAAGGAATGGTAGTTATCCTTTAAGATGTTATGGGAAGGACTAATCTTAATCTCTCATTTTAAGTTTGACTAATCC	S. purpuratus

mRNAs (7)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	NM_214630 >NM_214630\|>NM_214630.1 Strongylocentrotus purpuratus vesicle-associated membrane protein (VAMP), mRNA ATGGCTGCACCACCACCACCACAACCAGCGCCCTCCAACAAGAGGTTACAACAGACTCAAGCACAAGTAG ATGAGGTTGTGGATATTATGAGAGTAAATGTTGACAAAGTTCTTGAGCGAGATCAGGCGCTATCAGTCTT GGATGACCGTGCAGATGCCCTCCAGCAAGGAGCATCACAGTTTGAGACGAATGCTGGCAAACTCAAACGG AAGTACTGGTGGAAAAACTGCAAGATGATGATCATCCTAGCAATTATTATCATTGTCATTTTAATAATCA TTATCGTCGCTATCGTGCAAAGCCAAAAAAAGTAACA	S. purpuratus
	NM_001349029 >NM_001349029\|>NM_001349029.1 Strongylocentrotus purpuratus vesicle-associated membrane protein (VAMP), transcript variant 2, mRNA ATCTGTATATAATTTGTAGGTGTGTGAAAACACCCCCAGAAAATTCATCAAAATGGCTGCACCACCACCA CCACAACCAGCGCCCTCCAACAAGAGGTTACAACAGACTCAAGCACAAGTAGATGAGGTTGTGGATATTA TGAGAGTAAATGTTGACAAAGTTCTTGAGCGAGATCAGGCGCTATCAGTCTTGGATGACCGTGCAGATGC CCTCCAGCAAGGAGCATCACAGTTTGAGACGAATGCTGGCAAACTCAAACGGAAGTACTGGTGGAAAAAC TGCAAGATGATGATCATCCTAGCAATTATTATCATTGTCATTTTAATAATCATTATCGTGTGGGCCACAC AGGCTTAGAAGTCGCTATCGTGCAAAGCCAAAAAAAGTAACACACACAGGGAACCAGCTTTAGCACCATC AAAGGAAAAAAAAGGAATATCTCAACAAGTCATCTTCCCCTGGCCGACTCCGACGCATCTCCGCAAGGTC AAAGGTCACCCCGCTCATTTGTCCCAGGTGAAAGGTCATCAGCTGCACACTGAACCTTGAGAGGCAAATA TCCTGTGAATCGACCATCTCTACATTTCTGTAAACTTTTACGGGGAAAGTCTATTTTTAATAAGGTAACC GGTGTATTTAAAAGGAATGGTAGTTATCCTTTAAGATGTTATGGGAAGGACTAATCTTAATCTCTCATTT TAAGTTTGACTAATCC	S. purpuratus
	NM_001349028 >NM_001349028\|>NM_001349028.1 Strongylocentrotus purpuratus vesicle-associated membrane protein (VAMP), transcript variant 1, mRNA TCTGTATATAATTTGTAGGTGTGTGAAAACACCCCCAGAAAATTCATCAAAATGGCTGCACCACCACCAC CACAACCAGCGCCCTCCAACAAGAGGTTACAACAGACTCAAGCACAAGTAGATGAGGTTGTGGATATTAT GAGAGTAAATGTTGACAAAGTTCTTGAGCGAGATCAGGCGCTATCAGTCTTGGATGACCGTGCAGATGCC CTCCAGCAAGGAGCATCACAGTTTGAGACGAATGCTGGCAAACTCAAACGGAAGTACTGGTGGAAAAACT GCAAGATGATGATCATCCTAGCAATTATTATCATTGTCATTTTAATAATCATTATCGTCGCTATCGTGCA AAGCCAAAAAAAGTAACACACACAGGGAACCAGCTTTAGCACCATCAAAGGAAAAAAAAGGAATATCTCA ACAAGTCATCTTCCCCTGGCCGACTCCGACGCATCTCCGCAAGGTCAAAGGTCACCCCGCTCATTTGTCC CAGGTGAAAGGTCATCAGCTGCACACTGAACCTTGAGAGGCAAATATCCTGTGAATCGACCATCTCTACA TTTCTGTAAACTTTTACGGGGAAAGTCTATTTTTAATAAGGTAACCGGTGTATTTAAAAGGAATGGTAGT TATCCTTTAAGATGTTATGGGAAGGACTAATCTTAATCTCTCATTTTAAGTTTGACTAATCCCTTTCAGA TCAGTTTCA	S. purpuratus
	AF014119 >AF014119\|>AF014119.1 Strongylocentrotus purpuratus vesicle-associated membrane protein mRNA, partial cds AACTCACAACACCACCACCCACAGCAGCAACTATGCTAACCGATATACCACCAACAAGAGGTTACAACAG ACTCAAGCACAAGTAGATGAGGTTGTGGATATTATGAGAGTAAATGTTGACAAAGTTCTTGAGCGAGATC AGGCGCTATCAGTCTTGGATGACCGTGCAGATGCCCTCCAGCAAGGAGCATCACAGTTTGAGACGAATGC TGGCAAACTCAAACGGAAGTACTGGTGGAAAAACTGCAAGATGATGATCATCCTAGCAATTATTATCATT GTCATTTTAATAATCATTATCGTCGCTATCGTGCAAAGCCAAAAAAAGTAACACACACAGGGAACCAGCT TTAGCACCATCAAAGGAAAAAAAAGGAATATCTCAACAAGTCATCTTCCCCTGGCCGACTCGGACGCATC TCCAGACAAGGTCAAAGAGATCACCCCGCTCATTCTCGCTCGCGCGGGATAGAAAAGAGATCCAATCCAC GCACATCAGCAACACTGCACACCTTGAGAAGAGACATATACTCACTCCTGTGAATCCGCAACTCCATCTC TACATTTCTGTAAACTTTTACGGGGAAAGTCTATTTTTAATAAGGTAACCGGTGTATTTAAAGGAATGGT AGTCTCTCTCTCTCTCCC	S. purpuratus
	AF015485 >AF015485\|>AF015485.1 Strongylocentrotus purpuratus vesicle associated membrane protein mRNA, partial cds CAGCAGACACAGGCACAGGTAGATGAGGTTGTGGATATTATGAGAGTAAATGTTGACAAAGTTCTTGAGC GAGATCAGGCGCTATCAGTCTTGGATGACCGTGCAGATGCCCTCCAGCAAGGAGCATCACAGTTTGAGAC GAATGCTGGCAAACTCAAACGGAAGTACTGGTGGAARAACTGCAAAATGATG	S. purpuratus
	GHFM01029218 >GHFM01029218\| -	S. purpuratus
	AF151536 >AF151536\|>AF151536.1 Strongylocentrotus purpuratus vesicle-associated membrane protein mRNA, complete cds ATGGCTGCACCACCACCACCACAACCAGCGCCCTCCAACAAGAGGTTACAACAGACTCAAGCACAAGTAG ATGAGGTTGTGGATATTATGAGAGTAAATGTTGACAAAGTTCTTGAGCGAGATCAGGCGCTATCAGTCTT GGATGACCGTGCAGATGCCCTCCAGCAAGGAGCATCACAGTTTGAGACGAATGCTGGCAAACTCAAACGG AAGTACTGGTGGAAAAACTGCAAGATGATGATCATCCTAGCAATTATTATCATTGTCATTTTAATAATCA TTATCGTCGCTATCGTGCAAAGCCAAAAAAAGTAACA	S. purpuratus

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