LOC115927922 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (4)

Interactants (0)

ECB-GENEPAGE-23008940

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for LOC115927922 - All

RefSeq mRNAs(3)

Models - Gene (2)

Models - mRNA (1)

mRNAs (2)

ESTs (0)

RefSeq mRNAs (3)

Accession	Version	Protein Name	Length	Protein	Species
XM_030994542 >LOC115927922 ATGCCAGAAGCAAAAGTACATTCTCCAAAGAAAGGTGGTTTCTTCGCCGGGATAGCCAAGTTCTTCACTGGAGATTCATCTGATTCAGATTCTGATGATGAGACCAAAAAACTCAAACAAGAGATAAATCTTCCTAAAGGAAATTTATCTGTTGAATCTCCAGGAGCTGATGTAAGAGGTGATGTGGATGCCAACCTAGACACATCAGCAAATAGCAGCGGGTTTCCAGAGGGAGGCGCAAATTTCAACATTGGTGCAAGTGGCAAAGGTTCTCCATCTAAAGGAAAGAAGGGAGGAAGGTTCAAGTTGCCCAAGCTTGGAAAGCCAAAAATAAATGGCAGCACTGATGCAGGAGTAGAAGTTTTGAATGTTCCAGATGCCTCACTGGATGTTGATGATGTGAAAGCCCCCAGCTTTGGTGGTGGTGTTGGTGGTCACATTGGACTTGGTGTCAAAGGAGGTATATCTGGACCTGATGTGATCTTTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGACATTGGATTTGCTGCCAAAGGAGGTATATCTGGGCCTGATGTTGATGTATCACCCCCAACCATTGGCGGCAAAGGAGACATAGGAGGAAAAGGGGAAGTACCAGATGCTTCACTGGATGTTGGTGGTGATGTGAAAGCCCCCAGATTTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGACATTGGATTTGGTGCCAAAGGAGGTATATCTGGACCTGATGTTGATGTTTCACCCCCAAGCTTTGGCGGTATAGGAAACATTGGAGGAAAAGGGAAAATACCAGATGCTTCACTTAATGTTGATGATGTGAACGCCCCCAGCTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGAAAGTGGACTTGGTGTCAATGGAGGTATATCTGGACCTGATCTTAACATCGGTGATGACACAAACATTAGAGGATTGAATGTACCAGATGCCTCTGTGGGCATTGGAGGTGACGTGAAAGCGCAAGTTTTGGCGGTGGTATTGGTGTCAGTGGTAGTGGTCCAAAGGGTGGGATTTCCAGCCCTGACATTGATGTTCCTGCTCCATCGGGTAGTATTGATGTTAGTGCAGATGTGCCAGATGCAAAACTTGATCTCGGCAGCAAAAAGGACAAGGGAGGTTTCCACTTCAGACTTCCAAAGTTCAGATTTCCGTCATTTGGGTCGGGTGATGCCAAAGCAAAAGGCAATGTTTCTGTGA		XP_030850402.1 vesicle-associated protein-like	1197 bp	XP_030850402	S. purpuratus
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XM_022242253 >LOC110983197 AATTCTTTGGGTTGCAGACGGTGCGAAGCCACTCCTCCGCCTACGTACGTTCACCTGGCATGAATATTTGGTGGGCTGCATGCACACGCACTCAGAGTGTGCGAGATGACAGCCACACAACTAAAGCCTGAACTGGGGTAATCGTCGCAGACAACTGGTCCTTGAAATGTGTACTTTGTCGTGAGCGCTGCAACTTCATTAGTACGTTCCAACTTTTCCACCCGACCTGACTGTTTCTAGAGAACTTTGAGAAAATCTAGACCCACCAAAAACGAGTTTGAAAGATGGGGAACCAAGAGAGTGCTTCGGCAAGCATTCACGTGGAAGGCTCCGTGTCGGCATCGGGGGCCGTCGATGCAGGGGTATCTGCAGAGGGCCAGGCCCATGGGCCGCCATCCCCGAAAAAAAGGCGTCTGAGTTTCAAGTCACTCCGCAATGGATCATTTCGTCGTTCGTTTAAGATTCGCCGGAGCGGACGCAGAAAATCTCCTAAAGGCAAGGGCGAGGAGAGAATCGAAATGGAGGGGGATGTTTCGGGCGAGAAAGGTGCAGCGGCAAGGGCAGCTGCGAAATTGAAGGCGTCAGGCGAGGGGAAACCGGTGGTTGACTTGAACATAGCTGCACCGCTTGCGACAGATGAAACAGAGAATATGGACCTGGATGCTGATATCGAGGCTGGTGGAAATGTTGGTGTGTCTGGTGGAGCTTCAGGAGATTTGGGTGGAAGTGCTGGCCTTCAGGCTGACATTCCATCTGGAGCATCTGCAGGTGTTGGCGTAAGTGGGGATATGCCCTCTGCAGGTGCAAGCCTTGATGTCTCTGCACCAGACGTGAAGCTGAATATAAATGGAAAGAAACACAAGAAGCGATCGTCTTTCCCCAAGTTCAGAAAAAGAACTCCTGCCGAGGCAGAGTTGGATGTTGAGCTCCCCAAAGGTGAAGTACAGATTGGGGGAGGTGCAGATGTTGCAGCTGGCATCAATGGACACAAAGGATTGAAACATGGAAAGAGGAAAGAAGGTCCATCTGTTTCTGCAGAAGGAGGTGCATCCATGGACGTTGACACACCAGCAGTGGAAACACCCAAGGTTGGTGTCTCAGGTGGTGCTGATGGTGATGTAAATGCGTCACTCCCTTCAGCTGATGTGACTGTCAAAGCTGACATGCCAGATGCAAAAAGACATTCTCCAAAGAAAGGTGGTTTCTTTGCTGAGATAGCAAAGTTCTTTACTGGGGATTCAGACTCTTCTGATTCAGACTCTGATGCTGAGACCAAAAACCTCAAACTTCAAGGAAGCCTTCACAAAGGAGATGTATCAGGAGGTGCTCCAGGAGCCGATATCAGTGGTGGTGTGGGAGCCAACCTGGATGCATCAGCAGATATCAGTGGCTCACCAGAGGGAGAGGCTAAATTCAACATTGGTGCTGGAGGCAAGAGTTCTCCATCTAAACGCAAGAAGGGAGGAAAATTCAAGTTGCCCAAGCTTGGAAAACGCAAGATAAATGGCAATGCTGATGCAGCAGTAGAAGTTCCAAATGCTGATCTGAAAGGAGTTGTGGGATTTAATGTTGAACCTCCTGATGCTGTAGTGAAAGCAGATGTTGATACAGATGTCAAGACAAAGAAGGCAGACTTCAGGTTTGGTGGAGGTGTGAATGGCGATGGTGAACTTGACCTTAAGGGAGGAATCTCTGGACCCGATGTTAGTGTTTCAGGACCAAAGGCTTCATTAGGTGGTGATGATGGTATCGGAGGAGACGGTGATGTAAACATCGGAGTAAATGTCCCAGATGCCTCACTGGGAGTTGGAGGAGATGTTAAGGTTCCCAACATTGGCGGTGGCATTGGTGGGCTTGGCATCAAAGGAGGAATTTCAGGACCTGATACCGATATTTCTGGTCCCACAATTGGAGGTGATGCAGGCCTCGGTGGAGGAGTGAATATACCAGATGCCTCACTGGGGGTTGGAGATGTCAAAGTTCCCAGCTTTGGTGGTGGTATTGGTGAGAGAGGTGGGCTTGACATAAAGGGTGGAATTTCCGGACCTGATGGTGATGCCTCTGGTCCCAAGATTGGTGGTGATGCAGGCATAGGTGGAGGAGTAAAAGTACCTGACACCTCTCTGGGGGTTCCCAGCTTTGGGGGTGGTATTGGTAAAGGAGGTGGGCTTGGCATCAAGGGTGGAATTTCAGGACCTGAT		XP_022097945.1 vesicle-associated protein-like, partial	2201 bp	XP_022097945	A. planci

Models - Gene (2)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	LOC115927922 >LOC115927922 ATGCCAGAAGCAAAAGTACATTCTCCAAAGAAAGGTGGTTTCTTCGCCGGGATAGCCAAGTTCTTCACTGGAGATTCATCTGATTCAGATTCTGATGATGAGACCAAAAAACTCAAACAAGAGATAAATCTTCCTAAAGGAAATTTATCTGTTGAATCTCCAGGAGCTGATGTAAGAGGTGATGTGGATGCCAACCTAGACACATCAGCAAATAGCAGCGGGTTTCCAGAGGGAGGCGCAAATTTCAACATTGGTGCAAGTGGCAAAGGTTCTCCATCTAAAGGAAAGAAGGGAGGAAGGTTCAAGTTGCCCAAGCTTGGAAAGCCAAAAATAAATGGCAGCACTGATGCAGGAGTAGAAGTTTGCAAATGCTGATCTGGGAGGAGTTGTTGGATTTGATGTTGAAGCTCCAGATGTTGTGGTGAAAGCTGATGTTGACActatgttaaaacaaaaaagccaGATTTTAAATTTGGTGGCGGTGTGTATGGGATGGTGAACTTGGCACCAAAGGAGATCTTGCAGGACCAGATGTTTCCAGTCCAAAAAATGGTGTCAATGCAGATATTGATGGAGGAGTGAATGTTCCATATGCATCACCTGGTGTAAGGGGAGATATTAAGCTCCCAGCATTGGTGGAAGCATCGGAAGTGGTTTTGGCAGAAGTGGGGGACTCGGCATGAAAGGAGATACTTCATTACTGATGTCGATCTATCCGGTCCACAAATTGGTGGTGATGCACACATTGGAGAAAGAGGGAATGTACGGATGCTTCAGTGGGTATTGTGGAGATGTTAAAGTTCCTGGCATTGGTGGTGTTTCAGTGGTGACAGTGATGTGGCCATGAAAGAGGTATTTCTGGACCTGATGTTGATGTATCTGCTCCAAACTTTGGCGGTAAAGTGAATGTTCCAGATGCCTCACTGGATGTTGATGATGTGAAAGCCCCCAGctttggtggtggtgttggtggtcaCATTGGACTTGGTGTCAAAGGAGGTATATCTGGACCTGATGTGATGTATCACCCCCAACCATTGCGGCAAAGGAAACATTGGAGGAAAAGTGAATGTACCAGATGCTTCACTGGATGTTGGTGATGTGATGCCCCCAGctttggtggtggtgttggtggtgacATTGGATTTGCTGCCAAAGGAGGTATATCTGGGCCTGATGTTGATGTATCACCCCCAACCATTGGCGGCAAAGGAGACATAGGAGGAAAAGGGGAAGTACCAGATGCTTCACTGGATGTTGGTGGTGATGTGAAAGCCCCCAGatttggtggtggtgttggtggtgacATTGGATTTGGTGCCAAAGGAGGTATATCTGGACCTGATGTTGATGTTTCACCCCCAAGCTTTGGCGGTATAGGAAACATtggaggaaaagggaaaatacCAGATGCTTCActtaatgttgatgatgtgaaCGCCCCCAgctttggtggtggtggtggtggtgaaagTGGACTTGGTGTCAATGGAGGTATATCTGGACCTGATCTTAACATCGGTGATGACACAAACATTAGAGGATTGAATGTACCAGATGCCTCTGTGGGCATTGGAGGTGACGTGAAAGCGCAAGTTTTGGCGGTGGTATTGGTGTCAGTGGTAGTGGTCCAAAGGGTGGGATTTCCAGCCCTGACATTGATGTTCCTGCTCCATCGGGTAGTATTGATGTTAGTGCAGATGTGCCAGATGCAAAACTTGATCTCGGCAGCAAAAAGGACAAGGGAGGTTTCCACTTCAGACTTCCAAAGTTCAGATTTCCGTCATTTGGGTCGGGTGATGCCAAAGCAAAAGGCAATGTTTCTGTGA	S. purpuratus
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planci

mRNAs based on gene models(1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_030994542.1 >XM_030994542.1 ATGCCAGAAGCAAAAGTACATTCTCCAAAGAAAGGTGGTTTCTTCGCCGGGATAGCCAAGTTCTTCACTGGAGATTCATCTGATTCAGATTCTGATGATGAGACCAAAAAACTCAAACAAGAGATAAATCTTCCTAAAGGAAATTTATCTGTTGAATCTCCAGGAGCTGATGTAAGAGGTGATGTGGATGCCAACCTAGACACATCAGCAAATAGCAGCGGGTTTCCAGAGGGAGGCGCAAATTTCAACATTGGTGCAAGTGGCAAAGGTTCTCCATCTAAAGGAAAGAAGGGAGGAAGGTTCAAGTTGCCCAAGCTTGGAAAGCCAAAAATAAATGGCAGCACTGATGCAGGAGTAGAAGTTTTGAATGTTCCAGATGCCTCACTGGATGTTGATGATGTGAAAGCCCCCAGCTTTGGTGGTGGTGTTGGTGGTCACATTGGACTTGGTGTCAAAGGAGGTATATCTGGACCTGATGTGATCTTTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGACATTGGATTTGCTGCCAAAGGAGGTATATCTGGGCCTGATGTTGATGTATCACCCCCAACCATTGGCGGCAAAGGAGACATAGGAGGAAAAGGGGAAGTACCAGATGCTTCACTGGATGTTGGTGGTGATGTGAAAGCCCCCAGATTTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGACATTGGATTTGGTGCCAAAGGAGGTATATCTGGACCTGATGTTGATGTTTCACCCCCAAGCTTTGGCGGTATAGGAAACATTGGAGGAAAAGGGAAAATACCAGATGCTTCACTTAATGTTGATGATGTGAACGCCCCCAGCTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGAAAGTGGACTTGGTGTCAATGGAGGTATATCTGGACCTGATCTTAACATCGGTGATGACACAAACATTAGAGGATTGAATGTACCAGATGCCTCTGTGGGCATTGGAGGTGACGTGAAAGCGCAAGTTTTGGCGGTGGTATTGGTGTCAGTGGTAGTGGTCCAAAGGGTGGGATTTCCAGCCCTGACATTGATGTTCCTGCTCCATCGGGTAGTATTGATGTTAGTGCAGATGTGCCAGATGCAAAACTTGATCTCGGCAGCAAAAAGGACAAGGGAGGTTTCCACTTCAGACTTCCAAAGTTCAGATTTCCGTCATTTGGGTCGGGTGATGCCAAAGCAAAAGGCAATGTTTCTGTGA	S. purpuratus

mRNAs from cDNA libraries (2)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_030994542 >XM_030994542\|XM_030994542.1 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus vesicle-associated protein-like (LOC115927922), mRNA ATGCCAGAAGCAAAAGTACATTCTCCAAAGAAAGGTGGTTTCTTCGCCGGGATAGCCAAGTTCTTCACTGGAGATTCATCTGATTCAGATTCTGATGATGAGACCAAAAAACTCAAACAAGAGATAAATCTTCCTAAAGGAAATTTATCTGTTGAATCTCCAGGAGCTGATGTAAGAGGTGATGTGGATGCCAACCTAGACACATCAGCAAATAGCAGCGGGTTTCCAGAGGGAGGCGCAAATTTCAACATTGGTGCAAGTGGCAAAGGTTCTCCATCTAAAGGAAAGAAGGGAGGAAGGTTCAAGTTGCCCAAGCTTGGAAAGCCAAAAATAAATGGCAGCACTGATGCAGGAGTAGAAGTTTTGAATGTTCCAGATGCCTCACTGGATGTTGATGATGTGAAAGCCCCCAGCTTTGGTGGTGGTGTTGGTGGTCACATTGGACTTGGTGTCAAAGGAGGTATATCTGGACCTGATGTGATCTTTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGACATTGGATTTGCTGCCAAAGGAGGTATATCTGGGCCTGATGTTGATGTATCACCCCCAACCATTGGCGGCAAAGGAGACATAGGAGGAAAAGGGGAAGTACCAGATGCTTCACTGGATGTTGGTGGTGATGTGAAAGCCCCCAGATTTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGACATTGGATTTGGTGCCAAAGGAGGTATATCTGGACCTGATGTTGATGTTTCACCCCCAAGCTTTGGCGGTATAGGAAACATTGGAGGAAAAGGGAAAATACCAGATGCTTCACTTAATGTTGATGATGTGAACGCCCCCAGCTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGAAAGTGGACTTGGTGTCAATGGAGGTATATCTGGACCTGATCTTAACATCGGTGATGACACAAACATTAGAGGATTGAATGTACCAGATGCCTCTGTGGGCATTGGAGGTGACGTGAAAGCGCAAGTTTTGGCGGTGGTATTGGTGTCAGTGGTAGTGGTCCAAAGGGTGGGATTTCCAGCCCTGACATTGATGTTCCTGCTCCATCGGGTAGTATTGATGTTAGTGCAGATGTGCCAGATGCAAAACTTGATCTCGGCAGCAAAAAGGACAAGGGAGGTTTCCACTTCAGACTTCCAAAGTTCAGATTTCCGTCATTTGGGTCGGGTGATGCCAAAGCAAAAGGCAATGTTTCTGTGA	S. purpuratus
	XM_022242253 >XM_022242253\|PREDICTED: Acanthaster planci vesicle-associated protein-like (LOC110983197), partial mRNA AATTCTTTGGGTTGCAGACGGTGCGAAGCCACTCCTCCGCCTACGTACGTTCACCTGGCATGAATATTTGGTGGGCTGCATGCACACGCACTCAGAGTGTGCGAGATGACAGCCACACAACTAAAGCCTGAACTGGGGTAATCGTCGCAGACAACTGGTCCTTGAAATGTGTACTTTGTCGTGAGCGCTGCAACTTCATTAGTACGTTCCAACTTTTCCACCCGACCTGACTGTTTCTAGAGAACTTTGAGAAAATCTAGACCCACCAAAAACGAGTTTGAAAGATGGGGAACCAAGAGAGTGCTTCGGCAAGCATTCACGTGGAAGGCTCCGTGTCGGCATCGGGGGCCGTCGATGCAGGGGTATCTGCAGAGGGCCAGGCCCATGGGCCGCCATCCCCGAAAAAAAGGCGTCTGAGTTTCAAGTCACTCCGCAATGGATCATTTCGTCGTTCGTTTAAGATTCGCCGGAGCGGACGCAGAAAATCTCCTAAAGGCAAGGGCGAGGAGAGAATCGAAATGGAGGGGGATGTTTCGGGCGAGAAAGGTGCAGCGGCAAGGGCAGCTGCGAAATTGAAGGCGTCAGGCGAGGGGAAACCGGTGGTTGACTTGAACATAGCTGCACCGCTTGCGACAGATGAAACAGAGAATATGGACCTGGATGCTGATATCGAGGCTGGTGGAAATGTTGGTGTGTCTGGTGGAGCTTCAGGAGATTTGGGTGGAAGTGCTGGCCTTCAGGCTGACATTCCATCTGGAGCATCTGCAGGTGTTGGCGTAAGTGGGGATATGCCCTCTGCAGGTGCAAGCCTTGATGTCTCTGCACCAGACGTGAAGCTGAATATAAATGGAAAGAAACACAAGAAGCGATCGTCTTTCCCCAAGTTCAGAAAAAGAACTCCTGCCGAGGCAGAGTTGGATGTTGAGCTCCCCAAAGGTGAAGTACAGATTGGGGGAGGTGCAGATGTTGCAGCTGGCATCAATGGACACAAAGGATTGAAACATGGAAAGAGGAAAGAAGGTCCATCTGTTTCTGCAGAAGGAGGTGCATCCATGGACGTTGACACACCAGCAGTGGAAACACCCAAGGTTGGTGTCTCAGGTGGTGCTGATGGTGATGTAAATGCGTCACTCCCTTCAGCTGATGTGACTGTCAAAGCTGACATGCCAGATGCAAAAAGACATTCTCCAAAGAAAGGTGGTTTCTTTGCTGAGATAGCAAAGTTCTTTACTGGGGATTCAGACTCTTCTGATTCAGACTCTGATGCTGAGACCAAAAACCTCAAACTTCAAGGAAGCCTTCACAAAGGAGATGTATCAGGAGGTGCTCCAGGAGCCGATATCAGTGGTGGTGTGGGAGCCAACCTGGATGCATCAGCAGATATCAGTGGCTCACCAGAGGGAGAGGCTAAATTCAACATTGGTGCTGGAGGCAAGAGTTCTCCATCTAAACGCAAGAAGGGAGGAAAATTCAAGTTGCCCAAGCTTGGAAAACGCAAGATAAATGGCAATGCTGATGCAGCAGTAGAAGTTCCAAATGCTGATCTGAAAGGAGTTGTGGGATTTAATGTTGAACCTCCTGATGCTGTAGTGAAAGCAGATGTTGATACAGATGTCAAGACAAAGAAGGCAGACTTCAGGTTTGGTGGAGGTGTGAATGGCGATGGTGAACTTGACCTTAAGGGAGGAATCTCTGGACCCGATGTTAGTGTTTCAGGACCAAAGGCTTCATTAGGTGGTGATGATGGTATCGGAGGAGACGGTGATGTAAACATCGGAGTAAATGTCCCAGATGCCTCACTGGGAGTTGGAGGAGATGTTAAGGTTCCCAACATTGGCGGTGGCATTGGTGGGCTTGGCATCAAAGGAGGAATTTCAGGACCTGATACCGATATTTCTGGTCCCACAATTGGAGGTGATGCAGGCCTCGGTGGAGGAGTGAATATACCAGATGCCTCACTGGGGGTTGGAGATGTCAAAGTTCCCAGCTTTGGTGGTGGTATTGGTGAGAGAGGTGGGCTTGACATAAAGGGTGGAATTTCCGGACCTGATGGTGATGCCTCTGGTCCCAAGATTGGTGGTGATGCAGGCATAGGTGGAGGAGTAAAAGTACCTGACACCTCTCTGGGGGTTCCCAGCTTTGGGGGTGGTATTGGTAAAGGAGGTGGGCTTGGCATCAAGGGTGGAATTTCAGGACCTGAT	A. planci

ESTs (0)