pbrm1 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (5)

Nucleotides (36)

Interactants (38)

ECB-GENEPAGE-23156995

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for pbrm1 - Lytechinus variegatus

Models - Gene (1)

Models - mRNA (0)

mRNAs (10)

ESTs (0)

Models - Gene (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	3.0	LOC121410404 >LOC121410404 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variegatus

Models - mRNA (0)

mRNAs (10)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_041602474 >XM_041602474\|>XM_041602474.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus protein polybromo-1-like (LOC121410404), transcript variant X9, mRNA CTCCGCGGTTCGCCCTCTGCGTTCACAGTCTGTATTTTTCTTTGTTTGATGAAAAGCTGAGGCAAAACTT GATAGAGAGAGAAGAAGAATATATCTTAAGAAGTATGTCAAAGCGACGAAGGTCAACCACTACTGATGTT AAAGATGATGATGATCTCCACACTTCTCCAACGTCTGTTGCTATCAAAAGAAGAAAGAGGTCCGTCAATG TCAATGATGCTGGTGAAGTTATTCAGGAGTTATATGACATCATCAGAAACTACAAGAATGAAGATGGTAG AGTTATATGTGAAGCTCTTATCAGAATTCCCAAAAGGAGGACTACACCAGAATATTATGAAGTGGTTTCT AACCCCATTGATATGCTGAAGATTCAGCAGCGTATGAAAACAGAAGAATACGACACAGTGGATGACATGG CGGCTGATGTGGAGCTCATGGTTAACAATGCACAGGCTTACTATGAGAAAACTTCCAAGGAGCACAAAGA TGCTGTAGAGCTGTGGACAGTGTTTTTACAATCTCGTAGAGAACTGTTGGATGGTCCTGATCCTAAAGAA GCTTCAGCACCAAACAATGAGGACAATCAGCTGCATCGTCTGAGTGTATGTGTTGAGTCCCATGGCTCCT ACAGACAGATGGAGCCCCAGAAATCACCCATAGTCCTCTTAAAGAAACAGGACTATCCCCACATACCAGC ATTTCAGCTGGCTGGTATGAGTAGTAACTATGTCATACAGGAAGAAGCAAGAACCAGTGAGATGGGTGAT GATGCAGCAATAGAAGAGGAGAATAGTGGAGGACAAGTAGAAGAAAGTGGGTATATCATAGATGATCCAA ATGATCCATGTGAAATCCTCTTCAGTGCTGTGATGGGTCATAGAGATGTCACAGGGCGTATCGTTAGTTT GATGTTCCGCAAGTTACCAAGACAACAAGAATTTCCTGCCTATTATGAGATCATTGATAATCCTATTGAT CTCTGTGATATTGCTATCAAGATTAAGAACAAGAAATATGACCGTCTTGCCGATTTAGACAAGGATCTTT CTCTGATGGTGAAGAATGCCAAACAGTTCAATGAACCTGGCTCTCAGATCTACAAAGATGCTGTCACACT CAGGAAAGTCATGACTTCTAAGAAATCAGAGTTAGAGAGACAGAGTAGAGAAGGGATTAATCAAAAACAG AGACGACCATCGGCCCATGGTCAATCTGCCATTACTGAAGCTCTAAATCTTGCTGGTTACTCTGGAGTAG ACAACAAACATCCAGGCCTTAGTTTAGCCCCTCCCCTTCCTCCTCCAGCCCATCCCCTCTCTGTCTCTAC GGCCACCTCAGTTGTTAAAAGCTCTGATGTCCCTTCATCCACCGATGGTGATGATAATGACGATGATGAT GAGGGTTTCTCAGCAGACAGTCTGGACCCTCGCCATGTGCTCTTTAATTTTGTGCTGAATTTCCGCAACA ATCTAGGACAGCTGCTTTCTGAGCCTTTCATGAGATTACCAAACAGTCGGATCTATCCAGACTACTACAG AGAGATAAAGAAACCCATTGCACTCACTAAAATCAGATCAAAACTCAAGAACAACAAATACAAGGGTCTA GACGACTTAGTAACTGACATGGAACTGATGTTTCAGAATGCCTACCATTACAACATGCCCTCCTCCCAGC TGTACAAAGATGCAGAGAAGTTACATAAAGCCATGCAGCATAAGAAGAGAGAGGTTGAAAAGGGAGACGG TATGAAAGCATCACCTCTACCACTACCTCAAGAAGAAGAGGTCCCGTCAACATCACCTATCTTGAAGAAG 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	XM_041602473 >XM_041602473\|>XM_041602473.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus protein polybromo-1-like (LOC121410404), transcript variant X8, mRNA CTCCGCGGTTCGCCCTCTGCGTTCACAGTCTGTATTTTTCTTTGTTTGATGAAAAGCTGAGGCAAAACTT GATAGAGAGAGAAGAAGAATATATCTTAAGAAGTATGTCAAAGCGACGAAGGTCAACCACTACTGATGTT AAAGATGATGATGATCTCCACACTTCTCCAACGTCTGTTGCTATCAAAAGAAGAAAGAGGTCCGTCAATG TCAATGATGCTGGTGAAGTTATTCAGGAGTTATATGACATCATCAGAAACTACAAGAATGAAGATGGTAG AGTTATATGTGAAGCTCTTATCAGAATTCCCAAAAGGAGGACTACACCAGAATATTATGAAGTGGTTTCT AACCCCATTGATATGCTGAAGATTCAGCAGCGTATGAAAACAGAAGAATACGACACAGTGGATGACATGG CGGCTGATGTGGAGCTCATGGTTAACAATGCACAGGCTTACTATGAGAAAACTTCCAAGGAGCACAAAGA TGCTGTAGAGCTGTGGACAGTGTTTTTACAATCTCGTAGAGAACTGTTGGATGGTCCTGATCCTAAAGAA GCTTCAGCACCAAACAATGAGGACAATCAGCTGCATCGTCTGAGTGTATGTGTTGAGTCCCATGGCTCCT ACAGACAGATGGAGCCCCAGAAATCACCCATAGTCCTCTTAAAGAAACAGGACTATCCCCACATACCAGC ATTTCAGCTGGCTGGTATGAGTAGTAACTATGTCATACAGGAAGAAGCAAGAACCAGTGAGATGGGTGAT GATGCAGCAATAGAAGAGGAGAATAGTGGAGGACAAGTAGAAGAAAGTGGGTATATCATAGATGATCCAA 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	XM_041602472 >XM_041602472\|>XM_041602472.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus protein polybromo-1-like (LOC121410404), transcript variant X7, mRNA CTCCGCGGTTCGCCCTCTGCGTTCACAGTCTGTATTTTTCTTTGTTTGATGAAAAGCTGAGGCAAAACTT GATAGAGAGAGAAGAAGAATATATCTTAAGAAGTATGTCAAAGCGACGAAGGTCAACCACTACTGATGTT AAAGATGATGATGATCTCCACACTTCTCCAACGTCTGTTGCTATCAAAAGAAGAAAGAGGTCCGTCAATG TCAATGATGCTGGTGAAGTTATTCAGGAGTTATATGACATCATCAGAAACTACAAGAATGAAGATGGTAG AGTTATATGTGAAGCTCTTATCAGAATTCCCAAAAGGAGGACTACACCAGAATATTATGAAGTGGTTTCT AACCCCATTGATATGCTGAAGATTCAGCAGCGTATGAAAACAGAAGAATACGACACAGTGGATGACATGG CGGCTGATGTGGAGCTCATGGTTAACAATGCACAGGCTTACTATGAGAAAACTTCCAAGGAGCACAAAGA TGCTGTAGAGCTGTGGACAGTGTTTTTACAATCTCGTAGAGAACTGTTGGATGGTCCTGATCCTAAAGAA GCTTCAGCACCAAACAATGAGGACAATCAGGAAGAAGCAAGAACCAGTGAGATGGGTGATGATGCAGCAA TAGAAGAGGAGAATAGTGGAGGACAAGTAGAAGAAAGTGGGTATATCATAGATGATCCAAATGATCCATG TGAAATCCTCTTCAGTGCTGTGATGGGTCATAGAGATGTCACAGGGCGTATCGTTAGTTTGATGTTCCGC AAGTTACCAAGACAACAAGAATTTCCTGCCTATTATGAGATCATTGATAATCCTATTGATCTCTGTGATA 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	XM_041602471 >XM_041602471\|>XM_041602471.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus protein polybromo-1-like (LOC121410404), transcript variant X6, mRNA CTCCGCGGTTCGCCCTCTGCGTTCACAGTCTGTATTTTTCTTTGTTTGATGAAAAGCTGAGGCAAAACTT GATAGAGAGAGAAGAAGAATATATCTTAAGAAGTATGTCAAAGCGACGAAGGTCAACCACTACTGATGTT AAAGATGATGATGATCTCCACACTTCTCCAACGTCTGTTGCTATCAAAAGAAGAAAGAGGTCCGTCAATG TCAATGATGCTGGTGAAGTTATTCAGGAGTTATATGACATCATCAGAAACTACAAGAATGAAGATGGTAG AGTTATATGTGAAGCTCTTATCAGAATTCCCAAAAGGAGGACTACACCAGAATATTATGAAGTGGTTTCT AACCCCATTGATATGCTGAAGATTCAGCAGCGTATGAAAACAGAAGAATACGACACAGTGGATGACATGG CGGCTGATGTGGAGCTCATGGTTAACAATGCACAGGCTTACTATGAGAAAACTTCCAAGGAGCACAAAGA TGCTGTAGAGCTGTGGACAGTGTTTTTACAATCTCGTAGAGAACTGTTGGATGGTCCTGATCCTAAAGAA GCTTCAGCACCAAACAATGAGGACAATCAGCTGCATCGTCTGAGTGTATGTGTTGAGTCCCATGGCTCCT ACAGACAGATGGAGCCCCAGAAATCACCCATAGTCCTCTTAAAGAAACAGGACTATCCCCACATACCAGC ATTTCAGCTGGCTGGTATGAGTAGTAACTATGTCATACAGGAAGAAGCAAGAACCAGTGAGATGGGTGAT GATGCAGCAATAGAAGAGGAGAATAGTGGAGGACAAGTAGAAGAAAGTGGGTATATCATAGATGATCCAA 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	XM_041602468 >XM_041602468\|>XM_041602468.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus protein polybromo-1-like (LOC121410404), transcript variant X4, mRNA CTCCGCGGTTCGCCCTCTGCGTTCACAGTCTGTATTTTTCTTTGTTTGATGAAAAGCTGAGGCAAAACTT GATAGAGAGAGAAGAAGAATATATCTTAAGAAGTATGTCAAAGCGACGAAGGTCAACCACTACTGATGTT AAAGATGATGATGATCTCCACACTTCTCCAACGTCTGTTGCTATCAAAAGAAGAAAGAGGTCCGTCAATG TCAATGATGCTGGTGAAGTTATTCAGGAGTTATATGACATCATCAGAAACTACAAGAATGAAGATGGTAG AGTTATATGTGAAGCTCTTATCAGAATTCCCAAAAGGAGGACTACACCAGAATATTATGAAGTGGTTTCT AACCCCATTGATATGCTGAAGATTCAGCAGCGTATGAAAACAGAAGAATACGACACAGTGGATGACATGG CGGCTGATGTGGAGCTCATGGTTAACAATGCACAGGCTTACTATGAGAAAACTTCCAAGGAGCACAAAGA TGCTGTAGAGCTGTGGACAGTGTTTTTACAATCTCGTAGAGAACTGTTGGATGGTCCTGATCCTAAAGAA GCTTCAGCACCAAACAATGAGGACAATCAGCTGCATCGTCTGAGTGTATGTGTTGAGTCCCATGGCTCCT ACAGACAGATGGAGCCCCAGAAATCACCCATAGTCCTCTTAAAGAAACAGGACTATCCCCACATACCAGC ATTTCAGCTGGCTGGTATGAGTAGTAACTATGTCATACAGGAAGAAGCAAGAACCAGTGAGATGGGTGAT GATGCAGCAATAGAAGAGGAGAATAGTGGAGGACAAGTAGAAGAAAGTGGGTATATCATAGATGATCCAA 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AGTGTTAGGAGATGATGATGATATTACCAATGCTCTGTGGAAGATGAGAGACATCATGCAGAATGACTTC TTACAGGTGTCAAAGGCATTCCAATTTGAAACCCCTGGAATTCGGAACAGCCCTCCTATAGAGAATGCCA GTTTGGATGTATAAATGTCAAGAATGAATGCCACAATTCATTGTGAATAAGCTGCTGCAAAATTATTCTT GTTGCCTTCTATTTATTGCTTCAAACCTTAATATTTCCAGGTGGCAATTTACATGAGAAGAGTCATGTGC ATTTGTACATAATGGCCTGTCTATATTTCATACTCTACTCTTCTAGTGTTAGCGATGTTTAATTATTACA TTACTTTGAAATTTAGAATGGTCCTAAATCTTTACCAATCCGATTGATCAGAATATATACAATTCATCAA CATTTAGGCATTTGATTATACATACGACATGAATTTGTTTCTAATCTGTAATATATGTTGTGAACTGGAT TTTGGCTAAAATGTAATGACTTGGTGCTATGCTGTCAAGAATTTAAAGCTTCTGTTGTAATTGCTGGTAT TCAAACTAAATGGACAAAATAGCAGTTGTGTAGAAGGTTGTAGCAATGTTGCTAATCATATGGATATTTT GTCAAGTGTTGAACAGTTTTGAAAAGTAGAATTAGAATATTATGTGATAAATACGGAGTTGATGATGATT CAAAGATATTTCACATAAAAATATTGAATTGCAAATTTTTATTTTATTTTCAAGTCAATGAATTGTAGGG CAGTGGGGGAATCTGTCAAGTTCAATAAAAATTCTAGAAGAGATATGTAAAGATAGGGAGACAAAGAGGA AGCTATGAGTTCAAGAATATGTGGGTTGGCTGAAAATGTTCTTATGTCACAATTTATTAAGGAGAAAGGA TGATAGATCACTAGAAAAATACTATCTCATCTGCGTGATAGAATTATGATTTATTAGTGAAAACCAAACA 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	XM_041602467 >XM_041602467\|>XM_041602467.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus protein polybromo-1-like (LOC121410404), transcript variant X3, mRNA CACAGTCTGTATTTTTCTTTGTTTGATGAAAAGCTGAGGCAAAACTTGATAGAGAAGAAGAATATATCTT AAGAAGTATGTCAAAGCGACGAAGGTCAACCACTACTGATGTTAAAGATGATGATGATCTCCACACTTCT CCAACGTCTGTTGCTATCAAAAGAAGAAAGAGGTCCGTCAATGTCAATGATGCTGGTGAAGTTATTCAGG AGTTATATGACATCATCAGAAACTACAAGAATGAAGATGGTAGAGTTATATGTGAAGCTCTTATCAGAAT TCCCAAAAGGAGGACTACACCAGAATATTATGAAGTGGTTTCTAACCCCATTGATATGCTGAAGATTCAG CAGCGTATGAAAACAGAAGAATACGACACAGTGGATGACATGGCGGCTGATGTGGAGCTCATGGTTAACA ATGCACAGGCTTACTATGAGAAAACTTCCAAGGAGCACAAAGATGCTGTAGAGCTGTGGACAGTGTTTTT ACAATCTCGTAGAGAACTGTTGGATGGTCCTGATCCTAAAGAAGCTTCAGCACCAAACAATGAGGACAAT CAGCTGCATCGTCTGAGTGTATGTGTTGAGTCCCATGGCTCCTACAGACAGATGGAGCCCCAGAAATCAC CCATAGTCCTCTTAAAGAAACAGGACTATCCCCACATACCAGCATTTCAGCTGGCTGGTATGAGTAGTAA CTATGTCATACAGGAAGAAGCAAGAACCAGTGAGATGGGTGATGATGCAGCAATAGAAGAGGAGAATAGT GGAGGACAAGTAGAAGAAAGTGGGTATATCATAGATGATCCAAATGATCCATGTGAAATCCTCTTCAGTG 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	XM_041602466 >XM_041602466\|>XM_041602466.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus protein polybromo-1-like (LOC121410404), transcript variant X2, mRNA CTGCGTTCACAGTCTGTATTTTTCTTTGTTTGATGAAAAGCTGAGGCAAAACTTGATAGAGAGAGAAGAA TATATCTTAAGAAGTATGTCAAAGCGACGAAGGTCAACCACTACTGATGTTAAAGATGATGATGATCTCC ACACTTCTCCAACGTCTGTTGCTATCAAAAGAAGAAAGAGGTCCGTCAATGTCAATGATGCTGGTGAAGT TATTCAGGAGTTATATGACATCATCAGAAACTACAAGAATGAAGATGGTAGAGTTATATGTGAAGCTCTT ATCAGAATTCCCAAAAGGAGGACTACACCAGAATATTATGAAGTGGTTTCTAACCCCATTGATATGCTGA AGATTCAGCAGCGTATGAAAACAGAAGAATACGACACAGTGGATGACATGGCGGCTGATGTGGAGCTCAT GGTTAACAATGCACAGGCTTACTATGAGAAAACTTCCAAGGAGCACAAAGATGCTGTAGAGCTGTGGACA GTGTTTTTACAATCTCGTAGAGAACTGTTGGATGGTCCTGATCCTAAAGAAGCTTCAGCACCAAACAATG AGGACAATCAGCTGCATCGTCTGAGTGTATGTGTTGAGTCCCATGGCTCCTACAGACAGATGGAGCCCCA GAAATCACCCATAGTCCTCTTAAAGAAACAGGACTATCCCCACATACCAGCATTTCAGCTGGCTGGTATG AGTAGTAACTATGTCATACAGGAAGAAGCAAGAACCAGTGAGATGGGTGATGATGCAGCAATAGAAGAGG AGAATAGTGGAGGACAAGTAGAAGAAAGTGGGTATATCATAGATGATCCAAATGATCCATGTGAAATCCT 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	XM_041602465 >XM_041602465\|>XM_041602465.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus protein polybromo-1-like (LOC121410404), transcript variant X1, mRNA CTCCGCGGTTCGCCCTCTGCGTTCACAGTCTGTATTTTTCTTTGTTTGATGAAAAGCTGAGGCAAAACTT GATAGAGAGAGAAGAAGAATATATCTTAAGAAGTATGTCAAAGCGACGAAGGTCAACCACTACTGATGTT AAAGATGATGATGATCTCCACACTTCTCCAACGTCTGTTGCTATCAAAAGAAGAAAGAGGTCCGTCAATG TCAATGATGCTGGTGAAGTTATTCAGGAGTTATATGACATCATCAGAAACTACAAGAATGAAGATGGTAG AGTTATATGTGAAGCTCTTATCAGAATTCCCAAAAGGAGGACTACACCAGAATATTATGAAGTGGTTTCT AACCCCATTGATATGCTGAAGATTCAGCAGCGTATGAAAACAGAAGAATACGACACAGTGGATGACATGG CGGCTGATGTGGAGCTCATGGTTAACAATGCACAGGCTTACTATGAGAAAACTTCCAAGGAGCACAAAGA TGCTGTAGAGCTGTGGACAGTGTTTTTACAATCTCGTAGAGAACTGTTGGATGGTCCTGATCCTAAAGAA GCTTCAGCACCAAACAATGAGGACAATCAGCTGCATCGTCTGAGTGTATGTGTTGAGTCCCATGGCTCCT ACAGACAGATGGAGCCCCAGAAATCACCCATAGTCCTCTTAAAGAAACAGGACTATCCCCACATACCAGC ATTTCAGCTGGCTGGTATGAGTAGTAACTATGTCATACAGGAAGAAGCAAGAACCAGTGAGATGGGTGAT GATGCAGCAATAGAAGAGGAGAATAGTGGAGGACAAGTAGAAGAAAGTGGGTATATCATAGATGATCCAA 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	GAUR01081446 >GAUR01081446\|>GAUR01081446.1 TSA: Lytechinus variegatus AMR9006.39801.0.1 transcribed RNA sequence TTTTCTTTGTTTGACGAAAAGCTGAGGCAAAACTTGATAGAGAGAGAAGAAGAATATATCTTAAGAAGTA TGTCAAAGCGACGAAGGTCAACCACTACTGATGTTAAAGATGATGATGATCTCCACACTTCTCCAACGTC TGTTGCTATCAAAAGAAGAAAGAGGTCCGTCAATGTCAATGATGCTGGTGAAGTTATTCAGGAGTTATAT GACATCATCAGAAACTACAAGAATGAAGATGGTAGAGTTATATGTGAAGCTCTTATCAGAATTCCCAAAA GGAGGACTACACCAGAATATTATGAAGTGGTTTCTAACCCCATTGATATGCTGAAGATTCAGCAGCGTAT GAAAACAGAAGAATACGACACAGTGGATGACATGGCGGCTGATGTGGAGCTCATGGTTA	L. variegatus

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