LOC373238 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (12)

Interactants (0)

ECB-GENEPAGE-23103534

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for LOC373238 - Patiria miniata

Models - Gene (1)

Models - mRNA (0)

mRNAs (3)

ESTs (0)

Models - Gene (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	3.0	LOC119719788 >LOC119719788 GCCGCGAGAGGGCGCTATCACGACCAACCGATACGGACTTTAATGGCGCCACAAAACGATTTTGTTCTGGACATTTTCTACAGTGTCACAGACACAATCACCAGGTCTACATTCAGTTGTTGAAAGATTTTCTCTGCAGCGTTAACTACCACAAGAGCAACCATGCCTCGTGAAATAATTACTCTTCAACTTGGGCAGTGTGGTAACCAAAGTAAGTCTCACGTTAAATTTTGGGTAGGGTCGTTTACTCGTTGACGTGTAATTCATTTTGTGTTATGTTACTTGCCTATTTTCTCAATTAAAGGGAATATACATCATTTGCTTTTGCTGTAATTTTCAGAAATGGATGGAATTGGGGGGTTGGAAATATATAGCAAATATAGTTACACTGACTTTTTTGAGGTTTTGGGTTCGAAAATGCTATAAAACCAAGAAAAACGATCATTTTCCTGTAGTCTGGTTCCCTGACTCCATATAAGAAGAACAGAGCAGTTTACATACATTGGGGAATTGTAAGGTCAGGGAACCAGTGTAGCTGGCTTGTTCCCGTTCATTGGTTTGTAATTGATGTGCGATGGTCAATTGGGGCCAGTATTTGAAAAAAAGCCAGTTGTTTCCAACGCTGATCGGCCAATCAGCGTTGGAAATTGATACAAAAATACCACTTTTCTTGAAAATGACAGTAGGCCTATACCAGGTGCCATGATTTTACAGGATGCTTTACACTGTCATTCACTAACAGTCCAGCAAGGTATTTCAAAATGATTTGGTAGTTTTATTTTTGATGTTTGCAAATGTTGTATTTTCCCTTTAAAGTTCAAATGCGCCACCACACCTTTGTTCTGCTGACAATGACATACCCAGGCACACGGCGGGTGCCTTCTAATTCTAGACGTATGCTGACATATCCAGCATGTCCAGTGATCATGATGATCTACTTCTAGAATTAGAAGGCTTTCTCCGTTAGCCTCCTCCTAAGTCCTAGGCTAGCATGGAGGAAGGAATTCCGGCGATCGTGAAGTGTAGGGCCCCTGTTTTGTTTTGATCAAATTAGGGTCAAAAATGTCTTTTATTGCTCAAAAATCACCTTTACAATCAAAAGCAGACTTTTCTGAATCTAATTCTAATGATGCCCATTTTGCAATTTTGAACAGATTCGTGGGGTAGAAATCACGATTTTCCTGCGCGGTTTGTGCCTTGTGATTCAGAGCGCCGTGCGTGCTCATGCACGGTACATCGCGTGGTGATCGCCATCTTTATTTTCGGGTCGCATGTTGTCACCGCACTGTCATCGTCATTTTACCCCCAAATTTCCCTCAAAAAATCAAAACCCTGCCCTCTACTACTTGCCAACTTGCAACTAGTTTGGTAGGTCCAATAATTTTAAAGTGGATTTTGTTCCCTTATACTAGGAACCGGGCCCTACATTACACGATCGCCGGAATTCCTACCTCCATAGTACTCCTACTAGAACGGTGATCGTGTAAACTTGTGTATTTATAATGTAATACATATAAAAAGTTTGATTTGGGTTGCAGACGTCGTTTTGGAGTGATGAACTACTTAAAAGATACATTTGTAAAAAGAAAACCTGCATAACATATTGCCAGCCAACTATCTTGCCCTTAATTATCTCAACACAATAACAAGTCTGCTATTTCCTATTTACACTGTGCAGTTGGCTTTGAGTTTTGGAAGCAGCTGTGCTCAGAGCATGGCATCAGCCCAGAAGGAATACTGGAGGACTTCGCTACCAATGACACTGATCGCAAAGATGTCTTCTTTTACCAGGTAGGCACTGTTGGACATTTTAAGGGAACTTTTGTGTTGGCAGCTCACAAGACTCAAGTGAAGACATCAACCCTGTATGCAGTAAATATTGCTGCGTTTTACCATCTTTAGTCATACACAATCCTGCAAAACCGCTTGGATTTTTTAAGATTATGTGCAGATCAGGGTTAACATATCTATTTCATCGATATCATTATTCATGTTTTTTTTTTCACAACATGTACATTCTCAGGGTTGGATCTGAGTCAAGCCCAAGATTTTTAGCTTGGTTGCACTTGCAACACTTAAAATGAACTTAGCAAAAAGGCATTCTTACTGGATTAAAACCTACTCTGGTTTGGTAAGGATCGATCAGGGATTACATGTACATGAAATGTTAAAAGCTCGATGGATCTCGGATGGAAGTCGGAAAGATTATATTGTACAGTCTGTGACTAGTTTCAACATTTCAGTATGAGAACACCAATACAGTTTGATCTATAAAGACAGAAAGGCAACCCACATCCATTTCATATAATCAGGGTTGACTTATGATACATGTAGCAGTTCAAAGATGCCTAAGAATGTAGCTATGAATCCTGCTGATGTCCCTAAGCAGGACACTTTACAACAATCCCTTCCTTTGTCATGCATACAGGCAGATGATGAGCATTACATTCCCCGCGCTGTGCTGCTAGACTTGGAGCCCCGTGTCATCCACAGCATTCTGAATTCTTCCTATGCCAATCTGTTCAACCCAGAGAACATCTACCTGTCCAAACACGGTGGGGGAGCCGGTAATAACTGGGCATCAGGATATGAACAGGTACAATCAACCCCCAACTTCTTGCCAATTTTACATTTTTAACATTTTAAAAGGTCACATGTGACGTGTGCATGTACTGCGCCAAACAGTCCTGCCTGTTACTCCATGTATTGCTTGAATCCACCTAGCAGCACTGTACAGTTTGATGGATTCAACAGGAATTGCATGTACCATGTAATGCAATGTAGAACTGTCGCTAAAAGGTTAAGGTTACATTGCATTATGGACAACGGGGTGAATCTGACTTTTTTGGCCCCAGTGGTAATGGATATATACAACTATATGGGATCATGTTCTAACTTGTTATGACATTCACTATTTGTTTTCATGTTCAGGGAGATCGTTTGTATGAGGAAGTATTTGACATCATTGACAGGGAGGCTGATGGTAGTGACAGTCTAGAGGTCGGTTGAAATAATAATAATAACAATTACAATAATATGGTGCTGATATACATTTATTGTAGTAGTTTATGCCGAAGTTTCAAAGCACTTCTCAATTATTACCCCTGTTCATCACGCCGTAAAACCAGTTCTCTGCAGCAGCTCGAAATAAGCACAATCTGTTTCCTACCCTCACTGGTCGAAGGAGCGCGGAGTGCGTGCGTACTACCTGAGCACGACTCATGTGAGCCTTGCGCCACCGCAGAAAGCGACAGTCGCTGAATTAGTCTATACATTACGTTCCATTGCACCAAGTTGTGACCTGATAGAATCTTGGAAGAAATGTCCATCACAGAACACTTCTTACAACTCTTGGCTACTTTAGAGTGATGTTACGTCTTACTTCATTTGTGTTGATTGCAGGGTTTTGTACTGTGTCATTCTATCGCCGGGGGTACAGGGTCGGGCATGGGATCGTACCTGCTGGAAAGACTCAACGACAGGTCAGTACAAGACAGCTAGGAAAAATGAAGAAGTATACACCATCACCTGTTGTAATCAGAGATAAAACTTTCCCAATTTTTTATCAAAAATCTGACTTTTTCAAATTTATTTCCAAAATTCTGATTTTCTAACAATCTTTTCCCTGCAAAGTCTGAATTTTAAAATTAGATTTAAATGAAATTCATGAATACGGCACTGTGACATCTGTATTGCGAGTGCAATTTTAATCTGTTCCTCCAGTCGTTAATGCAAAGATTGTATCGTAGAGGCACAAACATGTACCGGTAAGTAAGCCCGGATTGGAGTAGTTTTTTTTTAACAGCTGGAAATAAGTTTAAGCATTAACCCCTCACATAATTTGTAAAGAGCTTCAGGGCTTTTGCACGTGGAGTTCGACTACCATGACTGAAACTAGTAAAAGCCATATGTTGCACAATTTTCGGTGGTTTCAGATTTAGTTGTACAAAATGCAATGCTTTAAAAATCATGATGGTTATCTTGAGGATGGCAAAGAGAGCCTAAATTATAGATTTCACTGGCAGTTGTTGAAAAAAGAAGATGATAATGCCACTTTTTTTGTGGAGCTGTTTGGTTGAATGGTGCACTTGTCTTGAGACCCTCCTTTTGTTTGATCAGTCACAGACAGTCAAAAATTCAATCCTGTTCCCCTGCCATGTCTATACACATGCTAGTCACCAACAGTCAGATCATGTTTCTTGTAGGCATTGTGACTAGTCAAATGCCATCAACAGACAAAATCAAATAACTGAAAGGTACAGCTGGCTTGTCAATCTCCTACAGCCAAAGCAAAGCTGTATCAAATTACATAAACAGTCACAGCCAGTCAATCCTGCTTTATGAAGGCAGGGAGCACTAAACTGTTAAAAACAGTCACTTGATTTAATTTTAATGCTGGGCTGGCCTTCTTGAAATTGCCAGCCAAAGAGACAGAGGGTTAATGTGACATGTGGAATAATTTCCAATCCATATACATTTCCAATCCAAAGATTCAGTTCAACTTCTGAGCTTGCATCCATTGGACTAATTGTCTCTCAAAGTAGTGCGTGCACTATGGTAAATGTTTCGCCTAACATTACCATCATTATATTATGCTTTGCTTTCCATCCTAGATTTCCCAAGAAGTTAATCCAGACCTACTCAGTCTTTCCCAACCAGCAGGAGATCAGTGACGTAGTGGTGCAGCCATATAACTCCATGCTAACACTCAAGAGACTGACACAGAATGCAGACTGTGTGGTGAGTTACAGAGTCTTAATACTGTACACGGGTAACTTGTTAGAGCAGTGCATCGAGCTTTGTAAAGTTACTGGAGAGCTATCATACACAGCATAGCCTGCTGGGTGAATCCACTAACCTATGATATGCTCAAAATTTGGTACAGTTCTTGTTTGGTTATTAGCATATGGGTCATTCTTTAATCCTAACCTTCCCAAATCCTCCAAAATACTCCTTGCAAAACGGAGGATTTTGCAAAATGGAGGATTTTGCAGGAATGA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ATATGTTTCGTCACCATTGCATTTTTTTCAAATAAATGGTGTTGGATGTGTTGAAATAAAATGTAGTTTTTGATACCTACA	P. miniata

Models - mRNA (0)

mRNAs (3)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_038189278 >XM_038189278\|>XM_038189278.1 PREDICTED: Patiria miniata tubulin gamma-1 chain (LOC119719788), mRNA GCCGCGAGAGGGCGCTATCACGACCAACCGATACGGACTTTAATGGCGCCACAAAACGATTTTGTTCTGG ACATTTTCTACAGTGTCACAGACACAATCACCAGGTCTACATTCAGTTGTTGAAAGATTTTCTCTGCAGC GTTAACTACCACAAGAGCAACCATGCCTCGTGAAATAATTACTCTTCAACTTGGGCAGTGTGGTAACCAA ATTGGCTTTGAGTTTTGGAAGCAGCTGTGCTCAGAGCATGGCATCAGCCCAGAAGGAATACTGGAGGACT TCGCTACCAATGACACTGATCGCAAAGATGTCTTCTTTTACCAGGCAGATGATGAGCATTACATTCCCCG CGCTGTGCTGCTAGACTTGGAGCCCCGTGTCATCCACAGCATTCTGAATTCTTCCTATGCCAATCTGTTC AACCCAGAGAACATCTACCTGTCCAAACACGGTGGGGGAGCCGGTAATAACTGGGCATCAGGATATGAAC AGGGAGATCGTTTGTATGAGGAAGTATTTGACATCATTGACAGGGAGGCTGATGGTAGTGACAGTCTAGA GGGTTTTGTACTGTGTCATTCTATCGCCGGGGGTACAGGGTCGGGCATGGGATCGTACCTGCTGGAAAGA CTCAACGACAGATTTCCCAAGAAGTTAATCCAGACCTACTCAGTCTTTCCCAACCAGCAGGAGATCAGTG ACGTAGTGGTGCAGCCATATAACTCCATGCTAACACTCAAGAGACTGACACAGAATGCAGACTGTGTGGT TGTGCTGGATAACACAGCTATGAATCGTATAGCCAGCGAGCGTTTGCATCTATCTAACCCAGACTTCACA CAGATCAACCAAATGGTATCAACAATCATGTCTACAAGTACCACCACACTTCGTTATCCTGGCTACATGA ATAATGACCTGATAGGACTGATAGCATCTCTAATCCCTACCCCTAGACTACACTTCCTAATGACTGGATA CACGCCACTCACAGTCAGCTCAGATCTCAAGTCCAAGAGTGTCCGCAAGACCACAGTATTAGACGTGATG CGACGTCTGCTACAACCCAAGAACATCATGGTGTCTACCACACTGCGTGACAGACAGAGCAACCATTGCT ACATCTCCATCTTGAACATCATCCAAGGAGAAGTGGACCCAACGCAGGTGCACAAGAGTCTTCAGCGAAT CCGTGAGCGTAAGCTAGCTCAGTTCATCCCCTGGGGGCCAGCAAGTATCCAGGTTGCCTTGTCACGCAAG TCACCATACGTCCAGACAGCTAATAGAGTCAGTGGCTTAATGCTGGCCAATCATACCAGCATTACTACGC TGTTTGAGAGGACGTGCCAGCAGTATGACAAGCTACGCAAGCGAGAGGCTTTCCTGGAACAGTTCCGTAA GCAAGCCATCTTCAAAGACAATTTGGATGAGTTGGATAACTCCAGAGAGGTCGTCCAACAACTGATAGAT GAATATCATGCTGCTACCAAGCCAGACTACATCTCCTGGGGTACACAACAGGCTGCAGAGGGAGGCAAGT CATAAAGTGGAATGGCTGCGCCAAGCTCAATAAAGATCTGTACATACTACGCTGTGGAAACAGAATTTGC ATCAGAGGTTACTGGGACAGGTTCAAACCTAAACATGTTTTAACCCGGTCCCTTCAATGAGGAGAGACCT GCTTTTTGTATTTTTGTGGCTTGAAAAAAATTACATGAACAAAATGTATAATAATCCTGGTGGAAGGATA ATCTGAGGATCAGTGATTCACGTGGGCAGAGCCACGGCTGAGCGTCTGATATAAGCAGGGGTAGGAAATC TCAGCTTTAAAGCTGATTTCAGCTTTTAAGTGTGTTGGATTTCACCCTTTTTTTCAGCTTTTTCCCTCAC TTGCTGGGTACAAAAGTATAAGAGATCTCCAACATTCAGCTTTTTTACACTTTTTTCAGCTGTTTTCAGC TATTTTTATCAGTGGTCACTCACACCCCTGGCTAGCATGCAAATTTGATATGACCTCGCTTGCCAGCCAA TCAGAGTGATCTTTAGAAACTCTGATGTCATTTCCATCAGAAATATGGACTAAGCTGTGGGTTGGTCGAT TTGGATGCCATGTTTTAGTTTGAAATACATCGACCGGTAACGGAAGACCTGACAGAAGGCGCCTGCTGAA TGGTCAGAATCTCGAGGTCAAGACACAGTCTTGTTTTGCATAATTTATTGCCGAATCTACGCACATATCA TAGACCCTTGCTGTGCAATGGGATATTCCATAGACTAGTGGAAGGAAAGCTTCGTATTAGAAAAAATAAC GAGGTCCAAATTGCTGATGTGCATGCATAAGTCATCTGTAAAACTGTAGACAATTTTTTTTCACTTTGTC CCATAGTTTTGCTTTATAGTTCCGTTCAATTTCATAAAAAGTGTTCCACGTTTTAAAGGCCTGTACTACC TTCTTCGAATTTATGTGCTATGCAGCATATGTAATTTGATGAGGTTGGGAAAATTATGTTGATTTTTTTG GAAAATTTCAAAAGATGGTTTGGTTTGATGGCTTATTGGGAAAAAAATCCGAAAAAAAATGGAATAATGT GAATTCCTTAGAAGGCAAACCATGTCACACTTTAAAGATGATTTGCAAGAGCCATGTACAAAATGTAGAA ACAAATTGTAAATTATGTACGCTTTGCAGAGACTGAACTTGTAAATATGTTTCGTCACCATTGCATTTTT TTCAAATAAATGGTGTTGGATGTGTTGAAATAAAATGTAGTTTTTGATACCTACA	P. miniata
	KU512187 >KU512187\|>KU512187.1 Patiria miniata isolate c30420_g2_i1 gamma-tubulin mRNA, complete cds AGAGGGCGCTATCACGACCAACCGATACGGACTTTAATGGCGCCACAAAACGATTTTGTTCTAGACTTTT TCTACAGTGTCACAGACACAGTCACCAGGTCTACATTCAGTTGTTGAAAGATTTTCTCTGCAGTGTTAAC TACCACAAGAGCAACCATGCCTCGTGAAATAATTACTCTTCAACTTGGGCAGTGTGGTAACCAAATTGGC TTTGAGTTTTGGAAGCAGCTGTGCTCAGAGCATGGCATCAGTCCAGAAGGAATACTGGAGGACTTCGCTA CCAATGACACTGATCGCAAAGATGTCTTCTTTTACCAGGCAGATGATGAGCATTACATTCCACGTGCTGT GCTGCTAGACTTGGAGCCTCGTGTCATCCACAGCATTCTGAATTCTTCCTATGCCAATCTGTTCAACCCA GAGAACATCTACCTGTCCAAACACGGTGGGGGAGCCGGTAATAACTGGGCATCAGGATATGAACAGGGAG ATCGTTTGTATGAGGAAGTATTTGACATCATTGACAGGGAGGCTGATGGTAGTGACAGTCTAGAGGGTTT TGTACTGTGTCATTCTATCGCCGGGGGTACAGGGTCGGGCATGGGATCGTACCTGCTGGAAAGACTCAAC GACAGATTTCCCAAGAAGTTAATCCAGACCTACTCAGTCTTTCCCAACCAGCAGGAGATCAGTGACGTAG TGGTGCAGCCATATAACTCCATGCTAACACTCAAGAGACTGACACAGAACGCAGACTGTGTGGTTGTGCT GGATAACACAGCTATGAATCGTATAGCCAGCGAGCGTTTGCATCTATCTAACCCAGACTTCACACAGATC AACCAAATGGTATCAACAATCATGTCCACAAGTACTACTACACTTCGTTATCCTGGCTACATGAATAATG ACCTGATAGGACTGATAGCGTCTCTAATCCCTACCCCTAGACTACACTTCCTAATGACTGGATACACGCC ACTCACAGTCAGCTCAGATCTCAAGTCCAAGAGTGTCCGAAAGACCACAGTATTAGACGTGATGCGACGT CTGCTCCAACCCAAGAACATCATGGTGTCTACCACACTGCGTGACAGACAGAGCAACCATTGCTACATCT CCATCTTGAACATCATCCAAGGAGAAGTGGACCCAACACAGGTGCACAAGAGTCTTCAGCGAATCCGTGA GCGTAAGCTAGCTCAGTTCATCCCCTGGGGGCCAGCAAGTATCCAGGTTGCCTTGTCACGCAAGTCACCA TACGTCCAGACAGCGAACCGAGTCAGTGGCTTAATGCTGGCCAATCATACCAGCATTACTACGCTGTTTG AGAGGACCTGCCAGCAGTATGACAAGCTACGCAAGCGAGAGGCTTTCCTGGAACAGTTCCGTAAGCAAGC CATCTTCAAGGACAACTTGGATGAGTTGGATAACTCCAGAGAGGTCGTCCAACAACTGATAGATGAATAC CATGCTGCTACCAAGCCAGACTACATTTCCTGGGGTACACAACAGGCTGCAGAGGGAGGCAAGTCATAAA CTGGAATGGCTGCGCCAAGCTCAATAAAGATC	P. miniata
	GAWB01035383 >GAWB01035383\|>GAWB01035383.1 TSA: Patiria miniata AMR9002.34546.0.1 transcribed RNA sequence GAGATTTCACACCCCTGCTTATATCAGACGCTCAGCCCTGGCTCTGCCCATGTGAATCACTGATCATCAG ATAATCCTTCCACCAGGATTATTATACATTTTTTCATGTAATTTTTTTCAAGCCACAAAAATACAAAAAG CAGGTCTCTCCTCATTGAAGGGACCGGGTTAAAACATTTTTCGGTTTGAACCTGTCCCAGTTACCTCTGA TGCAAATTCTGTTTCCACAGTGTAGTATGTACAGATCTTTATTGAGCTTGGCGCAGCCATTCCAGTTTAT GACTTGCCTCCCTCTGCAGCCTGTTGTGTACCCCAGGAGATGTAGTCTGGCTTGGTAGCAGCATGGTATT CATCTATCAGTTGTTGGACGACCTCTCTGGAGTTATCCAACTCATCCAAGTTGTCTTTGAAGATGGCTTG CTTACGGAACTGTTCCAGGAAAGCCTCTCGCTTGCGTAGCTTGTCATACTGCTGGCACGTCCTCTCAAAC AGCGTAGTAATGCTGGTATGATTGGCCAGCATTAAGCCACTGACTCGATTCGCTGTCTGGACGTATGGTG ACTTGCGTGACAAGGCGACCTGGATACTTGCTGGCCCCCAGGGGATGAACTGAGCTAGCTTACGCTCACG GATTCGCTGAAGACTCTTGTGCACCTGTGTCGGGTCCACTTCTCCTTGTATGATGTTCAGGATGGAGATG TAGCAATGGTTGCTCTGTCTGTCACGCAGTGTGGTAGACACCATGATGTTCTTGGGTTGTAGCAGACGTC GCATCACGTCTAATACTGTGGTCTTGCGGACACTCTTGGACTTGAGATCTGAGCTGACTGTGAGTGGCGT GTATCCAGTCATTAGGAAGTGTAGTCTAGGCGTAGGGATTAGAGATGCTATCAGTCCTATCAGGTCATTA TTCATGTAGCCAGGATAACGAAGTGTAGTAGTACTTGTGGACATGATTGTTGATACCATTTGGTTGATCT GTGTGAAGTCTGGGTTCGATAGATGCAAACGCTCGCTGGCTATACGATTCATAGCTGTGTTATCCAGCAC AACCACACAGTCTGCATTCTGTGTCAGTCTCTTGAGTGTTAGCATGGAGTTATATGGCTGCACCACTACG TCACTGATCTCCTGCTGGTTGGGAAAGACTGAGTAGGTCTGGATTAACTTCTTGGGAAATCTGTCGTTGA GTCTTTCCAGTAGGTATGATCCCATGCCCGACCCTGTACCCCCAGCGATAGAATGACACAGTACAAAACC CTCCAGACTGTCACTACCGTCAGCCTCCCTGTCAATGATGTCAAACACTTCCTCATACAAACGATCTCCC TGTTCATATCCTGATGCCCAGTTATTACCGGCTCCCCCACCATGTTTGGACAGGTAGATGTTCTCTGGGT TGAACAGATTGGCATAGGAAGAATTCAGAATGCTGTGAATGACACGAGGCTCCAAGTCTAGCAGCACAGC GCGGGGAATGTAATGCTCATCATCTGCCTGGTAAAAGAAGACATCTTTGCGATCAGTGTCATTGGTAGCA AAGTCCTCCAGTATTCCTTCTGGGCTGATGCCATGCTCTGAGCACAGCTGCTTCCAAAACTCAAAGCCAA TTTGGTTACCACACTGCCCAAGTTGAAGAGTAATTATTTCACGAGGCATGGTTGCTCTTGTGGTAGTTAA CGCTGCAGAGAAAATCTTTCAACAACTGAATGTAGACCTGGTGATTGTGTCTGTGACACTGTAGAAAATG TCCAGAACAAAATCGTTTTGTGGCGCCATTAAAGTCTGTGGGCGAAA	P. miniata

ESTs (0)