isca2 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (7)

Interactants (12)

ECB-GENEPAGE-23152291

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for isca2 - All

Models - Gene (3)

Models - mRNA (1)

mRNAs (5)

ESTs (0)

Models - Gene (3)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	LOC578588 >LOC578588 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purpuratus
NCBI_REFSEQ/JGI	3.0	LOC121418569 >LOC121418569 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variegatus
NCBI_REFSEQ/JGI	1.0	LOC110979246 >LOC110979246 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TCCCTGGGGTACATCAAGGGTGCCACGGTGGACTACCACGAGGAGTTGATTCGTTCGGCCTTCAGGGTCATCAATATCCCCATGGCCGAGAACGGCTGTTCATGTGGCGTTTCCTTCTCTCTCAAGTTATAACGAGTGGTGTGTGAAAAGTTTGCCAAAAGAGGTACAGTTTTTGGGTGCTGGATTTCAGTTTAGGCCTGCAAGACTTTGTTTTGTAGAGCTAATAAGTGGAAAATATTGCCTAGCAAACTTACACTCATGTATTTAGTTAATTTATCCAGCTGGGATCCATTGACAAGCTATTTTTTGTGCTGAGTGACAGGGTTTCAGCCAGCAGTTGAAAAAAGAGGTCCACATTTGCCttggagtaaaaaaaacaaaaacaaacactgggCGTCCAGTCTGCTAAGTTTATATGATGAATGTGCTTCTTGCAACATACCAACATGTAAAAGATGGCCTGTGGTGTGTACAAAGATGCCTAGGCCAAGGCTAAAACGTAACAGTTGTTCAGCGGCTCAGAGAAATTCAGTCTGATTAATCCAAGACTCTGTGCAGATAGTTGATGTTGGGTGGCATTGCTTAGGGAGCAGGATATTCACTCATATTAGTTTTTGTACACTGCATGGAGTACACAGTTTTTCATCGGAATGGGTACAAACCTTTTGTATCTTTGCATGGACTCTGGACAAGCTTAGTGTCAGTAGCATTCCAGGTGTCCTATTTCTCTATTCCACATACCTCTATTCCACATACTTTGGAGCCCTGTATCTAGGTGATTAAATTGAGGATAGTTGTATTTATTGCCAAAGAAATTTGCACTGTGTAACTGGATGTCCACTAGGGCAGGATTTCTTCTGGTTACTCCTGATCCTGAGGTTCACAGAAGGTTATCTATCCCCAACATTAGCTTCGTTACTTTCCAGTCTTCATTTTATTGTGGACCAAGTTAtagaaacaagtttgaaatcgAATTAAATTAGTTCAGATTTTCAAGCAGATACCGGTACCTCCAAAAAAGTTGCCAACCAATGATATAACTTGTTGTGCATTTAAAATTTGGGGTCTGTATTTTCCTTAATCACCTTCCACAACTTACTTGCATTTTTGTGTCTGGACAGAAGTGTCAGTGACCGCCTACCTGCTGGACTTCAGTGATGAGTTTAGCCGTGCACTATTTGTTTCCCTGCTTGGTGTGCTTGCTAGTCTCTCCACCAACCTGTCTTGGCAAGAAGTCTTTGGACTTGGTGAACTCCAGCCAAATGAAGTCTTCATTGTTGAAGTGCAGGCTCAACAGGAGTTAAGTCTTCAAACTGTGTTGACTTGTACTGCTCTGAGTTTACACTCTTTAACATTGACTACTTTTACCAATTtccaacttttctcatttttgttaaaaaatgtacTCCTAAAAGCAGCATGCTTAAAACTTTAACACATCTCAGttgctgttttgtacatgtatgtgtaatataATGTGACTGAGAGGAGAGGTACAAATCTGTAAAATGGATGTGAGAAATATTCATTGACTTAATGAAGGTAAACTGTGAGCATAATTTGCCAGTCACGAGGCTGTTGAATGTGGTACCACTAACAAGCTGACCTGCTGTCATACTGCTCTTGCATGGTTGGAATGGGTAAGGAGTCTAGGAGTTTATTCTGGGTTGAGCATGGAGACAGTACAGGATACCACTGACCAGCCAACAGGGAATGCATCCTGCATTGTGAAGTAAGCATCTTCTGGAGTCTTGATGCATTGCTGCATTGACTACCGAAATAAGTTGAGTCACATGATGAGTTGGCCCATGTACCACTGAATTGCCAAAGAACTCAGTTCTCAATTctattaacccctttgcgccgggacGTGGATaaagccgccgtaaaaattgagatcctcagcccgcttttcagctattat	A. planci

Models - mRNA (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_003730577.3 >XM_003730577.3 CGCGAGAGAGAGAGTCGATGCATAAAATAATACTGTCATCAGATGATGTGAATGTCGCTCAAAAAACAAGTTAAAATGGCAGCATGTGGTTACAGATTGATGGGCACTCTCATAGGTGCTTGCAGACGTTCATCTGTAATAATGCATAACAGGACTCAAGCATTGAAGTGTGCCCCAACCACTGGATCTAAGACTCAGCTAATGTCAACAGGAGCAGAAGCACAAGAATCAACTCAACCTGAGCTCAAACTGAGTGATAGCTGTGTTAAGCAACTGCACAAACTCGGAGAGGACAAAGAGTTTCTTAGGATTCTTGTTGAAGGAGGAGGATGTTCAGGCTTCCAATACAAGTTTGAAATGGATTCAGAGATGACAGACGATGATAGGGTGTTTGAGAGAGACGGTGCTAAGGTGGTAGTGGATGATGTATCCCTGGAGTACATCAAGGGTTCAACGATAGACTACCACGAGGAGCTCATCAGGTCAGCGTTCAGTGTCATTGATAACCCTGGAGCAGAGATGGGTTGTTCCTGTGGTGCGTCGTTCTCTTTCAAACTCTGACATTCTGAAAGTAAGCCAAGATAAAAACTGTTATAAGACCTTCAGTGTTAGCATGACGTCTTCAAGAATTTATTTTCAAGCTATATATATATTGGATGTTATCAGCTCAGATTTTACATGTGTGCATAAAGACGAGAATAAGGACAATGGCTTCTTGTTTAGCACCAGTAATCTCCTCTGCCTGGCGTTCCAGAAACTTGCTCCAAAATTGTCTCACGCATATTATATATTCAGCATCGATGATTAACTCCTGGGTAAGAAACTTGATTTGATCTGCAGTGAGTTACAATATAGAGCTCCTAAATAAAAGCAAAAGATGACCGACAATAAGTTCTAACTTAACTATCTGTCATTATTATAGGAGCTGCAGAGGACTTAATATGATCTGTATAATACGATCACTACAGGTGGTTAAACATCAAGTTATGCTATCCTTCAGAACTTGAGACCCCCTTGCTCTAACTCTAATACAAAGCCATGTACTCACATAAAGTGTTGAAAATTTACATTCATGCATCTTGCCTACAAAGGTTCAAAGCACAAAGTACTTGTATGTAGACTAGAAGCACATCTTTTTCTGTTATTATTTAAGGTCAGATATGATTATATAACAAAATGTAAGTTTCATTAAATTCATCGATCCAAAGTCTTACTCCTAACTTCTTGATTTTCAAGCTACAATATATGATATTCGATTCCAATTGTTCGGTGTTAACTTTATATAAGGATCATCATCATATTCATTATATTTCCAGTATTTCATAATATTTGTGGTTTACAATTACCCGCATACCAAGCTTGATTTTGGGATAAACTCATGAGTAATATCGACATATCTACACATATGCTGTATAATAATGCTGTACCCAACTAGTTTCATATTGTTTTGTTGAACTTACAAATGTATAAGTAACCAGATAAGTTTGCCAAGGCCAGTAGGTGTAAAGTGTGGAATTTCATATCAGCCTTGTTATGACACACAAGTCGCATGATATTATTAAAATGACAAGAATTTATTGTGAATTATATCACAAAGCAAACTTTGGAAGTTGAGGTTATAAAATGTTCACCACCAATTTGGAAACTGCAATATTATATGCAAAAGTTATGAGGCTTTACTCCCATTGTTAGAATGCAATTTTATTATAATGGGATGATAAGCCAAGATGAAACAACTGGCACATCCATCTAGATATGCCAGTTATTTTAAAGTGCATGTAGTATTCTTTTTTAGAAGAACATCTTCAATTGATGTTGCTTGTTAATCTCAATAATAATATCTATTTCATTTAGTTTCTAAATTGCAAAGTAACATTACTTCAGTTATGAAAGGTACTATCTTACATTTAAATTGAACAGAGCAATTTAATTCAAAACTCAGATGTGTAACATGCAGGTGTCATGTGCAACGGGGAAACAAATACCAAGTAAAATATTTCAACTAAACAAGTACAATGAATTTTTGTGCAATTTAGTTTAAAACTTTACAGATACTTCAAGGTTAACAAAATCAAATTAAACGTTTAAATATATTCCAAATATCCAAATATATTACCAATTTAAATCATAATCTATATGCACTTCTCATGGAAATTTCATCTTGGGGTATTGAGATTCAAAGACATACATGTATGAAATGCATATTGTAGGGAAGATTAATATACTTGTTGTAAGTGAATAATAATATTTCCAAAATGGAAAGTTAATGCATGACACAATTTGTGATTGAGCAGTTAAAGTCAGCTGTTGCAAT	S. purpuratus

mRNAs (5)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_041612502 >XM_041612502\|>XM_041612502.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus iron-sulfur cluster assembly 2 homolog, mitochondrial-like (LOC121418569), mRNA CTGAATTTACAGGAACCGGAAGTTGTGGCCGAAGTTGTGCTGTATTATGCAATTATGACAAGAACAAAAT GTGAATATTCTTAATCAAATTCTCGAGCGAGAAAGCGACTTAAAATGGCTGCATGTAGTTACCGATTGAT GAGCACTTTCACAGGGGCTTGTAGACGTTCGTCATCAGTGCTAACCCGTAACAGAATTCAGCAATGGAAA GCACCCTCAACCAGTGTATCTAGGATTCAATTCAAATCGACAGGAGCCGAAGTAAAAGAATCAAACCAAC CTGACATCAAATTGAGTGATAGCTGTGTAAAGCAATTGCACAAGCTTGGAGAGGACAACAAGTTTCTGAG GATCCTTGTTGAAGGAGGAGGATGTTCTGGTTTTCAGTACAAATTTGAATTGGATTCTGAAATGACAGAT GATGATAGGGTGTTTGAGAGAGACGGTGCTAAGGTAGTAGTGGATGATGTATCATTAGAATACATCAAGG GTTCAACCATAGACTACCATGAAGAGCTCATCAGGTCGGCCTTTAGGGTGATGGATAATCCTGGAGCAGA GATGGGCTGTTCCTGCGGCGCTTCGTTCTCTTTCAAACTCTGACAACCCCCCCCCCCAATAAACTGTTGG AAGGATTTCAGTGTGATGTCTTCAAGAAATTAGGATCACAATGGATTGTTATCATCTAATATATTAATGT GTGAATGGGATCCATAGCATTGAGAGTAATGGTTTCTTGGAAATCACCACTGCCCGCCACGTTCTGTCTG TGCTCCTAGAACTTGTTCTGATTCATGTGATCCACTATACACTGTACATAATCCAACAGGCTAGATTGCC CTGCATGTCGGCTTACCTGCATTCATCAGAAAATGTGGTTTAACCCATTTCCTATTCAGTTTTGATGTGA TGTCATCTCCACAGTGAACTGTGAAACATTTGAAAACCCACCATGAAGTTCAATTTAAAAATGTTGTGTG CAGCAATGAAGAATGAAGTTGTATTTTTAAGTGAAATATTTAGACACTAGATCAATATTTGTGCAATGTA GATAAAGGAGACTTAAAGATATCAGTTACTTGTACAAGGAGAAAAAATTGCATGGAGTCTCTGGGTGATT TAGCCCTGGAAATGATAAAAAAAATAGCCCTGAAAATCCCAATGCACTGCAGTGTTATTATATCTAATGC AGATTTGAAAGTAGCCCCTAAAAATAATACAAAAAACTAACATTTTGTTCATTTTACCTGCCTTCTATCT TATGTTTGTTGAGCATGCAATAAGCATGCAATTGCTTATTGCCTTGAATTCTTCTACTACTATAGTATCA GGGATACTCATGAATAGAGGCTCACCCCCGGTTTTTGCTGTTCTTATCTTTAATGGCATTCATTGTATAT TTTTTTACTTTTTATTTGCAGGCAATATGACCTGATGTTGGCAATTATCCTGTTGCTTATGTACATGTAC ATG	L. variegatus
	JT120036 >JT120036\|>JT120036.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.265084.1 mRNA sequence GCACAGTGCATGTTACGTGTGCAATGTAATGCAATGGTGAAATTATGCGCGAGAGAGAGAGTCAATGCGC CATAAAATAATACTGTCATTGCATTAGATGATGTGAATGTCGTTGGAAAAGCAAGTTAAAATGGCAGCAT GTGGTTACCGATTGATGAGCACTCTCACAGGGGCTTGCAGACGTTCATCTGTAATAATGCATAGCAGGAC TCAAGCATTGAAGTGTGCCCCAACCACTGGATCTAAGACTCAGCTAATGTCAACAGGAGCAGAAGCACAA GAATCAACTCAACCTGAGCTCAAACTGAGTGATAGCTGTGTTAAGCAACTGCACAAACTCGGAGAGGACA AAGAGTTTCTTAGGATTCTTGTTGAAGGAGGAGGATGTTCAGGCTTCCAATACAAGTTTGAAATGGATTC AGAGATGACAGAAGATGATAGGGTGTTTGAGAGAGACGGTGCTAAGGTTGTAGTGGATGATGTATCCCTG GAGTACATCAAGGGTTCAACGATAGACTACCATGAGGAGCTCATCAGGTCAGCCTTCAGTGTCATAGATA ACCCAGGAGCAGAGATGGGTTGTTCCTGCGGTGCGTCCTTCTCTTTCAAACTCTGACGTTCTGAAAGTAA GCCCAGATAAAAACTGTTTTAAGACCTTCAGTGTTAGCATGACGTCTTCAAGAATTAATTTTTGAGCAAT GTATGTTGAATGTTTCAAGATCAGCTTAAATTTACATGCGTG	S. purpuratus
	XM_003730577 >XM_003730577\|>XM_003730577.3 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus iron-sulfur cluster assembly 2 homolog, mitochondrial (LOC578588), mRNA CGCGAGAGAGAGAGTCGATGCATAAAATAATACTGTCATCAGATGATGTGAATGTCGCTCAAAAAACAAG TTAAAATGGCAGCATGTGGTTACAGATTGATGGGCACTCTCATAGGTGCTTGCAGACGTTCATCTGTAAT AATGCATAACAGGACTCAAGCATTGAAGTGTGCCCCAACCACTGGATCTAAGACTCAGCTAATGTCAACA GGAGCAGAAGCACAAGAATCAACTCAACCTGAGCTCAAACTGAGTGATAGCTGTGTTAAGCAACTGCACA AACTCGGAGAGGACAAAGAGTTTCTTAGGATTCTTGTTGAAGGAGGAGGATGTTCAGGCTTCCAATACAA GTTTGAAATGGATTCAGAGATGACAGACGATGATAGGGTGTTTGAGAGAGACGGTGCTAAGGTGGTAGTG GATGATGTATCCCTGGAGTACATCAAGGGTTCAACGATAGACTACCACGAGGAGCTCATCAGGTCAGCGT TCAGTGTCATTGATAACCCTGGAGCAGAGATGGGTTGTTCCTGTGGTGCGTCGTTCTCTTTCAAACTCTG ACATTCTGAAAGTAAGCCAAGATAAAAACTGTTATAAGACCTTCAGTGTTAGCATGACGTCTTCAAGAAT TTATTTTCAAGCTATATATATATTGGATGTTATCAGCTCAGATTTTACATGTGTGCATAAAGACGAGAAT AAGGACAATGGCTTCTTGTTTAGCACCAGTAATCTCCTCTGCCTGGCGTTCCAGAAACTTGCTCCAAAAT TGTCTCACGCATATTATATATTCAGCATCGATGATTAACTCCTGGGTAAGAAACTTGATTTGATCTGCAG TGAGTTACAATATAGAGCTCCTAAATAAAAGCAAAAGATGACCGACAATAAGTTCTAACTTAACTATCTG TCATTATTATAGGAGCTGCAGAGGACTTAATATGATCTGTATAATACGATCACTACAGGTGGTTAAACAT CAAGTTATGCTATCCTTCAGAACTTGAGACCCCCTTGCTCTAACTCTAATACAAAGCCATGTACTCACAT AAAGTGTTGAAAATTTACATTCATGCATCTTGCCTACAAAGGTTCAAAGCACAAAGTACTTGTATGTAGA CTAGAAGCACATCTTTTTCTGTTATTATTTAAGGTCAGATATGATTATATAACAAAATGTAAGTTTCATT AAATTCATCGATCCAAAGTCTTACTCCTAACTTCTTGATTTTCAAGCTACAATATATGATATTCGATTCC AATTGTTCGGTGTTAACTTTATATAAGGATCATCATCATATTCATTATATTTCCAGTATTTCATAATATT TGTGGTTTACAATTACCCGCATACCAAGCTTGATTTTGGGATAAACTCATGAGTAATATCGACATATCTA CACATATGCTGTATAATAATGCTGTACCCAACTAGTTTCATATTGTTTTGTTGAACTTACAAATGTATAA GTAACCAGATAAGTTTGCCAAGGCCAGTAGGTGTAAAGTGTGGAATTTCATATCAGCCTTGTTATGACAC ACAAGTCGCATGATATTATTAAAATGACAAGAATTTATTGTGAATTATATCACAAAGCAAACTTTGGAAG TTGAGGTTATAAAATGTTCACCACCAATTTGGAAACTGCAATATTATATGCAAAAGTTATGAGGCTTTAC TCCCATTGTTAGAATGCAATTTTATTATAATGGGATGATAAGCCAAGATGAAACAACTGGCACATCCATC TAGATATGCCAGTTATTTTAAAGTGCATGTAGTATTCTTTTTTAGAAGAACATCTTCAATTGATGTTGCT TGTTAATCTCAATAATAATATCTATTTCATTTAGTTTCTAAATTGCAAAGTAACATTACTTCAGTTATGA AAGGTACTATCTTACATTTAAATTGAACAGAGCAATTTAATTCAAAACTCAGATGTGTAACATGCAGGTG TCATGTGCAACGGGGAAACAAATACCAAGTAAAATATTTCAACTAAACAAGTACAATGAATTTTTGTGCA ATTTAGTTTAAAACTTTACAGATACTTCAAGGTTAACAAAATCAAATTAAACGTTTAAATATATTCCAAA TATCCAAATATATTACCAATTTAAATCATAATCTATATGCACTTCTCATGGAAATTTCATCTTGGGGTAT TGAGATTCAAAGACATACATGTATGAAATGCATATTGTAGGGAAGATTAATATACTTGTTGTAAGTGAAT AATAATATTTCCAAAATGGAAAGTTAATGCATGACACAATTTGTGATTGAGCAGTTAAAGTCAGCTGTTG CAAT	S. purpuratus
	JT111910 >JT111910\|>JT111910.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.265084.0 mRNA sequence GAGAGAGAGAGTCGATGCATAAAATAATACTGTCATCAGATGATGTGAATGTCGCTCAAAAAACAAGTTA AAATGGCAGCATGTGGTTACAGATTGATGGGCACTCTCATAGGTGCTTGCAGACGTTCATCTGTAATAAT GCATAACAGGACTCAAGCATTGAAGTGTGCCCCAACCACTGGATCTAAGACTCAGCTAATGTCAACAGGA GCAGAAGCACAAGAATCAACTCAACCTGAGCTCAAACTGAGTGATAGCTGTGTTAAGCAACTGCACAAAC TCGGAGAGGACAAAGAGTTTCTTAGGATTCTTGTTGAAGGAGGAGGATGTTCAGGCTTCCAATACAAGTT TGAAATGGATTCAGAGATGACAGAAGATGATAGGGTGTTTGAGAGAGACGGTGCTAAGGTTGTAGTGGAT GATGTATCCCTGGAGTACATCAAGGGTTCAACGATAGACTACCATGAGGAGCTCATCAGGTCAGCCTTCA GTGTCATAGATAACCCAGGAGCAGAGATGGGTTGTTCCTGCGGTGCGTCCTTCTCTTTCAAACTCTGACG TTCTGAAAGTAAGCCCAGATAAAAACTGTTTTAAGACCTTCAGTGTTAGCATGACGTCTTCAAGAATTAA TTTTTGAGCAATGTATGTTGAATGTTTCAAGATCAGCTTAAATTTACATGCGTG	S. purpuratus
	XM_022234866 >XM_022234866\|PREDICTED: Acanthaster planci iron-sulfur cluster assembly 2 homolog, mitochondrial-like (LOC110979246), mRNA GCGTGTGGCACGTACGTACAGCTGCGATGCTCGTGGCAAAAGCGTAGCACGCATTACGATTTCATAACAAACAAGATGGCTGCGTACATGATGAAAAGGTGTTGGAGCTTGGGACGTGCCTTGAGAGGCCAGTTGCACCATCAAGTTTGTCAGAAGGGTTCGTACCCAAAACACTTCTCCGTGAGCACAGAGGCAGTAGCTACAGAAGACTCCATCAACATCACTGACAGTTGTGTCAAGCAACTATCCAGGATTAATGATGGGGATAAGCATCTCAGGGTGCTTGTGGAGGGAGGCGGTTGCTCCGGCTTTCAGTGCAAGTTCCAGCTCGACTCACAAGAAAATGTCACAGGGGAAGACAGGGTGTTCGAGAGAGATGGTGTCAAGGTGATAGTGGATGAGGTGTCCCTGGGGTACATCAAGGGTGCCACGGTGGACTACCACGAGGAGTTGATTCGTTCGGCCTTCAGGGTCATCAATATCCCCATGGCCGAGAACGGCTGTTCATGTGGCGTTTCCTTCTCTCTCAAGTTATAACGAGTGGTGTGTGAAAAGTTTGCCAAAAGAGAAGTGTCAGTGACCGCCTACCTGCTGGACTTCAGTGATGAGTTTAGCCGTGCACTATTTGTTTCCCTGCTTGGTGTGCTTGCTAGTCTCTCCACCAACCTGTCTTGGCAAGAAGTCTTTGGACTTGGTGAACTCCAGCCAAATGAAGTCTTCATTGTTGAAGTGCAGGCTCAACAGGAGTTAAGTCTTCAAACTGTGTTGACTTGTACTGCTCTGAGTTTACACTCTTTAACATTGACTACTTTTACCAATTTCCAACTTTTCTCATTTTTGTTAAAAAATGTACTCCTAAAAGCAGCATGCTTAAAACTTTAACACATCTCAGTTGCTGTTTTGTACATGTATGTGTAATATAATGTGACTGAGAGGAGAGGTACAAATCTGTAAAATGGATGTGAGAAATATTCATTGACTTAATGAAGGTAAACTGTGAGCATAATTTGCCAGTCACGAGGCTGTTGAATGTGGTACCACTAACAAGCTGACCTGCTGTCATACTGCTCTTGCATGGTTGGAATGGGTAAGGAGTCTAGGAGTTTATTCTGGGTTGAGCATGGAGACAGTACAGGATACCACTGACCAGCCAACAGGGAATGCATCCTGCATTGTGAAGTAAGCATCTTCTGGAGTCTTGATGCATTGCTGCATTGACTACCGAAATAAGTTGAGTCACATGATGAGTTGGCCCATGTACCACTGAATTGCCAAAGAACTCAGTTCTCAATTCTATTAACCCCTTTGCGCCGGGACGTGGATAAAGCCGCCGTAAAAATTGAGATCCTCAGCCCGCTTTTCAGCTATTAT	A. planci

ESTs (0)