rps16 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (13)

Interactants (37)

ECB-GENEPAGE-23094727

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for rps16 - All

Models - Gene (4)

Models - mRNA (1)

mRNAs (9)

ESTs (0)

Models - Gene (4)

Source	Version	Model	Species
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purpuratus
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miniata
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ACAAAACAATTCATCCCGAAACTCTATAACGAAACGTCTTGTAAAGAATCATCGTATAAATTTCAGGGTGTCCACACACAAGAAACGTCGTATAAATAATCATTGTATAAATTCTAGGATGTCCACACACAGAAGGAAGTAATCATGAAACTCTACAGCGAAATGTCGTATAGGTGCACAGTTTGCTACTGCGATCATGAAATGGAAGCGGAAATGAGGTCTCCTTTCGATCGAGGTCACGTTAAGCCCCGCCCAGTTATACCGTTCTAGTTCGACTAGTTATACTACTTACGTCCACACACAACACATTCCGTGATTAGGCATGATTATTTATACGTCGTATAACGAAACGCATCTTTGGGCATCGTTTCGTTATACAACGTTTCGTTATACGATGTATTGTTAGTAAGCGTCCACACACACAATTTCATTGTATAACTATCGTGAAACAGTATAACTATCTCGAAACAGTATAACTATCCCGAAACAGTATAACTAATCACGCCTAATCACGGAAAATGTTGTGTGTGGACACGGGTTTATCTTTGGAAAGTCAGATTACATTTTCTGCCCTCATGTCAGTCTCAAAATGGAGGATTTGTGTATTTTGTTTGTAAAACAATAAATTACATAGATATTTATCAATGAATTCCTTTGTAGTCATTTTCTATGAGAACATGAAATCTGTATCCAATTAATTTTTATTTTGTGATTTCCTTTTCAGCCATCAGGCAAGCTATCTCCAAGTCTCTGGTTGCTTATTACCAGAAGTGTAAGTATTATGTTCAACTATTGTTAAACAGCAGCCAAATATGGCAAGTTAAGCCTCCATTTTAAAAAGTTTATATTTGAGTTGTAGTGGACTATACAGAGCTGCCAAGTAGTACGTTTTTAACGTATTAATACGTTTTTTTGGGGGAAAATACGTCTGTACGTTTTGCTGTGCCAAAATACGTTTTTTGAAAGTTTCGAGTATGGCTGTGCGAACGTGGCCAGCGGCTGGCTGTGAGAACCAGCATATGCATAGTTTTGCTATTGCTTTGTGTTGGCGATTCCTGCAGCGCGCACGCATGTACATTGCACACAATAAAGGGGATGTACACCACTAAAAGACGAGCGCATTTCCCCAGGCCATGCATCCACACGCTAATGACATATCAGTGCACTGCACTACACACACAGTGTCAGTACAAGAAAGTCCCGATCTTACTTCCAAAAATCCATTCCAAAAGCCAAATTTTGCTGTCAAAAATGCGGAATCAGGGCCATATTTCCAAAGCTCACGGGGGTTTAGCCCAGTTTTAATAAACAGCTTCACCCAAAAAGCGCTAAAAATCAAGAAATCAGCGATTTTGTTACCAGTTTTTTCGCCTGTCGCAAGCCCTTCGAGTGTGATGGTAATCATGGTATCTTCAAAAAGCCAAATGAAAAACGAACACCGGACCTGGCCTGCTGATGCATTGACTTTATGTACAAAGTTGATTGCAATTCTAGACTTGCCTTGATTCGACCGCAATGAAGCACCAATAGGTGCCCCAACTTCGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCGGCCGATTTTTTTTTGTCGCTCTTCCGATCCGATACCGATCAAAGGTGCGAGGGTGTCGCTCCGATCTTCCGATCCGATCAGAGCCCCAACTTACAGGGTTAGTAAGTATTATGTTCAACTATTGTTAAACAGCAGCCAAATATGGCAAGTTAAGCCTCCATTTTAAAAAGTTTATATTTGAGTTGTAGTGGACTATATGATGTTTTTGTCATTTCACATTCCTGTACATGATTGTAAATAGCCAGTTGGCTTTTATGTTATTTTTGAGTACCCAATAAAAAAAATTGGGGGGCTACTTTTCAAGCTTGCCTGCATGAAAATAACATTTTAAAATTTCTTTTGCATTGCACTCTATGCAAATTTACGAGGGCTCTTTTCTGATTTTCGGGGGCTGTTTTGTGCATTTCGGGGGCTATTTCGGGGGCTATTTCGCCCCGAGCTCCCGTTTATTTTTTTCACTGTTGTTAAAAGTGTTGGGCAAAGGTATCATTGACCCAGGGCTTAAATTAATCCAAGGCCACCAATGCCATGGCCGTGGATGCCCTCACTATGAACATGACAGACAAAGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTATATTTTGTCCGCTTTCTTTGTCCGTCATATTCATATTTCCTTTTAATTGGCCTCAATGCCCCTTTCATTGGCCTTGGAGATTTTTTGTGCCCTTTCTAATTCTTCCTATTTGTGCTGTAATATATATAGGAATGTGCCCTGCAGAATAGTGGTCTTGCCCTAAAATTATTGAAATTTAAGGGCTGTTGACCAACATGGTTTGAACATGGCATGGACATTAATTCAGTTCTCTGATGAGGAGACGAGTGCTATTATTTGAAATTTACAAAATATTGATTCTATCTGTCTAGATAGCAGGGAATATTTTTCCTGGTACCGCAATGCAATTTGCTATGCATTTGTTCCATAGAAATGTACAGAATTTCATTTGAAATATTTATCCATCAGCTGAAATGGCTAATCAAAAAATTGAGGAAAATTATTCCCTGGATAGTGTATAAAGTACAGAGATGTGAGGTGCAATTGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGTTGGTTTACTATAACGTTTGGGGACATGACTTTAAGGTGAAAGTTTGATATTTGAGTCTTACAGATAAAGTTAGAGTTCTGGTCATGCGGTTGTAATGTGAAAGAAACTGTGAAATCGTTCAGAAAAAGTTGATCATGTAGTATCAATAATGTAGTATCTATAAGTATTGGTGTGTACTGCAAGGTTCTGGAGTCTTCGAAATGATAAATTTGGTCCAGTCTTGGTAAAGTAAAAAGCACTGTACACAGAAAGATGTATATGGGACTACACAAACATGTGGCATAAATTGTCATATTTAGAATTTGAAGAGTCATGCTTTTCAGGGAACATTTTTTCGCTGATGTTCTTCCACACTTGCATAATAACAATGATAACGCTCACAAATTATTTGTCACCTCGCCCCAGAACTCGACCTTCTCTTTATAAACTGTAATGTTATTTTTACTATTTTTGTTGTTGGTCTCACCTATATTTGACATGGATAATTGCTTTGCTCACACATAGAATTTTGTTTTATTTTGTCATTCTGCAGTCGTTGACGAAGCCTCCAAGAAAGAGATCAAGGACATCCTGATCCAATACGACCGAGCGCTCCTGGTCGCTGATCCCAGGCGCTGCGAGCCCAAGAAGTTTGGTGGTCCAGGAGCCCGTGCCCGCTACCAGAAGTCCTACCGTTAAGACCAGGTCTAGGAGGGATGGTGGTGATGCTAGTACCATAGGGGGGACACTGGTCCAAGATCTTGTGAATAAGGTCCTGGACTACGGACACACTCATCGGCTGAGGGGGGGTTTCATTTGCTATGTTCTCATGGCAGCAATTGTGGTTGCAATGTATGACATCATGGAATAAATACATCATGTAAATTCACATAATAGGTTTAGCTTGTGTATATTGTCTGGCTCCGATTTGAC	S. purpuratus

Models - mRNA (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_774944.5 >XM_774944.5 CTAGCTATCGTTTGACCTCACCACGTGAAACCCGTTCAACTTCCTTTTCAGGTCAACCACAGACAGAGAACAATGGCGGAAAAAGAGAAGACACCAGCCCAATCCGTGCAAGTGTTCGGCAGAAAGAAAACGGCCACAGCTGTTGCCCATTGCAAGCAAGGCAATGGACTACTAAAGGTCAACGGTCACCCTCTGGAGCTCGTCCAGCCTCTGGCCCTCCAATCAAAGCTTATGGAGCCTGTGTATCTCCTGGGTAAGGACCGCTTCTCTGCTGTAGACATCAGGGTGCGAGTCAAGGGAGGTGGACGTATCGCACAGATCTATGCCATCAGGCAAGCTATCTCCAAGTCTCTGGTTGCTTATTACCAGAAGTTCGTTGACGAAGCCTCCAAGAAAGAGATCAAGGACATCCTGATCCAATACGACCGAGCGCTCCTGGTCGCTGATCCCAGGCGCTGCGAGCCCAAGAAGTTTGGTGGTCCAGGAGCCCGTGCCCGCTACCAGAAGTCCTACCGTTAAGACCAGGTCTAGGAGGGATGGTGGTGATGCTAGTACCATAGGGGGGACACTGGTCCAAGATCTTGTGAATAAGGTCCTGGACTACGGACACACTCATCGGCTGAGGGGGGGTTTCATTTGCTATGTTCTCATGGCAGCAATTGTGGTTGCAATGTATGACATCATGGAATAAATACATCATGTAAATTCA	S. purpuratus

mRNAs (9)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_774944 >XM_774944\|>XM_774944.5 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus 40S ribosomal protein S16 (LOC577040), mRNA CTAGCTATCGTTTGACCTCACCACGTGAAACCCGTTCAACTTCCTTTTCAGGTCAACCACAGACAGAGAA CAATGGCGGAAAAAGAGAAGACACCAGCCCAATCCGTGCAAGTGTTCGGCAGAAAGAAAACGGCCACAGC TGTTGCCCATTGCAAGCAAGGCAATGGACTACTAAAGGTCAACGGTCACCCTCTGGAGCTCGTCCAGCCT CTGGCCCTCCAATCAAAGCTTATGGAGCCTGTGTATCTCCTGGGTAAGGACCGCTTCTCTGCTGTAGACA TCAGGGTGCGAGTCAAGGGAGGTGGACGTATCGCACAGATCTATGCCATCAGGCAAGCTATCTCCAAGTC TCTGGTTGCTTATTACCAGAAGTTCGTTGACGAAGCCTCCAAGAAAGAGATCAAGGACATCCTGATCCAA TACGACCGAGCGCTCCTGGTCGCTGATCCCAGGCGCTGCGAGCCCAAGAAGTTTGGTGGTCCAGGAGCCC GTGCCCGCTACCAGAAGTCCTACCGTTAAGACCAGGTCTAGGAGGGATGGTGGTGATGCTAGTACCATAG GGGGGACACTGGTCCAAGATCTTGTGAATAAGGTCCTGGACTACGGACACACTCATCGGCTGAGGGGGGG TTTCATTTGCTATGTTCTCATGGCAGCAATTGTGGTTGCAATGTATGACATCATGGAATAAATACATCAT GTAAATTCA	S. purpuratus
	JT094847 >JT094847\|>JT094847.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.374624.1 mRNA sequence TGTATGATGTATAATTTTTTTCATTTGTACGGAATGAATGCAATAAAGAATACTTTGATCTAGATCTATA TCAAAGCCCTCCCCTCCCCCTCCGATCCCCGCGCCCTCCAGCCCCCTTCCCCCGATACCTCTATATCGGA ATAATGTCAGGTTGACTCTAGCTATCGTTTGACCCCACCACGTGAAACCCGTTCAACTTCCTTTTCAGGT CAACCACAGACAGAGAACAATGGCGGAAAAAGAGAAGACACCAGCCCAATCCGTGCAAGTGTTCGGCCGA AAGAAAACGGCCACAGCTGTTGCCCATTGCAAGCAAGGCAATGGACTACTAAAGGTCAACGGTCACCCTC TGGAGCTCGTCCAGCCTCTGGCCCTCCAATCAAAGCTTATGGAGCCTGTGTATCTCCTGGGTAAGGACCG CTTCTCTGCTGTAGACATCAGGGTGCGAGTCAAGGGAGGTGGACGTATCGCACAGATCTATGCCATCAGG CAAGCTATCTCCAAGTCTCTGGTTGCTTATTACCAGAAGTTCGTTGACGAAGCCTCCAAGAAAGAGATCA AGGACATCCTGATCCAATACGACCGAGCGCTCCTGGTCGCTGATCCCAGGCGCTGCGAGCCCAAGAAGTT TGGTGGTCCAGGAGCCCGTGCCCGCTACCAGAAGTCCTACCGTTAAGACCAGGTCTAGGAGGGATGGTGG TGATGCTAGTACCATAGGGGGGACACTGGTCCAAGATCTTGTGAATAAGGTCCTGGACTACGGACACACT CATCGGCTGAGGGGGGGTTTCATTTGCTATGTTCTCATGGCAGCAATTGTGGTTGCAATGTATGACATCA TGGAATAAATACATCATGTAAATTCACATAATAGGTTTAGCTTGTGTATATTGTCTGGCTCCGATTTGAC	S. purpuratus
	JT102965 >JT102965\|>JT102965.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.374624.0 mRNA sequence CAGAGGTACACGATGAATGAAATAATCTATAATAAATTGACTTATTATTGTAAATATCCACTATCATTAT GACAAAATCGCCTTTTAAACACATCTCTTAACATTACCCTTGTTATTTCTCTTGCTATGATACAGAACAA TGGCGGAAAAAGAGAAGACACCAGCCCAATCCGTGCAAGTGTTCGGCCGAAAGAAAACGGCCACAGCTGT TGCCCATTGCAAGCAAGGCAATGGACTACTAAAGGTCAACGGTCACCCTCTGGAGCTCGTCCAGCCTCTG GCCCTCCAATCAAAGCTTATGGAGCCTGTGTATCTCCTGGGTAAGGACCGCTTCTCTGCTGTAGACATCA GGGTGCGAGTCAAGGGAGGTGGACGTATCGCACAGATCTATGCCATCAGGCAAGCTATCTCCAAGTCTCT GGTTGCTTATTACCAGAAGTTCGTTGACGAAGCCTCCAAGAAAGAGATCAAGGACATCCTGATCCAATAC GACCGAGCGCTCCTGGTCGCTGATCCCAGGCGCTGCGAGCCCAAGAAGTTTGGTGGTCCAGGAGCCCGTG CCCGCTACCAGAAGTCCTACCGTTAAGACCAGGTCTAGGAGGGATGGTGGTGATGCTAGTACCATAGGGG GGACACTGGTCCAAGATCTTGTGAATAAGGTCCTGGACTACGGACACACTCATCGGCTGAGGGGGGGTTT CATTTGCTATGTTCTCATGGCAGCAATTGTGGTTGCAATGTATGACATCATGGAATAAATACATCATGTA AATTCACATAATAGGTTTAGCTTGTGTATATTGTCTGGCTCCGATTTGAC	S. purpuratus
	GHFM01023698 >GHFM01023698\| -	S. purpuratus
	XM_038195898 >XM_038195898\|>XM_038195898.1 PREDICTED: Patiria miniata 40S ribosomal protein S16 (LOC119724715), mRNA ATTCAATTATCGATCAAAATTTTTGTAATGTTAGGTATTGACCTAAGTCAGAGAAACCCGTCACGCAAAC GACCTCTTTTTGCTTTTCACACACGAAAGAACCATGTCTCAGAAGACTCCGGTTGAGTCGGTTCAAGTTT TCGGGCGCAAGAAAACTGCCACGGCAGTTGCCCACTGCAAGCGTGGTAAGGGAGTCCTGCGAGTGAATGG CAGACCACTGGAGATGATTGAGCCTCAAGTCCTCAAGTACAAGTTGATGGAGCCCCTCCTTCTGCTTGGC AAGGAGCGCTTTGGAGGCGTTGACATCCGAGTCCGGGTCAAGGGAGGTGGACGCATCGCTCAGATCTATG CCATCAGACAGGCTATCTCCAAGTCTCTGGTCTCCTACTACCAGAAGTATGTTGACGAAGCCTCCAAAAA GGAGATCAAGGACATCTTGATCCAATACGACAGATCGCTGCTGGTGGCCGATCCTAGACGATGCGAGCCC AAGAAGTTTGGTGGACCAGGACCCCGCGCTCGCTACCAGAAATCTTACCGTTAACATGTTTGTCTCGTGT GCGGCTTCTCACATGGAATTTCCAATCATTTCTCTTTGGTTATCATGCTGGGAGTTCTATCATTGAACAA CGTTTAATATTCCAAAACTATTCGCTGTTTTGGAATCTGATGTCACAAAACTCAAAAAGTTGACTTTCAA GTGTTGTCATCCGGTCAAAAGTGTGTAAGCAAACAATAATGTTGTAATAAACAGTGGGGGAAAAAAAGTA TAAA	P. miniata
	GHJN010051865 >GHJN010051865\| -	P. miniata
	XM_022227928 >XM_022227928\|PREDICTED: Acanthaster planci 40S ribosomal protein S16 (LOC110975432), transcript variant X2, mRNA TCGACCTCTTTCGGCTTCACACACACACTGGATATGTATGAACCATGTCTCAGAAAGCCCCAGTAGAGTCGGTTCAAGTTTTCGGGCGTAAGAAAACTGCCACAGCAGTCGCCCACTGCAAGCGAGGCAAGGGTGTGTTACGAGTGAATGGCAAACCACTGGAGATGATTGAGCCAAGAGTGCTCAAGTACAAGTTGATGGAGCCTGTTCTTTTACTGGGCAAGGAACGATTCCAAGGCGTTGACATCAGGGTACGTGTCAAAGGAGGAGGTCGTATTGCTCAGATCTATGCCATCAGACAGGCCATCTCCAAGGCTTTGGTCTCCTACTACCAGAAGTATGTTGACGAGGCTTCAAAGAAAGAGATACGAGACATCCTGATCCAGTACGACAGATCTCTCTTGGTTGCCGATCCCAGGCGATGTGAGCCCAAGAAATTCGGTGGACCAGGAGCTCGTGCTCGCTACCAGAAATCTTACCGTTAAGATGTCAAGATACTCTGGAGCAGTTGTTAACTGCCCATGGGGGGTTGCCACGATATTCCGTTTTCCCATTGAACCCTGACGAATGTGATTCCAAACCACTCGTTTGTTTTAAACCCAACTTCATGAAAGTGAGAACTTTATTTTCAAGCATCACTCACTGGCCAAAAAGTGTGGAAGCAACTATTTACTTGTAATTCTTAATAAAACTAAAGTGGACAAAATGTA	A. planci
	XM_022227929 >XM_022227929\|PREDICTED: Acanthaster planci 40S ribosomal protein S16 (LOC110975432), transcript variant X3, mRNA ACCTCTTTCGGCTTCACACACACACTGGAACCATGTCTCAGAAAGCCCCAGTAGAGTCGGTTCAAGTTTTCGGGCGTAAGAAAACTGCCACAGCAGTCGCCCACTGCAAGCGAGGCAAGGGTGTGTTACGAGTGAATGGCAAACCACTGGAGATGATTGAGCCAAGAGTGCTCAAGTACAAGTTGATGGAGCCTGTTCTTTTACTGGGCAAGGAACGATTCCAAGGCGTTGACATCAGGGTACGTGTCAAAGGAGGAGGTCGTATTGCTCAGATCTATGCCATCAGACAGGCCATCTCCAAGGCTTTGGTCTCCTACTACCAGAAGTATGTTGACGAGGCTTCAAAGAAAGAGATACGAGACATCCTGATCCAGTACGACAGATCTCTCTTGGTTGCCGATCCCAGGCGATGTGAGCCCAAGAAATTCGGTGGACCAGGAGCTCGTGCTCGCTACCAGAAATCTTACCGTTAAGATGTCAAGATACTCTGGAGCAGTTGTTAACTGCCCATGGGGGGTTGCCACGATATTCCGTTTTCCCATTGAACCCTGACGAATGTGATTCCAAACCACTCGTTTGTTTTAAACCCAACTTCATGAAAGTGAGAACTTTATTTTCAAGCATCACTCACTGGCCAAAAAGTGTGGAAGCAACTATTTACTTGTAATTCTTAATAAAACTAAAGTGGACAAAATGTA	A. planci
	XM_022227927 >XM_022227927\|PREDICTED: Acanthaster planci 40S ribosomal protein S16 (LOC110975432), transcript variant X1, mRNA GAAACCCGTCACGTCGTCGACCTCTTTCGGCTTCACACACACACTGGATATAACCATGTCTCAGAAAGCCCCAGTAGAGTCGGTTCAAGTTTTCGGGCGTAAGAAAACTGCCACAGCAGTCGCCCACTGCAAGCGAGGCAAGGGTGTGTTACGAGTGAATGGCAAACCACTGGAGATGATTGAGCCAAGAGTGCTCAAGTACAAGTTGATGGAGCCTGTTCTTTTACTGGGCAAGGAACGATTCCAAGGCGTTGACATCAGGGTACGTGTCAAAGGAGGAGGTCGTATTGCTCAGATCTATGCCATCAGACAGGCCATCTCCAAGGCTTTGGTCTCCTACTACCAGAAGTATGTTGACGAGGCTTCAAAGAAAGAGATACGAGACATCCTGATCCAGTACGACAGATCTCTCTTGGTTGCCGATCCCAGGCGATGTGAGCCCAAGAAATTCGGTGGACCAGGAGCTCGTGCTCGCTACCAGAAATCTTACCGTTAAGATGTCAAGATACTCTGGAGCAGTTGTTAACTGCCCATGGGGGGTTGCCACGATATTCCGTTTTCCCATTGAACCCTGACGAATGTGATTCCAAACCACTCGTTTGTTTTAAACCCAACTTCATGAAAGTGAGAACTTTATTTTCAAGCATCACTCACTGGCCAAAAAGTGTGGAAGCAACTATTTACTTGTAATTCTTAATAAAACTAAAGTGGACAAAATGTA	A. planci

ESTs (0)